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鸭肠炎病毒UL41蛋白的分子特征gydF4y2Ba

摘要gydF4y2Ba

背景gydF4y2Ba

鸭肠炎病毒(DEV)属于甲疱疹病毒亚科,关于DEV UL41基因的信息有限。gydF4y2Ba

方法gydF4y2Ba

将DEV UL41基因克隆到pET32a(+)载体中,在原核表达系统中表达。对细菌表达的UL41-His融合蛋白进行抗血清培养,以作进一步实验。分别通过RT-qPCR和western blotting检测不同时间点dev -感染细胞中UL41蛋白的转录和表达水平。利用蔗糖梯度离心纯化DEV病毒粒子,并通过质谱分析鉴定蛋白含量。我们通过药理学试验确认了DEV UL41基因动力学类。采用IFA分析pUL41的胞内定位。gydF4y2Ba

结果gydF4y2Ba

构建了高表达76.0 kDa融合蛋白的重组表达质粒pET-32a(+)-UL41gydF4y2Ba大肠杆菌gydF4y2BaBL21 (DE3)经0.2 mM IPTG在30°C诱导10 h后,生成特异性的小鼠抗ul41蛋白多克隆抗体。RT-qPCR和western blot分析显示,UL41转录数在36 hpi达到峰值,蛋白表达在48 hpi达到峰值。药理学试验表明UL41为γ2基因。质谱分析表明,pUL41是一种病毒粒子组分。IFA结果显示,pUL41分布在dev感染的细胞中,但仅分布在转染细胞的细胞质中。DEV pUL47将pUL41转位到DEF细胞核;这种易位依赖于预测的pUL47 NLS信号(40-50 aa和768-777 aa)。gydF4y2Ba

结论gydF4y2Ba

DEV UL41是一个编码病毒粒子结构蛋白的γ2基因,pUL41定位于整个DEV感染的细胞,但只定位于转染细胞的细胞质。pUL41不能自主定位到细胞核,因为这种核定位依赖于预测的DEV pUL47 NLS信号(40-50 aa和768-777 aa)。gydF4y2Ba

背景gydF4y2Ba

鸭鼠疫(或鸭病毒性肠炎)是由鸭肠炎病毒(DEV)引起的水禽(所有年龄和种类的鸭、鹅和天鹅)的一种急性、发热、脓毒性疾病,由于相关的高死亡率和鸭蛋产量下降,导致全球禽业遭受重大经济损失[gydF4y2Ba1gydF4y2Ba,gydF4y2Ba2gydF4y2Ba,gydF4y2Ba3.gydF4y2Ba,gydF4y2Ba4gydF4y2Ba,gydF4y2Ba5gydF4y2Ba].DEV属于Alphaherpesvirinae亚家族,其基因组由线性双链DNA组成,包括一个独特的长(UL)区域、一个独特的短(US)区域、一个独特的短内部重复(IRS)区域和一个独特的短末端重复(TRS)区域。基因组排列模式为UL-IRS-US-TRS [gydF4y2Ba6gydF4y2Ba].gydF4y2Ba

UL41基因在阿尔法疱疹病毒中高度保守[gydF4y2Ba7gydF4y2Ba,gydF4y2Ba8gydF4y2Ba], ul41编码的蛋白已在其他阿尔法疱疹病毒亚家族成员中被描述,包括牛疱疹病毒1 (BHV-1) [gydF4y2Ba9gydF4y2Ba,gydF4y2Ba10gydF4y2Ba],猴B病毒(机器疱疹病毒1;BV) [gydF4y2Ba11gydF4y2Ba],马疱疹病毒-1 (EHV-1) [gydF4y2Ba12gydF4y2Ba]、伪狂犬病毒[gydF4y2Ba7gydF4y2Ba],以及水痘带状疱疹病毒[gydF4y2Ba13gydF4y2Ba,gydF4y2Ba14gydF4y2Ba].HSV-1病毒粒子宿主关闭蛋白(VHS)是一种晚期(γ2)被膜蛋白,由UL41基因编码并被包装到病毒粒子中;病毒感染所必需的[gydF4y2Ba15gydF4y2Ba,gydF4y2Ba16gydF4y2Ba,gydF4y2Ba17gydF4y2Ba,gydF4y2Ba18gydF4y2Ba,gydF4y2Ba19gydF4y2Ba], VHS被释放到宿主细胞细胞质中,通过其RNase活性选择性地降解细胞mrna,并有助于在感染早期关闭宿主细胞蛋白质合成[gydF4y2Ba20.gydF4y2Ba,gydF4y2Ba21gydF4y2Ba].此外,VHS-RNase活性受到几种HSV蛋白的紧密调控。在感染早期,VHS-RNase首先结合UL47和UL54基因编码的被膜蛋白VP13/14和ICP27, VHS-RNase对mrna的选择性降解受VP13/14的调控。然后,在感染后期,VHS-RNase活性被分别由UL48和UL49基因编码的VP16和VP22中和[gydF4y2Ba21gydF4y2Ba].VHS在BHV-1中的功能[gydF4y2Ba9gydF4y2Ba], bv [gydF4y2Ba10gydF4y2Ba]和EHV-1 [gydF4y2Ba12gydF4y2Ba]可能在这些病毒的机制中起到同样的作用。PRV VHS蛋白也表现出RNase活性,但与HSV-1 VHS蛋白不相同[gydF4y2Ba7gydF4y2Ba,gydF4y2Ba22gydF4y2Ba].VZV开放阅读框17 (ORF17)是一种延迟细胞RNA关闭的晚期非结构蛋白,是VHS蛋白的同源物,但在VZV介导的延迟宿主关闭中没有主要功能[gydF4y2Ba13gydF4y2Ba,gydF4y2Ba14gydF4y2Ba].gydF4y2Ba

一些DEV基因的特征已被报道[gydF4y2Ba23gydF4y2Ba,gydF4y2Ba24gydF4y2Ba,gydF4y2Ba25gydF4y2Ba,gydF4y2Ba26gydF4y2Ba,gydF4y2Ba27gydF4y2Ba,gydF4y2Ba28gydF4y2Ba,gydF4y2Ba29gydF4y2Ba,gydF4y2Ba30.gydF4y2Ba,gydF4y2Ba31gydF4y2Ba,gydF4y2Ba32gydF4y2Ba,gydF4y2Ba33gydF4y2Ba,gydF4y2Ba34gydF4y2Ba,gydF4y2Ba35gydF4y2Ba];然而,关于DEV UL41基因的信息有限。生物信息学分析表明,DEV UL41 ORF全长1494 bp,编码497个氨基酸,分子质量56 kDa,与HSV-1 VHS蛋白同源性31%。在这项研究中,我们利用western blot、实时定量反转录PCR (RT-qPCR)、间接免疫荧光分析(IFAs)、药物测试和质谱分析对DEV ul41编码蛋白(pUL41)进行了鉴定。我们的研究结果将为进一步研究DEV UL41提供指导。gydF4y2Ba

方法gydF4y2Ba

病毒细胞和载体gydF4y2Ba

DEV CHV菌株(基因库:JQ647509.1)在实验室分离并保存[gydF4y2Ba22gydF4y2Ba].gydF4y2Ba

鸭胚成纤维细胞(DEF)在最低必需培养基(MEM;Gibco, Meridian Road Rockford,美国)补充10% (gydF4y2BavgydF4y2Ba/v)胎牛血清(FBS;Gibco,子午路罗克福德,美国)37°C, 5% COgydF4y2Ba2gydF4y2Ba.对于病毒感染,添加添加2%胎牛血清的维持培养基。实验室制备了常用试剂。gydF4y2Ba

重组β-actin质粒[gydF4y2Ba32gydF4y2Ba]和兔抗ul47蛋白多克隆抗体。gydF4y2Ba

重组表达载体的构建gydF4y2Ba

所有引物均采用Primer Premier 5软件设计(见表2)gydF4y2Ba1gydF4y2Ba).野生型DEV UL41 (GenBank: AFC61841.1)编码区使用特异性引物(PgydF4y2Ba1gydF4y2Ba和PgydF4y2Ba2gydF4y2Ba)构建pET-32a(+)-UL41,并在真核质粒pEGFP-C2中使用特异性引物(PgydF4y2Ba3.gydF4y2Ba和PgydF4y2Ba4gydF4y2Ba)创建pEGFP-C2-UL41。野生型DEV UL47 (GenBank:gydF4y2BaAFC61835.1gydF4y2Ba利用特异性引物(PgydF4y2Ba5gydF4y2Ba和PgydF4y2Ba6gydF4y2Ba),创建pcDNA3.1(+)-UL47。接下来,我们构建了真核质粒pcDNA3.1(+)-UL47gydF4y2BaΔ40 - 50gydF4y2Ba和pcDNA3.1 (+) -UL47gydF4y2BaΔ768 - 777,gydF4y2Ba它们分别缺失了DEV ul47编码蛋白(pUL47)的40 - 50个氨基酸和768 - 777个氨基酸(aa)。gydF4y2Ba

表1序列和引物对特性gydF4y2Ba

UL41-his融合蛋白的原核表达gydF4y2Ba大肠杆菌gydF4y2Ba

pET-32a(+)-UL41转化为gydF4y2Ba大肠杆菌gydF4y2BaBL21 (DE3)活性细胞。细菌培养于含有50μg/ml氨苄青霉素的Luria-Bertani (LB)培养基中,37℃。通过添加IPTG诱导蛋白表达(St Louis, MO, USA)。研究了不同诱导浓度(0.1、0.2、0.4、0.6、0.8、1.0和1.2 mM)、诱导时间(2、4、6、8和10 h)和诱导温度(25、30和37℃),以优化条件获得最高水平的UL41蛋白表达[gydF4y2Ba33gydF4y2Ba].IPTG诱导后,在4℃下离心收集不同时间点的细菌,并用超声波中断。同时对病媒控制培养进行了分析。十二烷基硫酸钠-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)以12%的溶解凝胶和5%的堆积凝胶分析所有表达水平。gydF4y2Ba

融合蛋白的纯化及多克隆抗体的制备gydF4y2Ba

通过凝胶和电洗脱纯化UL41蛋白,并用纯化后的蛋白在小鼠体内生成多克隆抗体。将约1.1 mg纯化蛋白与等量的QuickAntibody-Mouse3W佐剂(Biodragon, Beijing, China)混合,通过肌内注射免疫11只小鼠。最后一次免疫后1周,取眼球放血,离心(9600×gydF4y2BaggydF4y2Ba, 20分钟,4℃)。gydF4y2Ba

西方墨点法gydF4y2Ba

如前所述[gydF4y2Ba29gydF4y2Ba],在感染后7、24、36、48、60、72 h (hpi)在6孔培养皿中收集dev感染的DEF细胞,去除上清液。通过12% SDS-PAGE分解的蛋白质进一步转移到聚偏氟乙烯(PVDF)膜上。膜在5%脱脂牛奶中阻塞2小时,然后用一抗孵育,用酶标二抗(Bio-rad Lab, CA, USA)在37℃下检测1小时。所有抗体用1%的脱脂牛奶稀释。在用PBST清洗几次以去除未结合的抗体后,根据制造商的说明使用Western BLoT化学发光HRP底物(Takara,大连,中国)检测信号。gydF4y2Ba

间接免疫荧光法(IFA)gydF4y2Ba

如前所述[gydF4y2Ba35gydF4y2Ba], 6孔培养皿中dev感染的DEF细胞在0、7、12、24、36、48、60、72 hpi时收集在盖板上,4%多聚甲醛PBS固定30 min, 0.25% Triton X-100 PBS在4℃渗透30 min, 5% BSA PBS在37℃封闭1 h。此外,细胞先用一抗孵育1小时,再用二抗体孵育1小时(赛默飞世尔科学公司,Meridian Road Rockford, USA)。所有抗体用1% BSA PBS稀释。最后,用DAPI (Roche, Mannheim, Germany)在室温下观察细胞核15分钟。盖片用甘油缓冲液密封在载玻片上,用共聚焦显微镜检查细胞(尼康A1,日本)。gydF4y2Ba

RT-qPCRgydF4y2Ba

根据制造商的建议,使用TRIzol试剂l (Invitrogen, CA, USA)从dev感染的DEF细胞在不同时间点(0、2、6、12、24、36、42、45、48和54 hpi)中提取总RNA。分别用1%琼脂糖凝胶电泳和NanoDrop分光光度计测量光密度(OD260/OD280比值)来评价提取的RNA的完整性和纯度。随后,使用PrimeScript®RT试剂盒和gDNAeraser (Takara, Beijing, China)将RNA反转录为cDNA。UL41 (PgydF4y2Ba7gydF4y2Ba和PgydF4y2Ba8gydF4y2Ba)和β-肌动蛋白(PgydF4y2Ba9gydF4y2Ba和PgydF4y2Ba10gydF4y2Ba) [gydF4y2Ba35gydF4y2Ba使用之前描述的引物检测基因(表gydF4y2Ba1gydF4y2Ba).RT-qPCR条件设置如下:95°C初始变性1 min, 95°C变性5 s, 59°C退火20 s, 72°C延伸25 s。所有的反应都在三个重复和至少两个独立的实验中进行。测定阈值时的循环数(Ct值),分析UL41和β-actin基因的转录,并使用2gydF4y2Ba——ΔΔCTgydF4y2Ba方法(gydF4y2Ba25gydF4y2Ba].gydF4y2Ba

药物鉴定病毒粒子基因类型gydF4y2Ba

dev感染的DEF细胞在6孔培养皿中分别用300 μg/ml的阿昔洛韦(Glaxo SmithKline)或50 μg/ml的环己亚胺(Meilunbio, Dalian, China)孵育2 h。用TRIzol在24 hpi下提取总RNA,随后反转录为cDNA。采用引物对UL41进行PCR检测gydF4y2Ba1gydF4y2Ba和PgydF4y2Ba2gydF4y2Ba)和β-肌动蛋白(PgydF4y2Ba9gydF4y2Ba和PgydF4y2Ba10gydF4y2Ba),用1%琼脂糖凝胶确认。直接早期(IE)基因UL54 (PgydF4y2Ba11gydF4y2Ba和PgydF4y2Ba12gydF4y2Ba) [gydF4y2Ba35gydF4y2Ba],早期(E)基因UL13 (PgydF4y2Ba13gydF4y2Ba和PgydF4y2Ba14gydF4y2Ba) [gydF4y2Ba36gydF4y2Ba晚期(L)基因Us2 (PgydF4y2Ba15gydF4y2Ba和PgydF4y2Ba16gydF4y2Ba) [gydF4y2Ba37gydF4y2Ba]作为实验对照。gydF4y2Ba

病毒粒子净化gydF4y2Ba

收集dev感染的DEF细胞,采用低速离心(2000×gydF4y2BaggydF4y2Ba, 30分钟,4℃)。细胞外DEV病毒粒子经超离心(40000 ×gydF4y2BaggydF4y2Ba, 2小时,4°C)在贝克曼Ti70转子通过30% (wt/vol)蔗糖垫。用酒石酸钾连续梯度30 ~ 60% (wt/vol)等速梯度超离心收集TBS (40000 ×gydF4y2BaggydF4y2Ba, 2 h, 4°C),在贝克曼SW60转子中,TBS稀释10倍,然后通过超离心(20,000×gydF4y2BaggydF4y2Ba, 60分钟,4℃)。最后将颗粒在TBS中重悬,并在−80°C保存。gydF4y2Ba

质谱分析gydF4y2Ba

纯化的病毒粒样品采用12% SDS-PAGE分析。凝胶经考马斯亮蓝(Sigma)染色后送往中国上海生工生物技术公司进行液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)分析[gydF4y2Ba38gydF4y2Ba].所有数据也在NCBI中进行了搜索gydF4y2Ba牛gydF4y2Ba数据库。只有吉祥物得分大于30的序列才被考虑。被至少一种独特肽识别的蛋白质被接受。并使用指数修正蛋白质丰度指数(emPAI)来估计完整病毒粒子提取物的蛋白质相对丰度[gydF4y2Ba39gydF4y2Ba,gydF4y2Ba40gydF4y2Ba,gydF4y2Ba41gydF4y2Ba].gydF4y2Ba

结果gydF4y2Ba

重组表达载体的构建gydF4y2Ba

采用特异性引物和DEV CHV株序列进行PCR反应。将UL41全长克隆到pMD19-T载体中,再亚克隆到pET-32a(+)表达载体和真核质粒pEGFP-C2中,分别称为pET-32a(+)-UL41和pEGFP-C2-UL41。简而言之,通过融合PCR获得了2个突变体ul47,突变位点为40-50 aa“RRSGKRRTLDR”(Δ40-50)和768-777 aa“KALKRRLTGG”(Δ768-777)。将野生型UL47和两个突变体亚克隆到pcDNA3.1(+)载体中,生成质粒,命名为pcDNA3.1(+)-UL47, pcDNA3.1(+)-UL47gydF4y2BaΔ40 - 50gydF4y2Ba和pcDNA3.1 (+) -UL47gydF4y2BaΔ768 - 777gydF4y2Ba,分别。gydF4y2Ba

小鼠抗ul41蛋白多克隆抗体的制备gydF4y2Ba

将表达DEV UL41的重组pET-32a(+)-UL41质粒与6-组氨酸标签融合转化为gydF4y2Ba大肠杆菌gydF4y2BaBL21 (DE3)。SDS-PAGE结果仅在不溶部分检测到明显的条带(约76 kDa),而在病媒对照培养中未检测到(图2)。gydF4y2Ba1gydF4y2Ba).用0.2 mM IPTG诱导最佳蛋白表达水平(图2)。gydF4y2Ba1 bgydF4y2Ba)在30°C(图;gydF4y2Ba1 cgydF4y2Ba) 10 h(图;gydF4y2Ba1 dgydF4y2Ba).gydF4y2Ba

图1gydF4y2Ba
图1gydF4y2Ba

融合蛋白的纯化及多克隆抗体的制备。所有细菌样品均采用4℃离心,超声干扰,然后用12%的溶解凝胶和5%的堆积凝胶进行SDS-PAGE分析。gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba1车道,pET-32a(+)矢量;2巷,重组细菌沉积物;Lane 3,重组细菌上清;M. Bio-Rad低分子蛋白质标记。用0.4 mM IPTG在37℃下诱导蛋白表达6 h,直至ODgydF4y2Ba600gydF4y2Ba达到0.4 - -0.6。在重组细菌沉积物中观察到UL41-His重组蛋白水平显著升高。gydF4y2BabgydF4y2BaIPTG浓度优化。lane 1-7, IPTG浓度分别为1.2、1.0、0.8、0.6、0.4、0.2、0.1 mM。M. Bio-Rad低分子蛋白质标记。在0.2 mM处UL41-His重组蛋白水平显著升高。gydF4y2BacgydF4y2Ba感应温度优化。1巷,25℃诱导;2巷,30℃诱导;3巷,37℃诱导;M. Bio-Rad低分子蛋白质标记。在30°C时,UL41-His重组蛋白水平显著升高。gydF4y2BadgydF4y2Ba诱导时间优化。1 - 7车道,诱导时间分别为12.5、10、8、6、4、2、1 h;M. Bio-Rad低分子蛋白质标记。10 h后UL41-His重组蛋白水平显著升高。gydF4y2BaegydF4y2Ba重组蛋白纯化。Lane 1,纯化蛋白(约76 kDa);M. Bio-Rad低分子蛋白质标记。gydF4y2BafgydF4y2Ba用兔抗dev抗体(1:80)和山羊抗兔IgG酶标抗体(1:500)western blotting鉴定表达蛋白。1车道,pET-32a(+)矢量;Lane 2,重组蛋白(约76 kDa);M. Precision Plus Protein™双色标准gydF4y2Ba

接下来,用凝胶和电洗脱纯化融合蛋白(图2)。gydF4y2Ba1 egydF4y2Ba), western blotting法检测兔抗dev抗体(图;gydF4y2Ba1 fgydF4y2Ba).纯化的蛋白被用于生成小鼠抗UL41蛋白多克隆抗体,该抗体与dev感染细胞中的UL41蛋白发生强烈反应,显示出一个迁移率约为56 kDa的条带(图2)。gydF4y2Ba二维gydF4y2Ba).gydF4y2Ba

图2gydF4y2Ba
图2gydF4y2Ba

DEV UL41基因的转录和表达动力学。gydF4y2Ba一个gydF4y2BaDEV UL41(81°C)和β-actin(89°C)的熔化曲线。gydF4y2BabgydF4y2BaUL41 (Y =−3.271X + l.048)和β-actin (Y =−3.275X + 0.978)的标准曲线,UL41基因(102.2%)和β-actin(102.0%)的扩增效率基本相同,相关系数为0.999。gydF4y2BacgydF4y2Ba通过RT-qPCR检测UL41 mRNA在0、2、6、12、24、36、42、45、48和54 hpi的水平,归一化至β-actin。UL41转录本在6 hpi检测到,逐渐增加(6 - 30 hpi),在36 hpi达到峰值,之后稳定下降(42-54 hpi)。gydF4y2BadgydF4y2BaUL41在7、24、36、48、60和72 hpi (up)(约56 kDa)的代表性western blotting结果和六组的定量结果(down)。阴性组由小鼠抗ul41抗体血清(1:80)和山羊抗小鼠IgG酶标抗体(1:500)检测的模拟处理DEF细胞组成。条带密度逐渐增加(7 ~ 36hpi), 48 hpi出现峰值表达,此后(60 ~ 72 hpi)表达量稳定下降。以β-肌动蛋白抗体作为负荷对照来评价β-肌动蛋白gydF4y2Ba

DEV UL41基因的转录动力学gydF4y2Ba

利用SYBR Green i对DEV UL41基因的转录动力学进行了RT-qPCR鉴定,熔融曲线显示引物的特异性很好(图2)。gydF4y2Ba2gydF4y2Ba).建立UL41和β-actin基因的标准曲线,以评估分析的效率(图。gydF4y2Ba2 bgydF4y2Ba).随后,在不同时间采集dev感染细胞的总RNA,逆转录为cDNA,进行RT-qPCR;结果是用2gydF4y2Ba——ΔΔCTgydF4y2Ba方法。如图所示。gydF4y2Ba2摄氏度gydF4y2Ba,在6 hpi检测到UL41基因转录物,转录物水平逐渐升高,在36 hpi达到峰值,之后逐渐下降。gydF4y2Ba

DEV UL41基因表达水平gydF4y2Ba

对感染后不同时间点收集的细胞裂解物进行Western blot分析,用小鼠抗ul41蛋白多克隆抗体检测细胞膜(图2)。gydF4y2Ba二维gydF4y2Ba).条带密度逐渐增大,在48 hpi处出现峰值表达,此后呈稳定下降趋势。由于β-肌动蛋白周转率低,以β-肌动蛋白抗体作为负荷对照进行评价,β-肌动蛋白水平保持相对恒定。用ImageJ软件分析条带密度。gydF4y2Ba

DEV UL41是一个晚期基因gydF4y2Ba

我们用阿昔洛韦(ACV)或环己亚胺(CHX)治疗感染细胞。IE基因UL54, E基因UL13, L基因Us2的正确条带如图所示。gydF4y2Ba3gydF4y2Ba).β-肌动蛋白带(图;gydF4y2Ba3 bgydF4y2Ba)分别在对照组(未处理的感染细胞)、阴性组(未处理的DEF细胞)、ACV组和CHX组中检测到。对照组有UL41带,阴性组、ACV组、CHX组无UL41带。gydF4y2Ba3 bgydF4y2Ba).结果表明,DEV UL41为L型基因。gydF4y2Ba

图3gydF4y2Ba
图3gydF4y2Ba

药物鉴定病毒粒子基因类型。gydF4y2Ba一个gydF4y2BaM、DL2000 Marker;ACV组:用300 μg/ml阿昔洛韦(ACV)处理dev感染细胞;CHX组:用50 μg/mL环己亚胺(CHX)处理dev感染细胞。(+)组:未用药的dev感染细胞;(−)组:未处理的DEF细胞。DEV IE基因UL54 (127 bp), E基因UL13 (131 bp), L基因Us2 (111 bp)。gydF4y2BabgydF4y2BaM、DL2000 Marker;分别表达管家基因β-actin (177 bp)和DEV UL41 (1526 bp)gydF4y2Ba

UL41蛋白是一种病毒粒子成分gydF4y2Ba

我们用质谱法鉴定了细胞外病毒粒子蛋白含量。结果表明,UL41蛋白存在于成熟的细胞外病毒粒子中。检测到两种独特的DEV UL41肽,而三种独特的肽与DEV gC匹配(gydF4y2Bap < 0.05gydF4y2Ba).根据指数修饰蛋白丰度指数(emPAI), UL41的相对丰度较低(表2)gydF4y2Ba2gydF4y2Ba).gydF4y2Ba

表2 DEV细胞外病毒粒病毒含量(部分)gydF4y2Ba

DEV UL41蛋白主要定位于新感染细胞的细胞质中gydF4y2Ba

利用IFA检测DEV UL41蛋白(pUL41)在细胞内的定位。总的来说,我们发现UL41蛋白特异性荧光(绿色)分布在整个细胞中,主要在细胞质中明显。此外,ul41特异性荧光在7至36 hpi之间的细胞中很明显,随后在48至72 hpi之间分散在整个细胞中,然后随着时间的推移逐渐增强。在模拟感染细胞中未观察到荧光(图。gydF4y2Ba4gydF4y2Ba).gydF4y2Ba

图4gydF4y2Ba
图4gydF4y2Ba

pUL41在不同时间的dev感染细胞内定位。gydF4y2Ba一个gydF4y2Ba在7、12、24、36、48、60和72 hpi处UL41定位的代表性共聚焦免疫荧光显微图像(所有图像均为绿色)。细胞核以蓝色表示(DAPI)。对照组为未处理的DEF细胞(放大200×;比例尺:50 μm)用小鼠抗ul41抗体血清(1:80)和山羊抗小鼠IgG (H + L)二抗Alexa Fluor 488(1:100)检测。在野生型DEV感染的DEF细胞中,细胞质UL41水平明显升高gydF4y2Ba

在缺乏其他病毒蛋白的情况下,DEV UL47蛋白可将pUL41转位到细胞核中gydF4y2Ba

真核质粒pEGFP-C2-UL41表达了83 kDa的融合蛋白EGFP-UL41。gydF4y2Ba5 dgydF4y2Ba),仅定位于细胞质(绿色),并通过小鼠抗ul41蛋白多克隆抗体(红色)进一步检测。pEGFP-C2质粒控制分布在整个细胞(图。gydF4y2Ba5gydF4y2Ba).gydF4y2Ba

图5gydF4y2Ba
图5gydF4y2Ba

在缺乏其他病毒蛋白的情况下,DEV-UL47蛋白可将pUL41转运到细胞核中。转染24 h后收集所有转染样品。gydF4y2Ba一个gydF4y2BaDEF细胞分别转染pEGFP-C2- ul41和pEGFP-C2。EGFP-UL41融合蛋白定位于细胞质(绿色),进一步用小鼠抗ul41蛋白多克隆抗体(1:80)和山羊抗小鼠IgG (H + L)交叉吸附二抗Alexa Fluor 568(1:100)(红色)检测。pEGFP-C2质粒控制分布在整个细胞(绿色)。gydF4y2BabgydF4y2BaDEF细胞共转染pEGFP-C2-UL41和pcDNA3.1-UL47。EGFP-UL41融合蛋白大部分定位于细胞核(绿色),pUL47主要定位于细胞核(红色),用兔抗ul47蛋白多克隆抗体(1:1000)和山羊抗兔IgG (H + L)交叉吸附二抗Alexa Fluor 568(1:1000)检测。以pEGFP-C2-UL41和pcDNA3.1(+)共转染DEF细胞作为对照,EGFP-UL41融合蛋白仅分布在细胞质中(绿色)。gydF4y2BacgydF4y2Ba用pcDNA3.1-UL47转染DEF细胞gydF4y2BaΔ40 - 50gydF4y2Ba和pcDNA3.1-UL47gydF4y2BaΔ768 - 777gydF4y2Ba,分别。部分ΔpUL47定位于细胞质(绿色),用兔抗ul47蛋白多克隆抗体(1:1000)和羊抗兔IgG (H + L)交叉吸附二抗Alexa Fluor 488(1:1000)检测。gydF4y2BadgydF4y2Ba经pEGFP-C2- ul41(约83 kDa)和pEGFP-C2(约27 kDa)转染的DEF细胞,经兔抗egfp抗体(1:2000)(Beyotime,上海,中国)和山羊抗兔IgG酶标抗体(1:500)检测。转染pcDNA3.1(+)、pcDNA3.1- ul47的DEF细胞Western blotting结果gydF4y2BaΔ768 - 777gydF4y2Ba(约87 kDa), pcDNA3.1-UL47gydF4y2BaΔ40 - 50gydF4y2Ba(约87 kDa)和pcDNA3.1-UL47(约89 kDa)分别用兔抗ul47抗体(1:1000)和山羊抗兔IgG酶标抗体(1:500)检测。β-肌动蛋白抗体评价β-肌动蛋白为负荷对照。M. Precision Plus Protein™双色标准。gydF4y2BaegydF4y2BaDEF细胞共转染pEGFP-C2-UL41和pcDNA3.1-UL47gydF4y2BaΔ40 - 50gydF4y2Ba, pEGFP-C2-UL41和pcDNA3.1-UL47gydF4y2BaΔ768 - 777gydF4y2Ba,分别。大部分EGFP-UL41融合蛋白定位于细胞质(绿色)。部分ΔpUL47定位于细胞质(红色),用兔抗ul47蛋白多克隆抗体(1:1000)和羊抗兔IgG (H + L)交叉吸附二抗Alexa Fluor 568(1:1000)检测。gydF4y2Ba

根据我们之前的研究,pUL41分布在整个感染细胞中,因此我们假设另一种DEV蛋白可能影响这种定位。据报道,另一种HSV被膜蛋白pUL47可与VHS相互作用,使VHS的核定位成为可能[gydF4y2Ba21gydF4y2Ba,gydF4y2Ba42gydF4y2Ba].为了确定DEV pUL47是否会将pUL41转运到细胞核中,我们构建了真核质粒pcDNA3.1-UL47,该质粒表达89 kDa pUL47(图2)。gydF4y2Ba5 dgydF4y2Ba).将真核质粒pcDNA3.1-UL47和pegfp - 2c - ul41共转染DEF细胞,经兔抗ul47蛋白多克隆抗体(1:1000)检测,pUL47主要定位于DEF细胞的细胞核(红色)。EGFP-UL41融合蛋白也主要存在于细胞核中(绿色)。gydF4y2Ba5 bgydF4y2Ba).因此,我们认为pUL47可以将pUL41移位到细胞核。gydF4y2Ba

根据预测软件gydF4y2Bahttps://www.predictprotein.orggydF4y2Ba/, DEV pUL47有两个明显的核定位信号(nss),分别为40 ~ 50 aa和768 ~ 777 aa。为了确定这两个pUL47序列是否将pUL41转移到细胞核中,我们构建了质粒pcDNA3.1-UL47gydF4y2BaΔ40 - 50gydF4y2Ba和pcDNA3.1-UL47gydF4y2BaΔ768 - 777gydF4y2Ba,分别删除pUL47的40-50 aa和768-777 aa(图。gydF4y2Ba5 dgydF4y2Ba).IFA显示,大部分ΔpUL47定位于细胞质(绿色)(图。gydF4y2Ba5度gydF4y2Ba);因此,我们得出结论,40-50 aa和768-777 aa都影响pUL47核的定位。接下来,我们共转染pcDNA3.1-UL47gydF4y2BaΔ40 - 50gydF4y2BapEGFP-C2-UL41和pcDNA3.1-UL47gydF4y2BaΔ768 - 777gydF4y2Ba和pEGFP-C2-UL41。在两个共转染的细胞中,EGFP-UL41融合蛋白主要定位于细胞质(绿色)。gydF4y2Ba5 egydF4y2Ba).gydF4y2Ba

讨论gydF4y2Ba

到目前为止,关于DEV UL41基因的信息还很有限。刘金雄及同事[gydF4y2Ba43gydF4y2Ba作者以DEV基因组的UL41基因为插入位点,构建了一种重组病毒rDEV-ul41HA,作为鸭DEV和H5N1感染的二价减毒活疫苗。其他疱疹病毒基因组中的UL41被确定为病毒复制的非必需区域[gydF4y2Ba44gydF4y2Ba];结果表明,UL41并不是一个理想的外源基因插入位点。作为研究DEV UL41蛋白性质和特征的第一步,我们进一步探索了DEV pUL41的功能,本文结果的主要特征如下。gydF4y2Ba

疱疹病毒周期的特点是两个不同的阶段:潜伏期和生产周期或裂解周期。在生产周期中,疱疹病毒表现出严格调控的基因表达时序级联,分为三个阶段:IE、E和L。IE基因首先表达,并编码在转录和转录后水平上刺激病毒E和L基因表达的核调节蛋白。第二,E基因参与病毒DNA复制机制。病毒DNA复制增强了编码病毒颗粒大部分结构成分的L基因的表达。L基因根据其明显的DNA复制要求被细分为泄露晚期(γ1)和严格晚期(γ2)两类。γ1基因的表达较早期基因延迟,而γ2基因则严格要求DNA裂解扩增的开始或完成[gydF4y2Ba45gydF4y2Ba,gydF4y2Ba46gydF4y2Ba].HSV-1 VHS蛋白是一种γ2被膜蛋白,有助于细胞信使rna (mRNAs)的降解和宿主蛋白质合成的整体减少[gydF4y2Ba20.gydF4y2Ba,gydF4y2Ba21gydF4y2Ba].此外,VZV ORF17也表达为一种L蛋白,在病毒复制周期中关闭细胞RNA [gydF4y2Ba14gydF4y2Ba].传染性喉气管炎病毒(ILTV)的UL41基因被归类为E/L基因,因为它同时具有E和L特性[gydF4y2Ba47gydF4y2Ba].gydF4y2Ba

为了鉴定DEV UL41基因类型,我们分别采用RT-qPCR和western blot方法研究了其在感染后不同时间点的转录和表达动力学。根据以往的研究[gydF4y2Ba32gydF4y2Ba,gydF4y2Ba37gydF4y2Ba,gydF4y2Ba48gydF4y2Ba,gydF4y2Ba49gydF4y2Ba],我们认为DEV pUL41的积累可能发生在感染后期。IE基因在蛋白质合成抑制剂CHX的存在下表达,而E和L基因的转录在CHX的存在下受到抑制[gydF4y2Ba50gydF4y2Ba].为了进一步研究这一点,我们用DNA聚合酶抑制剂ACV和蛋白质合成抑制剂CHX处理感染细胞,并观察到在ACV和CHX组中UL41基因都被抑制。因此,DEV UL41基因是γ2基因,严格依赖于DNA裂解扩增的开始或完成。质谱法是鉴定复杂样品蛋白质组成的有效手段,已被应用于各种疱疹病毒的分析[gydF4y2Ba39gydF4y2Ba,gydF4y2Ba40gydF4y2Ba,gydF4y2Ba51gydF4y2Ba,gydF4y2Ba52gydF4y2Ba,gydF4y2Ba53gydF4y2Ba].基于emPAI,DEV pUL41是一种低丰度的病毒粒子成分,这意味着DEV pUL41可能与HSV-1 VHS蛋白具有相同的特征,这对病毒感染至关重要。gydF4y2Ba

细胞内病毒蛋白定位与病毒蛋白功能相关,但细胞内DEV pUL41定位未见文献记载。我们利用小鼠抗ul41蛋白多克隆抗体IFA分析了DEV pUL41的细胞内定位。结果表明,DEV UL41蛋白特异性荧光分布于细胞各处,信号主要存在于细胞质中。根据以往的研究[gydF4y2Ba19gydF4y2Ba,gydF4y2Ba45gydF4y2Ba], HSV-1 VHS蛋白被运送到新感染细胞的细胞质中,以降解细胞mrna。这一降解过程有助于关闭宿主蛋白质合成,重定向细胞机制从宿主到病毒基因表达,并破坏预先存在的多核糖体。这些过程构成了病毒阻断宿主对感染反应的主要早期机制。其他调查人员的研究[gydF4y2Ba21gydF4y2Ba]的研究表明,野生型HSV-1 VHS蛋白最初定位于细胞核,然后易位到细胞质。该蛋白可以在细胞核和细胞质之间穿梭,包含一个假定的核输出信号(NES),但尚未发现明显的NLS。另一种晚期被膜HSV-1蛋白pUL47(或VP13/14),与RNA结合并在细胞质和细胞核之间穿梭[gydF4y2Ba54gydF4y2Ba],可调节一些病毒和与之相互作用的细胞蛋白的亚细胞定位,可能参与VHS向细胞核的转运[gydF4y2Ba55gydF4y2Ba,gydF4y2Ba56gydF4y2Ba,gydF4y2Ba57gydF4y2Ba].VHS-RNase和VP13/14必须在VHS-RNase/VP13/14转位到细胞质之前与核中新合成和处理的mRNA组装,然后VHS-RNase降解mRNA。在感染早期,VHS功能受VP13/14调节,VP13/14可减弱感染细胞中所有动力学类病毒mrna和稳定宿主mrna的降解,而对富含au的mrna的稳定性没有明显影响[gydF4y2Ba42gydF4y2Ba].序列预测结果显示,DEV UL41含有NES基序,不含NLS基序。基于这些报道,我们还发现DEV pUL41不能自主定位到细胞核,在缺乏其他病毒蛋白的情况下,DEV pUL47将pUL41易位到细胞核中;这些过程依赖于预测的pUL47 NLS信号。gydF4y2Ba

根据这些数据,我们得出结论,DEV UL41是一个γ2基因,编码一种类似于HSV-1 VHS的结构蛋白。DEV pUL41可能是病毒感染所必需的,它在被感染细胞的细胞质中起作用,并与pUL47相互作用以影响病毒和宿主基因,但需要进一步的研究来证实这一点。gydF4y2Ba

结论gydF4y2Ba

DEV UL41是一个编码结构蛋白的γ2基因。ul41编码的蛋白在整个DEV感染的细胞中定位,但pUL41不能自主定位到细胞核,因为这种核定位依赖于DEV pUL47预测的NLS信号(40-50 aa和768-777 aa)。gydF4y2Ba

缩写gydF4y2Ba

无环鸟苷:gydF4y2Ba

无环鸟苷gydF4y2Ba

BHV-1:gydF4y2Ba

牛疱疹病毒1gydF4y2Ba

BV:gydF4y2Ba

猴B病毒(机器疱疹病毒1型)gydF4y2Ba

CHX:gydF4y2Ba

环己酰亚胺gydF4y2Ba

DAPI:gydF4y2Ba

4, 6-diamidino-2-phenylindolegydF4y2Ba

戴夫:gydF4y2Ba

鸭肠炎病毒gydF4y2Ba

EHV-1:gydF4y2Ba

马herpesvirus-1gydF4y2Ba

HSV:gydF4y2Ba

单纯疱疹病毒gydF4y2Ba

ifa:gydF4y2Ba

间接免疫荧光分析gydF4y2Ba

ILTV:gydF4y2Ba

传染性喉气管炎病毒gydF4y2Ba

新经济学院:gydF4y2Ba

核输出信号gydF4y2Ba

NLS:gydF4y2Ba

核定位信号gydF4y2Ba

减压阀:gydF4y2Ba

假狂犬病病毒gydF4y2Ba

PVDF:gydF4y2Ba

聚偏二氟乙烯gydF4y2Ba

rt - pcr:gydF4y2Ba

实时定量逆转录PCRgydF4y2Ba

sds - page:gydF4y2Ba

十二烷基硫酸钠聚丙烯酰胺凝胶电泳gydF4y2Ba

带状疱疹:gydF4y2Ba

水痘一带状疱疹病毒gydF4y2Ba

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致谢gydF4y2Ba

感谢AJE集团美国(gydF4y2Bawww.aje.cn/acgydF4y2Ba),以编辑本手稿草稿的英文文本。gydF4y2Ba

资金gydF4y2Ba

本研究得到国家重点研发计划项目(2016YFD0500800)、中国农业科研体系项目(CARS-42-17)、四川省动物疫病与人类健康重点实验室专项资金(2016JPT0004)和四川省国际科技合作计划项目(批准号2017HH0026)资助。gydF4y2Ba

数据和材料的可用性gydF4y2Ba

本研究中分析的数据集可根据合理要求从通讯作者处获得。gydF4y2Ba

作者信息gydF4y2Ba

作者及隶属关系gydF4y2Ba

作者gydF4y2Ba

贡献gydF4y2Ba

DZ和ML进行了大部分实验并起草了手稿。AC和MW对手稿和实验设计进行了严格的修改。YW, QY, ML, DZ, RJ, SC, KS, XZ, XC对实验有帮助。所有作者都阅读并批准了最终的手稿。gydF4y2Ba

相应的作者gydF4y2Ba

对应到gydF4y2BaAnchun程gydF4y2Ba.gydF4y2Ba

道德声明gydF4y2Ba

伦理批准并同意参与gydF4y2Ba

本研究获四川农业大学动物伦理委员会批准(2016-17)。gydF4y2Ba

发表同意书gydF4y2Ba

不适用。gydF4y2Ba

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开放获取gydF4y2Ba本文根据创作共用属性4.0国际许可协议(gydF4y2Bahttp://creativecommons.org/licenses/by/4.0/gydF4y2Ba),允许在任何媒介上不受限制地使用、分发和复制,前提是您对原作者和来源给予适当的赞扬,提供到创作共用许可证的链接,并注明是否进行了更改。创作共用公共领域奉献弃权书(gydF4y2Bahttp://creativecommons.org/publicdomain/zero/1.0/gydF4y2Ba)除另有说明外,适用于本条所提供的资料。gydF4y2Ba

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他,T.,王,M.,曹,X.。gydF4y2Baet al。gydF4y2Ba鸭肠炎病毒UL41蛋白的分子特征gydF4y2Ba性研究JgydF4y2Ba15gydF4y2Ba, 12(2018)。https://doi.org/10.1186/s12985-018-0928-4gydF4y2Ba

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