埃塞俄比亚人类和不同环境样本中选定的食源性病原体的患病率和流行病学分布:系统综述和荟萃分析

细菌性食源性病原体(FBP)是世界范围内引起食源性疾病或食源性疾病(FBD)的最常见原因。从农场到餐桌，它们在整个食物链的任何阶段都会污染食物。其中，致泻性大肠杆菌(DEC)，非伤寒沙门氏菌(nt),志贺氏杆菌种虫害和弯曲杆菌大多数的疾病和死亡都是由动物造成的;尤其是急性腹泻病的诱因。虽然现有的研究表明，这个问题在埃塞俄比亚等发展中国家可能很严重，但证据通常是基于来自个别研究的碎片化数据。对已发表和未发表的手稿进行了审查，以获得关于主要FBP的信息，并确定在追踪其在人类、动物和环境界面上的来源归因方面的差距。在将研究期限限制在2000年1月至2020年7月之间后，最初共检索了1753篇文章。经过第二次筛选，仅有51篇关于人类的文章和43篇基于环境样本的研究被纳入本综述。在没有亚组的情况下，分析了总体以及基于人类粪便和环境样本的FBP流行率的汇总估计。由于预期存在显著的异质性，我们还对主要研究变量进行了亚组分析，以估计两个样本来源中不同流行病学背景下FBP的汇总患病率。FBP的总体随机汇总流行率估计(沙门氏菌,致病性大肠杆菌，志贺氏菌而且弯曲杆菌Spp .)为8%;95% CI: 6.5-8.7，差异有统计学意义(P< 0.01)的环境样本估计数(11%)比人类粪便估计数(6%)高。亚组分析描述了这一点沙门氏菌和致病性大肠杆菌对埃塞俄比亚FBD总流行率估计的贡献分别为5.7% (95% CI: 4.7-6.8)和11.6% (95% CI: 8.8-15.1)。元回归结果显示，行政区域状态、研究地理区域、样本来源和分类样本量均显著影响异质性沙门氏菌和致病性大肠杆菌估计。此外，多元元回归结果显示，2011年至2015年的实际研究年份与这些FBP基于环境样本的患病率估计值显著相关。该系统综述和荟萃分析表明FBP在埃塞俄比亚很重要，尽管大多数研究是在人类、动物或环境样本中分别进行的，采用常规培养诊断方法。因此，需要采用先进的诊断方法在人、动物和环境界面进行进一步的FBD研究，以在一个健康方法中调查FBD的来源归因。

食源性病原体(FBP)是病毒、细菌和寄生虫等生物制剂，可导致食源性疾病或食源性疾病(FBD)。食源性疾病(也称为食源性疾病或食物中毒)是指因食用被致病菌、病毒或寄生虫污染的食物而引起的任何疾病[1］．食源性疾病或食物中毒大多是由于食用了受污染、变质或有毒的食物而引起的，基本上，食源性疾病可由食源性感染、食源性中毒或食源性中毒感染引起[2，3.］．

食源性病原体(FBP)在许多国家和国家间引起数百万例散发性疾病和慢性并发症，以及具有挑战性的大规模疫情[4］．这些病原体的影响也因地区而异，因为不同国家的公众对食品卫生的认识水平不同。美国莱恩(5]和Paudyal等人[6]解释说，大多数FBP是在处理、加工和制备过程中作为外源性污染物引入的，而不是作为内源性污染物存在。在埃塞俄比亚等发展中国家，由于在确保最佳卫生食品处理做法方面存在局限性，这一问题非常严重[7，8］．

在从农场到餐桌的整个食物链的任何阶段，致病菌都会污染食物[9］．人类可以通过食用各种受污染的食物和水，或通过接触受感染的牲畜和其他动物粪便，获得病原体或感染。受感染的人类和环境也是传染源[10，11］．沙门氏菌，单核细胞增多性李斯特氏菌，大肠杆菌（大肠杆菌)，弯曲杆菌spp。8，12),志贺氏杆菌［7，13]是埃塞俄比亚报道的最常见的FBP。具体来说，FBP像腹泻大肠杆菌和NTS不断大量排泄到环境中，它们是很大比例的疾病和死亡的原因;更重要的是，作为儿童急性腹泻疾病的来源[14］．食用动物是许多FBP的主要宿主[4］．直接或间接接触动物(家畜和其他动物)及其携带人畜共患病原体的粪便或养殖环境是FBD的重要危险因素。因此，人的健康与动物和环境的健康息息相关[15］．

在埃塞俄比亚这样的发展中国家，烟草的主要来源沙门氏菌人类受感染的食用动物包括牛、家禽及猪等，主要是在屠宰过程中因屠体被消化道内容物污染而感染[16，17］．牛也是主要的宿主大肠杆菌O157:H7，其次是绵羊和山羊。病原体在受感染动物的粪便中间歇性排出[18，19］．大肠杆菌感染通常在老年人和五岁以下儿童中很严重;尤其是产志贺毒素的大肠杆菌O157: H7在免疫功能受损的个体和暴露于非常高剂量的健康人群中引起最严重的情况[2，10］．埃塞俄比亚特别容易受到人畜共患疾病的影响，因为该国经济在很大程度上依赖农业[20.，21]而且大约80%的家庭与家畜有直接接触，为疾病的感染和传播创造了机会[12，22，23］．在埃塞俄比亚进行的一项研究报告了高致病性大肠杆菌流行率高达51.6% [24］．Tosisa [25]还报告说，大肠杆菌是引起儿童急性感染性腹泻最常见的原因之一。最近对来自埃塞俄比亚的30篇文章的荟萃分析也显示18.1%的汇总流行率估计大肠杆菌在动物源性食物中[26］．

在埃塞俄比亚进行的一项研究报告了8.72、5.68和1.08%的汇总流行率估计数沙门氏菌在腹泻儿童，成人和携带者分别。Nontyphi沙门氏菌占报告分离株的57.9% [27］．肠沙门氏菌感染率为5.5% [24]及1.3% [28]，也分别报道了来自Debre Berhan和Ambo的5岁以下儿童(UFC)。平等等人[29]和Eguale等人[17]也报告了患病率为7.2、4.7和4.4%沙门氏菌在人类患者中，分别是家禽和猪。

尽管细菌性FBP在埃塞俄比亚很重要;病原体预防和控制干预策略的实施很差或具有挑战性，因为没有详细的FBP发病率监测和发表的数据[8］．同样，关于目前的状况，特别是在埃塞俄比亚检测到的FBP病理类型、流行病学及其来源归因方面，几乎没有详细的记录信息。此外，埃塞俄比亚对FBP进行了一些系统综述和荟萃分析，这些综述只关注不同食品中FBP的报告，特别是动物源性食品，没有考虑细菌污染源。因此，对人类、动物和其他环境样本中FBP的近期状况进行全面的科学综述，以支持适当和集中的学术努力，是及时和恰当的。因此，就我们所知，这是第一份在埃塞俄比亚的人类和环境样本中调查FBP的系统综述和荟萃分析报告。因此，本研究旨在回顾现有的关于主要FBP的报告，并确定高度重要的FBP来源归因中的差距(沙门氏菌而且大肠杆菌)在人、动物和环境的交界面。

最初，总共搜索了2498篇文章(2470篇来自PMC、BMC medicine和直接谷歌，28篇来自大学知识库)沙门氏菌，大肠杆菌，志贺氏菌而且弯曲杆菌仕达屋优先计划．但是，对于数据的优化管理，本研究仅针对沙门氏菌而且大肠杆菌．数据提取于志贺氏杆菌而且弯曲杆菌sp .仅用于确定埃塞俄比亚FBP的总体合并流行率估计值(表2)4)，本研究未报道。但是，可以通过向作者请求访问数据。另一方面，本分析中包括的大多数研究(满足纳入标准)仅报告大肠杆菌一般的患病率，没有提到具体的病理类型。因此，在这项研究中，如果一个样本对六种中的任何一种呈阳性大肠杆菌病原体类型，被认为是致病的阳性大肠杆菌,和大肠杆菌所提到的是指致病性大肠杆菌．

研究框架

为了对FBP进行系统回顾和荟萃分析，我们确定了一个分析框架，其中生活在埃塞俄比亚的公众被视为研究人群，而FBP的归因及其流行病学被视为一种感兴趣的现象。背景是涉及食品企业和兽医研究所的卫生保健设施和非卫生保健机构，公共卫生研究人员通常关注这些机构。该综述是基于研究问题的框架:在埃塞俄比亚，FBD的总体流行率是多少，哪种细菌FBP更重要?的发生沙门氏菌而且大肠杆菌它们的流行病学分布各不相同，它们各自的相关来源是什么?

文献检索策略与病原体优先排序

通过电子方式进行了全面的文献检索，收集了埃塞俄比亚关于FBP及其来源归因和流行病学的发表文章、简短通信和研究报告。从PMC和BMC(医学)期刊电子数据库中搜索已发表的文章或报告，也可以通过直接谷歌搜索。此外，从亚的斯亚贝巴大学和哈拉马亚大学等大学资料库收集了研究生论文和学位论文，并对未发表的手稿进行了手工搜索。在搜索过程中，我们使用自由文本和医学主题标题术语结合FBD/FBP相关关键字。在第一步中，我们选择了特定的关键词(补充文件见附件)1)搜索潜在的文章，以确定埃塞俄比亚儿童中最重要的FBP。

通过查看用这些词搜索的文章和报告，沙门氏菌，大肠杆菌，志贺氏菌，弯曲杆菌，金黄色葡萄球菌而且单核细胞增多性李斯特氏菌被认为是最常见的FBP，特别是埃塞俄比亚儿童腹泻相关的FBP。此外，我们参考了Pieracci等人的工作[12)，世卫组织使用“一个健康”方法优先考虑埃塞俄比亚的人畜共患疾病，并报告说沙门氏菌、弯曲杆菌而且大肠杆菌都是FBP的8大细菌之一。因此，基于我们的初步综述结果(埃塞俄比亚腹泻儿童中的FBD)，我们决定对选定的细菌FBP进行综述，即FBP。沙门氏菌，大肠杆菌，志贺氏杆菌而且弯曲杆菌。为此，我们进行了第二步检索，使用不同的特定检索词结合细菌病原体属名，从上述数据库和大学资料库中检索已确定的四种FBP或其疾病状况的文献(表2)1)．检索了2000年以后发表的论文，其摘要可按检索时间访问。在第一阶段之后，搜索进行了两次，第二次搜索于2020年7月24日进行，目的是检查遗漏的论文(如果有的话)。

资格标准及筛选程序

纳入标准:研究区域

研究只在埃塞俄比亚进行。人群:包括样本量指标和直接和/或间接提供FBD/FBP患病率的研究，包括或不包括年龄特定估计。研究设计:所有观察性和回顾性研究，以及来自确定FBD/FBP的前瞻性研究的基线调查，其中实际研究时间限制在过去20年之内。样本类型:仅纳入报告FBP在粪便样本(在人类病例中)和环境样本中流行的研究。语言:只考虑用英语报道的文章。期间及发表条件:包括实际数据收集、处理和实验室分析限于2000年1月至2020年7月期间的已发表和未发表的文章。

排除标准

没有摘要和/或全文的文章引用，重复研究，以及没有报告阳性病例数和总样本量的研究(如果患病率仅以百分比报告)被排除。报道了FBD的一般负担(其中未指定病原体)、未描述诊断方法(微生物检测技术)和野生动物FBP研究的研究也被排除在荟萃分析之外。

筛选程序和研究的相关性

关于研究的相关性和质量，两名独立审稿人(DB和YH)首先确定了研究变量或结果的细节(图2)。2)，以及在框架下根据研究问题检索的词。通过与TG讨论，对检索词和筛选方法进行了修改，包括手检索。然后，其他作者TH和PMK对总体框架和数据综合方法进行了评论。还使用了准确和透明的健康估计报告(GATHER)清单的预定义准则进行筛查。此外，为了最大限度地减少偏差，我们同意将发表年份与实际研究年份一起纳入，并将研究年份延长至20年，从而扩大了纳入研究的数量(即2000年1月至2020年7月的研究数据)。

然后两个独立的审稿人(DB和YH)使用标题和摘要搜索并筛选出文章。使用尾注软件对研究进行重复删除，并通过手工方法进行校正。在两位审稿人同意的情况下，对研究的相关性进行了检查，并排除了参考文献。在第一筛选阶段提出的异议也通过其他作者的参与得到解决。每篇完整的文章由两名审稿人根据数据提取前制定的纳入和排除标准对每篇参考文献进行单独筛选。在第二筛选阶段提出的任何冲突也在数据提取之前与第三审稿人解决。从检索到的摘要和全文中评估与研究特征相关的数据/信息，删除不符合研究标准的研究。因此，我们研究中使用的文章从鉴定到最终纳入都经过了不同的筛选步骤。在检索的1753份手稿中，只有94篇研究被发现符合系统评价和荟萃分析的条件1；无花果。1)，但从2498篇检索手稿中筛选出的120篇研究被用于FBD的总体汇总患病率估计(图。1)．

测量结果变量及其描述

我们有两个主要的结果，即人类粪便和基于环境样本的FBP结果变量，因为一些研究集中在不同年龄组的人类粪便中的FBP，而另一些研究是在不同的环境样本上进行的。有些研究是在十年前进行的还有一些是最近才进行的，等等。因此，这些研究可能会得出不同的总结估计。事实上，当被检查的元分析数据包含大量异质性时，彻底的调节因子分析比单一的汇总效应量估计信息更丰富[30.］．版主通常是分类的，要么是因为固有的因素，要么是因为文章中提供的信息不允许更细粒度的编码[31］．

与主要研究类似，调节分析有一个参与者样本(即荟萃分析中包含的研究)、一个或多个自变量(即调节变量)和一个因变量(即每个亚组内的效应量)[30.］．根据Hamza等人。32]，在亚组分析的框架下，根据分类调节因子内的类别，将整个研究集分为两个或多个亚组，并将一个亚组研究的效果与其余亚组研究的效果进行比较。当研究间方差(我²)大于零(0%)，总体异质性可由研究之间的真实差异来解释。因此，应用亚组分析或元回归来确定潜在的调节因素是有意义的，这些因素可以解释跨研究的效应大小之间的不一致性，或者可以影响或解释关系的因素[30.，33］．假设I²的25、50和75%分别表示低、中、大异质性[34，35］．

因此，在本研究中，基于人类粪便和环境样本的结果，计算了FBP的总体和单独亚组患病率估计值及其流行病学分布和来源归因。重要变量包括年龄组、样本类型、诊断技术、研究设计或类型、实际研究年份(图2)。2)，以确定FBD的患病率估计和流行病学危险因素。在埃塞俄比亚的九个行政区域州(第10个地区，最近成立的地区，Sidama被认为是SNNP)和两个市议会中，在八个地区进行了全面研究(只有来自阿法尔地区的研究没有被筛选)和两个市议会被包括在内。

同样，为了测试总结效应如何随着不同类型的研究或研究中参与者的不同特征而变化，我们需要获得至少可接受的最小研究数量，以便进行亚组分析和元回归[33］．我们还遵循了这样的原则:当纳入的研究规模中等或较大时，一个连续研究水平变量至少应该有6至10项研究;对于一个(分类)子组变量，每个子组应至少有4项研究[36］．

在本研究分析的11个亚组变量中，大多数包含10项以上的研究。纳入研究少于4项的变量要么被排除(如分子诊断技术)，要么被合并并以新的名称命名，用于汇总估计比较。例如，少数研究区域主要根据地理区域的接近程度加上研究数量进行合并，然后标记为“其他”。同样，在达瓦市和哈拉里州进行的研究低于亚群分析标准的最低限度，因此，我们将它们合并为达瓦和哈拉里州。对于环境样本，在亚组分析中，除家禽粪便外的任何家畜粪便均被指定为“动物粪便”。

另一方面，在系统综述中，无论每个变量包含多少研究，都对研究变量进行比较。在这里，我们只对评审结果的表述做了技术性术语的修改和安排。例如，研究区域中的变量“其他”表示一项研究，其中实验室样本来自两个或多个不同的区域、地理或研究区域(表2)2而且3.)．此外，本综述中包括的一些文章报道了直接从屠宰场收集的胴体或从肉店和酒店收集的肉类样本中FBP的流行。很少有文章将屠宰场和肉店的样本都视为尸体。然而，在本综述中，“零售肉类”一词指从肉铺收集的胴体及其接触表面样本，以及从屠宰场收集的相应样本。屠宰场的尸体被用来估计特定的FBD来源的归属。此外，术语食用(大型)动物(例如食用动物粪便)用来代替混合样本(从不同家畜中作为单一样本)或分别从牛、绵羊、山羊、骆驼和猪(猪)中收集的样本。”身份不明的凳子上也用于筛选的文章中没有明确说明为实验室分析而收集的粪便状况的情况，或者“腹泻”和“非腹泻”样本作为单一(一个)结果进行分析的情况。

在本分析中，患病率估计取自随机效应模型结果。因为，一项研究的总方差是研究之间和研究内方差的总和，用于在随机效应模型下分配权重。在没有亚组的情况下，研究间方差的估计(τ²)是根据所有研究从大平均值[34］．根据Borenstein [34]，在随机效应亚组分析中，R²在元回归中，可以使用指数(研究间方差的可解释比例)来表示所有研究中可由一个或一组调节因子解释的真实异质性的比例，以量化它们对研究效果的影响程度。基本上是R²取值范围为0(0%)~ 1(100%)。

数据提取

在第二筛选阶段后，在Microsoft excel中编制标准化的数据抽象格式和与研究特征相关的重要数据(表2)是从前两位作者独立收录的文章中提取出来的。信息包括:第一作者姓名、样本量、阳性样本数、实际研究年份、发表年份、参与者年龄、样本类型、诊断技术、采用的研究设计、行政区域州或市议会、地理区域、具体研究区域(区或镇)和分离的细菌病原体均被提取并纳入分析。最后，在实际的数据分析过程之前，作者独立地对提取的信息进行了交叉核对。

数据分析与解释

最初对以抽象格式存储的数据文件执行数据管理，以准备一个逗号分隔值(.csv)文件以供进一步分析。对于系统回顾，FBP的患病率及其95%置信区间(表2而且3.)，根据提取的样本量和阳性样本数，对每个纳入的研究进行计算。这是因为在一些筛选的文章中，仅报道了FBP的样本量和阳性样本数，而没有用百分比(%)及其CI描述FBP的患病率。

我们还通过总体和亚组分析估计了95% ci患者FBD的患病率。为了做到这一点，首先将点流行率转换为logit转换比例，并使用DerSimonian-Laird权重将转换后的数据拟合为随机效应模型[123］．通过计算评估报告患病率之间的异质性p- Cochrane q检验的值，τ²而且我²静力学。患病率估计为检测到的FBP阳性样本总数除以实验室处理的样本总数乘以100。使用R包“metafor”，对报告的细菌病原体、地区、地理区域、地区或城镇、实际研究年份、发表年份、样本类型和基于人类和环境样本的FBD研究中的分类样本量等变量进行独立效应量之间的线性关系进行meta回归分析。使用R编程软件的“meta”和“metfor”软件包进行分析[124]版本4.0.3。

异质性检验(问)，研究间方差的估计值(τ²)，以及反映研究间方差的观测变异性比例的估计值(我²)用于测试和量化异质性。异质性卡方(问-test)和它的p-value作为显著性检验，以解决原假设。的τ²以绝对规模反映真实异质性的数量[34]，即各研究中系统效应差异的总量。一项研究的总方差是研究间方差和研究内方差的总和，用于在随机效应模型下分配权重。我的²是研究方差与观察方差的比值，用于比较meta分析的异质性估计。取值范围为0 ~ 100%。我²= 0%，表示所有的异质性都是由抽样误差引起的，没有什么可以解释的;我²= 100%，总体异质性可由研究之间的真实差异来解释[35］．

系统综述

简单总结一下报告的患病率沙门氏菌和致病性大肠杆菌在人类粪便和环境样本中使用描述性统计进行。在这方面，目前的审查显示，致病性大肠杆菌而且沙门氏菌在埃塞俄比亚不同地区的人类粪便中检测到不同程度的疟原虫，范围从0到48.34% (大肠杆菌)及41.38% (沙门氏菌)．在目前的分析中，对于以人类粪便为基础的研究，包括了来自六个区域州和两个市议会的研究，但不幸的是，在Benishangul Gumuz、索马里和阿法尔区域州进行的研究没有被筛选，也没有被包括在内。地理区域覆盖的研究也表明，较少受到重视大肠杆菌目前筛选的人体FBP系统综述中，约60%的文章是由已进行的研究组成的沙门氏菌．大多数研究使用常规培养和生化试验报告了FBP的患病率，没有一项研究使用分子诊断技术检测致病性大肠杆菌在人的粪便中。在这两种病原体中，基于医疗机构的研究中的患病率高于基于社区或非医疗机构的研究(表2)2)．

用于计算FBD在环境中的汇总流行率估计值的环境样本包括:动物源性食品(ASF)、水、RTE食品以及来自食物和人类接触表面的棉签。我们发现，这两种FBP的研究和报道并不平等，大多数综述研究都是针对这两种FBP进行的大肠杆菌比沙门氏菌报告研究。的流行范围很广大肠杆菌,在胴体和零售肉类接触表面以及大型动物粪便中，分别从最低0.35%增加到最高81.3%。流行沙门氏菌范围为0至57.5%，依次为饮用水和其他每日可摄取食物(表3.)．

的实际研究年份(实际数据收集和实验室分析期间)的变化沙门氏菌和致病性大肠杆菌分析了2000年至2020年埃塞俄比亚的气候变化(表3.)．总体而言，本综述中大约50%的FBP研究是在2011年至2015年期间进行的，在此期间，基于环境样本的FBP研究是主流研究。然而，在2000年至2010年和2016年至2020年期间，对人类(粪便样本)进行的FBP研究数量高于对环境样本进行的研究(图2)。3.)．此外，目前的综述表明，与实际研究期间相比，发表的时间延迟了长达6年，在这种情况下，可能很难根据文章的发表年份来估计FBD的发生率。

研究人员分析了来自120份手稿的34,747名研究参与者和22,113个环境样本，以计算20年来关于四种FBP的报告中FBD/FBP的总体汇总患病率:沙门氏菌,致病性大肠杆菌，志贺氏菌而且弯曲杆菌。，埃塞俄比亚数据。在没有亚组的情况下，人类和环境样本分别进行分析，然后合并以估计总体汇总患病率。随机效应荟萃分析模型中FBD的总流行率估计为8%，95% CI: 6.5-8.7。因此，FBD的合并患病率估计在统计上较高(P环境样品中< 0.01)(11%;95% CI: 8.8-14.1)高于人粪便(6%;95% CI: 5-6.94)．计算得到的Cochran 's Q值(χ²(45) = 5316,p< 0.01)表明埃塞俄比亚FBD的人类和环境样本分析存在显著的真实异质性。

FBP的亚组元分析

在当前的荟萃分析中，从纳入的94个样本中提取了36002个样本(17729个人类粪便和18273个环境样本)沙门氏菌和致病性大肠杆菌研究。亚组分析是通过将分类调节因子内的研究分为亚组来进行的，例如样本来源(如人类粪便和环境样本)，测试的细菌病原体(沙门氏菌而且大肠杆菌)、国家的行政区域州、学习年份和我们研究设计中考虑的其他变量(图。2)．然而，如方法学部分和筛选程序所述，有关的数据志贺氏杆菌而且弯曲杆菌仕达屋优先计划．被排除在亚组元分析之外。的独立亚组分析沙门氏菌而且大肠杆菌表明环境样本的流行率估计显著较高(10.5%;95% CI: 8.1-13.5)高于人粪便(5%;95% CI: 3.7-6.55)．在存在子组的情况下，所有研究的总结比例估计值可能与不存在子组时的估计值不同[34］．这是因为不同的估计τ²在不同的情况下使用。Borenstein等人[34]也描述了，随机效应模型被用来组合每个亚组内的研究效果，并且通过固定效应模型来检验各亚组间效果之间的显著差异。

我的²显示96%的变异可归因于真实的异质性(表5)．因此，两项研究之间存在显著的差异，进一步的亚组分析和元回归被用于确定异质性的来源。的综合流行率大肠杆菌较高(p< 0.05)沙门氏菌环境样本(13%)和人类粪便样本(7%)中都有。结果还显示了致病性大肠杆菌而且沙门氏菌对埃塞俄比亚FBD的总体合并患病率估计分别贡献了11.6% (95% CI: 8.8-15.1)和5.7% (95% CI: 4.7-6.8)。4；5)．

流行病学因素相关亚组分析

来确定沙门氏菌和致病性大肠杆菌埃塞俄比亚不同环境下的患病率变化，本综述中考虑的每个主要研究变量进行了单独的亚组分析(图2)。2)．对于行政区域州或市议会，人类粪便样本的结果显示，显著最高的患病率(8%，p< 0.01)来自亚的斯亚贝巴，其次是迪勒达瓦和哈拉里地区州。FBP的患病率最高(6.4%;95% CI: 4.1-8.9)在2011年至2015年期间发病率最高的UFC年龄组中报告。关于诊断技术，大多数FBP是通过常规培养板、生化和凝集试验(表面抗原检测)诊断的(表)6)．

对与FBP发生相关的各种危险因素的单独荟萃分析表明，埃塞俄比亚不同环境样本之间FBP的发生在统计学上存在差异。患病率最高的是沙门氏菌和致病菌株大肠杆菌， 36.1% (95% CI: 17.4-60.2)在RTE食品中报告。该研究还表明，这些FBP在阿姆哈拉州比在埃塞俄比亚其他地区更为普遍。基于亚群分析的环境样本也表明沙门氏菌而且大肠杆菌到目前为止，埃塞俄比亚西北部地区的病原体比本综述中包括的其他研究地区或地区重要。沙门氏菌而且大肠杆菌FBP在ASF中也很重要，估计在肉(胴体)及其接触表面的患病率分别为7.4% (95% CI: 4.5-11.8)和3.8% (95% CI: 1.9-7.6)。另一方面，发生FBP的家禽产品及其接触表面和动物粪便依次为12.8% (CI: 5.6 ~ 26.4)和10.9% (CI: 5.1 ~ 22.0)(表2)7)．

多元回归

我们观察到，当对研究进行整体评估时，人类和环境样本中FBP的异质性很高(I²= 96%;τ²= 1.3P= 0.00)5)．因此，在meta回归分析中，我们将样本量作为离散变量，并将其分类，以探讨影响患病率估计的主要因素和异质性来源。与此相一致，对FBD的总体患病率估计以及基于FBD估计的人类和环境样本中包含的每个变量进行了元回归分析。元回归分析显示，总体流行率估计值并未因实际研究年份和研究地区或城镇而显著改变(p> 0.05)。然而，涉及的行政区域国家、地理区域、FBP (沙门氏菌或大肠杆菌)、发表年份、样本来源(来自人类或环境)和分类样本量显著影响点流行率的估计(P< 0.05)8)．

显著变量(p< 0.05)进行多元元回归分析。多元元回归分析表明，只有区域行政国家被标记为其他，FBP沙门氏菌，粪便样本和小于100的样本量与FBP的汇总流行率估计值有统计学相关性9)．

基于FBP估计的人类和环境样本中包含的每个变量也分别进行了元回归分析。环境样本源分析的预测因子包括行政区域州、地理区域、样本类型、发表年份、细菌属、实际研究年份、具体研究区域(区)和分类样本量。此外，患者年龄、样本类型、研究设计和用于该研究的诊断技术也被纳入对来自人类样本的FBP估计值的单变量元回归。单因素meta回归分析显示，人类粪便中FBP的患病率估计仅因研究的地理区域而显著改变(p< 0.05)。对于基于FBP估计的环境样本，实际研究年份，出版年份和分类样本量，由于它们具有显著性(P≤0.05)。

多因素荟萃回归分析表明，埃塞俄比亚西北部和南部的地理区域对基于粪便的FBP流行率估计有显著影响。另一方面，2011-2015年期间的实际研究年份与分类样本量≤100,101-200和201-300之间存在显著相关性(p< 0.05)与基于FBP流行率估计的环境样本(表10)．

埃塞俄比亚总体食源性病原体(FBP)估计

自人类诞生以来，食源性疾病(FBD)一直是所有社会的一个问题。然而，这些疾病的类型、严重程度和影响一直在变化，在不同区域、国家和社区之间仍然存在差异[125］．根据2000年至2020年在埃塞俄比亚9个行政州和2个市议会进行的120项研究，这项综述确定了致病性大肠杆菌，沙门氏菌，志贺氏菌，弯曲杆菌。是常见的FBP，已在人类粪便、动物源性食物、其他非动物源性食物和与食物有关的接触表面中报告。目前的荟萃分析表明，埃塞俄比亚FBP的总体合并患病率估计为8%;95% CI: 6.5-8.7，差异有统计学意义(P环境样品中检出率< 0.01)(11%;95% CI: 8.8-14.1)高于人类(6%;5 -(表6.9)4)．包括非洲猪瘟在内的环境样本中较高的流行率表明该国的卫生水平较高。Havelaar [126]，并报告说，FBD在发展中国家发病率较高，因为它与贫困密切相关。世卫组织食源性流行病学参考小组(FERG)也估计全球约35%的FBD负担是由非洲猪瘟引起的[126］．

的总体流行率估计沙门氏菌和致病性大肠杆菌经94项研究计算为7.4% (95% CI: 6.1-8.9)， I²显示96%的变异可归因于真实的异质性(表5)．元回归分析还显示，FBD致病病原体、样本来源、行政区域、地理区域、样本量和发表年份等大多数危险因素均显著改变(P< 0.05)的总体患病率估计值沙门氏菌而且大肠杆菌埃塞俄比亚(表格)8而且9)．对2000年至2020年进行的单独亚组荟萃分析也描述了这一点沙门氏菌而且大肠杆菌,依次占5.7% (95% CI: 4.7 ~ 6.8)和11.6%;(8.8-15.1)全国FBD总患病率的总和。7个非洲国家先前报告的FBD总体平均患病率为34.2% [6远高于目前汇总的流行率估计值。患病率差异可能是由于FBD患病率估计综述中FBP数量的差异，在我们对4例FBP的案例研究中。

此外，肠致病菌喜欢属沙门氏菌和致病性大肠杆菌(主要是致肠病的大肠杆菌(EPEC),肠出血性大肠杆菌(肠出血性大肠杆菌)和肠侵入性大肠杆菌(EIEC)是人类食源性感染的普遍和重要原因，特别是在包括非洲国家在内的发展中国家。这可能是由于难以确保最佳卫生的食物处理方法[7，127］．除此之外，大多数已知的人类传染病和大约四分之三的新出现的传染病来自动物[12，23，128］．沙门氏菌，特别是鼠伤寒沙门氏菌和肠炎沙门氏菌，是引起人类感染的最常见血清型，与其他已知的人类病原体血清型一样，经常在农场动物中被检测到[129，130］．鸡蛋及家禽产品被认为是传播人类沙门氏菌病的主要媒介[131，132］．为了降低FBD的高患病率，一个关键的挑战是采用在高收入国家已被证明成功的方法，以经济和文化上可接受的方式推广到低收入和中等收入国家[126］．

另一方面，目前的系统评价表明，在发表日期和实际研究期间之间存在长达6年的延迟期[28，59，77］．这可能是基于文章发表年份估计区域或国家一级FBD发生率的时间窗口偏差的来源。埃塞俄比亚对FBP进行的系统综述和荟萃分析很少，现有报告仅评估了发表偏倚的证据[26，133]并且没有报告实际研究期间作为偏倚来源。因此，研究结果需要在研究结束后立即发表。这有助于最大限度地减少这种偏见，并向利益相关者传播最新信息。

FBP，沙门氏菌和致病性大肠杆菌，在人的粪便中

的综合流行率沙门氏菌而且大肠杆菌来自51项进行的研究，对从住院患者、门诊患者和基于社区的研究设计中收集的粪便样本进行病原学隔离或检测。在2000年至2020年期间，病原体的合并患病率为5%;95% CI: 3.7-6.55)，不过沙门氏菌而且大肠杆菌在埃塞俄比亚，不同流行病学危险因素的综合发病率差异得到了证实(表2)6)．与此相吻合的是，发病的致病率聚集在一起大肠杆菌(7.95%可信区间:3.7 ~ 13.1)沙门氏菌(5%;95% CI: 4.0-6.2)(图;4；5)．人、动物和环境样本中FBP流行率的变化可能归因于该国动物-人感染水平和或食品污染。因为,沙门氏菌而且大肠杆菌,偏爱人类和动物宿主的消化道，它们在其他栖息地如水、环境和食物中的存在代表粪便污染[134，135］．在埃塞俄比亚，营养不良(营养不良)、艾滋病毒/艾滋病、不卫生的生活环境以及人与动物之间的密切关系等因素可能在很大程度上导致沙门氏菌病的发生[27，29),大肠杆菌感染(39，73，83，136］．使用的报告数量不平等也可能是病原体之间差异的一个来源，其中对病原体进行的研究数量较多沙门氏菌sp .比上的研究更符合筛选条件大肠杆菌为目前的审查。

在埃塞俄比亚的九个行政区域州(包括SNNP的Sidama地区)和两个市议会中，在六个区域州和两个市议会中进行的研究表明，亚的斯亚贝巴报告的患病率最高，其次是Dire Dawa和Harari区域州的综合估计。在亚组分析中被指定为“其他”的提格雷州和甘贝拉州进行的研究表明，估计的流行率最低沙门氏菌而且大肠杆菌．分析还显示FBP患病率在地理和特定研究区域或城镇之间的变化。从这个角度来看，沙门氏菌而且大肠杆菌在埃塞俄比亚中部、东部和西南部更为重要，合并患病率分别为7.6、6.6和5.7%。然而，元回归分析显示FBP的合并患病率在统计学上是不同的(P在埃塞俄比亚西北部和南部进行的研究结果(表2)10)．就具体研究地区而言，阿姆哈拉地区的Bahir Dar镇和Gondar镇的患病率分别最高和最低(表2)6)．

目前的汇总流行率估计沙门氏菌和致病性大肠杆菌在人的粪便中，5%，与Eguale等人报告的基于卫生设施的横断面研究结果相当。[29Beyene和Tasew [57]，他们的报告为6.2%沙门氏菌亚的斯亚贝巴和Jimma分别流行。然而，先前在亚的斯亚贝巴进行的另一项研究报告，致腹泻细菌病原体的患病率高于目前的患病率估计数[41］．年患病率高达13.8%大肠杆菌也有报道来自Debre Markos [48］．另一方面，发病率较低大肠杆菌［41，44),沙门氏菌［41]之前分别在Hawassa和Debre Markos报道过。所观察到的这些病原体在各地区或地理区域之间流行的异质性，可能与生活在该地区和地区或城镇的人们在经验和卫生措施意识方面的差异有关。本综述中使用的文章没有涵盖所有地理区域，该地区城市和农村地区的研究报告也存在事实差异，这可能是造成差异的另一个因素。另一方面，由于此前没有埃塞俄比亚人粪便中FBP的meta分析报告，因此汇总患病率的比较存在数据差距。

包括DEC和NTS在内的肠道细菌病原体及其产物是引起急性腹泻的主要原因[7，136］．同样，我们发现在本分析中考虑的腹泻、非腹泻和不明粪便的粪便样本中，FBP的患病率估计存在差异。非腹泻患者患病率最低，为3.3%(1.8 ~ 5.8)。该综述还揭示了合并流行沙门氏菌而且大肠杆菌在不同年龄组之间的差异(表6)．显著性最高的患病率为(6.4%;95% CI: 4.1-8.9)在2011年至2015年期间UFC发病率最高的年龄组中记录。在此期间较高的患病率可能与本综述中包括的大多数研究都是在2011年至2020年期间进行的有关。然而，2016年和2020年期间患病率的降低可能意味着公众对FBP的认识很少，可能不会被削弱。15岁以下、成人和所有年龄组类别的患病率估计数为4.7%;95% ci: 2-10.6, 4.2%;95% CI: 2.6 ~ 6.7和4.2%;95% CI: 2.1-8.1。

同样，Ayana等人此前也报道了不同地理区域FBP在年龄组类别中的患病率和地理分布的差异[137］．

与这项研究相比，6.5%沙门氏菌据报道，亚的斯亚贝巴UFC的患病率较高，UFC中FBD的比例较高可能与幼儿较低的免疫状态有关[71］．沙门氏菌感染，特别是NTS感染，通常会引起自限性胃肠炎，症状为腹泻、腹痛和呕吐，适用于所有年龄的人[29，129］．饮用私人井中未经处理的水和在地表水中娱乐也是FBD的危险因素，如散发沙门氏菌病在儿童中[138］．内在危险因素也可影响NTS和致泻性的发生大肠杆菌．由于恶性贫血或抗酸剂和H-2阻滞剂引起的婴儿胃酸不足可使人易患沙门氏菌病［139］．恶劣的环境条件、社会经济地位和行为因素也与腹泻疾病传播的风险密切相关。在埃塞俄比亚，大约13%的5岁以下儿童患有腹泻，根据2011年世界卫生统计，埃塞俄比亚27%的UFC死亡是由于腹泻疾病[140］．

除了埃塞俄比亚，Harb等人。[132]也提到了FBP的流行情况沙门氏菌在5岁以下儿童中通常较高，由于包括样本来源和类型在内的许多因素，各国的污染率有所不同。另一项研究还报告说，腹泻病是发展中国家幼儿患病的最重要原因之一。在婴儿和1至4岁儿童中，该病约造成24 - 30%和25%的死亡[141］．区别在于沙门氏菌人类的流行在本质上是动态的，捕捉国家之间的变化并不令人惊讶。这种变化可能归因于影响食物和水中NTS水平的几个因素，这些因素在人类接触感染方面发挥着重要作用[131，132］．在本研究中，使用较小样本的研究发现患病率最高，而分析样本量在300至400之间的研究报告患病率最低。然而，在样本量≤100个类别中观察到的显著性估计可能并不完全显示真实的效应量，因为小规模研究可能产生假阳性结果，或者小样本量可能高估了关联的大小[142］．

总的来说，较高的合并患病率沙门氏菌和致病性大肠杆菌在采用基于卫生设施设计的研究中比在基于社区或非卫生设施机构的研究类型中记录的要多(表6)．较高的FBP患病率可能是因为入住医疗机构的病人可能接触过至少一种病原体，这可能与患者入院时的临床体征和症状的发展有关。本综述中使用的大多数研究报告都是使用常规培养和生化、凝集试验进行的。没有一项研究采用分子诊断技术检测致病性大肠杆菌在人的粪便(表2)．此外，常规培养和生化检测为病原检测基础，占5.9%;95% CI: 3.4-9.9的研究中，也使用了抗血清(凝集)试验。在4.7%;95% CI: 3.3-6.3个研究;然而,沙门氏菌和致病性大肠杆菌仅通过培养和生化试验检测。

用于分离和鉴定病原体的方法和实验室协议在各个研究中是不同的。分子诊断技术没有被考虑用于比较诊断技术估计，因为它只在三个研究中使用(表6)．然而，像基因型鉴定这样的分子方法仍然是最受欢迎和最可靠的技术，被推荐用于区分粪便菌群中的致腹泻菌株和非致病性成员[143］．它避免了表型分析的所有不便，如细菌在不同培养基中培养时酶活性的变化，生化突变体的出现，以及存在非常密切相关且具有相同表型但不同基因型的不同物种菌株[144］．生物的分子特征为疫情调查、归因研究和潜在毒性或流行潜力评估提供了标记物[143］．

然而，在疾病诊断中通常使用常规培养和生化测试，这意味着很少关注FBD的检测，部分原因可能是由于国内先进的实验室设施有限。此外，获得先进设施的机会有限，阻碍了病原体的有效性和深度表征。现有研究还表明，在埃塞俄比亚，人们对细菌病原体对公共卫生的影响知之甚少大肠杆菌由于缺乏完整的记录系统和综合监测，被称为FBP [145］．因此，需要一种全面的调查方法，作为实现基于证据的预防和缓解战略的投入。

FBP，沙门氏菌和致病性大肠杆菌，在环境样本中

目前荟萃分析筛选的43项研究的结果也确定了大肠杆菌而且沙门氏菌是埃塞俄比亚不同环境样本中常见的FBP。系统评价显示最高的流行率大肠杆菌为81.3%(73.43-87.25)。96]来自埃塞俄比亚北部，而对应于沙门氏菌为57.5%(41.96-71.69)，在埃塞俄比亚西北部地区调查[One hundred.］．最低的患病率报告为0.35%大肠杆菌埃塞俄比亚中部的尸体[37]和0%沙门氏菌［116］．与人类FBPs的情况相反，有更多的符合条件的研究大肠杆菌来自环境样本，这些样本覆盖的地理区域也比研究范围更广沙门氏菌spp。(表3.)．同样，在先前的研究中，不同食物和其他环境样本中的细菌FBP也有变化[8，146］．

与人类粪便的流行率一致，最高的汇集流行率为大肠杆菌而且沙门氏菌报告的样本量≤100。因此，不同研究人员分析的样本量和样本类型的差异也可能归因于FBP患病率的差异。与人类病例不同，最高流行率是沙门氏菌而且大肠杆菌的报告，这可能与埃塞俄比亚越来越多的高等教育和研究机构有关，这些机构一直在提高病原体检测的能力，从而最大限度地减少假阴性病例。另一方面，在样本量≤100时，较高的患病率估计可能是由于不确定性的影响。样本量越大，结果越可靠，精度越高，掩盖不确定性影响的能力越强[142］．同样，本综述中纳入的2016-2020年研究期间基于环境样本的研究数量也少于2011 - 2015年研究期间的研究数量。

总的来说，环境样本的汇总流行率沙门氏菌而且大肠杆菌为10.5% (8.1 ~ 13.5)，I²= 96%， Q(p) = 1924(0.00)5)，实际研究年份、发表年份和分类样本量显著影响(P患病率估计值< 0.05)10)．目前食品中的综合流行率与不同研究的报告有部分可比性[26，133，147］．的综合流行值大肠杆菌， 15%，最近由Assefa和Bihon报告[26她来自埃塞俄比亚。9%和10%的合并患病率沙门氏菌在先前的研究中，非洲猪瘟和禽肉中也分别发现了[133，147］．目前的综合流行率沙门氏菌和致病性大肠杆菌在环境样本中，为10.5%(表5)的综合流行率，却高于大肠杆菌在肉类及肉制品中报告[133］．

在所分析的样本类型中，最高的患病率(p< 0.01)在即食食物(即不同街头售卖的食物，如bonbolino、sambusa、fuol、煮土豆、即食蔬菜、白露苹(Lupinus白色)等在埃塞俄比亚街头吃的食物)。结果还报告了沙门氏菌而且大肠杆菌分别在7.4% (95% CI: 4.5-11.8)和3.8% (95% CI: 1.9-7.6)的肉(胴体)及其接触表面。另一方面，发生FBP的家禽产品及其接触表面和动物粪便依次为12.8% (CI: 5.6 ~ 26.4)和10.9% (CI: 5.1 ~ 22.0)(表2)7)．其他可用的研究，平均报告较高的患病率大肠杆菌,生食占37.6%，即食食品占31.6%。其相应的患病率为沙门氏菌贝宁、博茨瓦纳、加纳、肯尼亚、尼日利亚、苏丹和乌干达7个非洲国家的死亡率分别为19.9%和21.7% [6］．非洲猪瘟对FBD负担的相对贡献在各分区域之间以及同一分区域内各国之间差异很大[126］．表面上健康的动物尸体通常被认为没有细菌病原体，但污染发生在屠宰场。然而，的发生大肠杆菌而且沙门氏菌spp埃塞俄比亚非洲猪瘟发病率很高，原因有很多，如露天非法屠宰动物和屠宰场不卫生的屠宰做法[148，149］．由Tadesse和Gebremedhin证明[148]，而有关人员在内脏取出、屠体检查、屠体处理等方面的技能，以及屠房的卫生标准，亦可能导致不同研究中出现不同的FBP发生率。此外，肉类污染沙门氏菌。也与被屠宰的动物物种显著相关。沙门氏菌spp。山羊尸体、牛肉尸体、碎牛肉及牛奶的患病率分别为3.86、4.53、8.34及10.76% [148］．之前的一项研究也报告了较高的患病率沙门氏菌在埃塞俄比亚，屠宰后的牛、绵羊和山羊分别为7.1、8.4和9% [150］．

在本荟萃分析中，生牛奶中FBP的合并患病率为22.8%(12-39.1)，其他乳制品中FBP的合并患病率为15.3% (5.6-35.8)7)．然而，Keba等人的一项研究[8]，来自埃塞俄比亚的研究报告只有6%和10%的合并患病率沙门氏菌而且大肠杆菌分别在生牛奶中。另一方面，Abunna等人进行的研究[151[煮沸的牛奶和贝达萨等。]91]报告没有大肠杆菌积极的样本。类似地，Tesfay等人。[152]和Ejeo等人。[114没有发现沙门氏菌在巴氏灭菌奶和其他加工乳制品样品中。这支持了一个概念，即不常见的检测病原体像大肠杆菌而且沙门氏菌在加工过的乳制品中，但在加工后的产品处理过程中，直到消费时间，病原体可以作为污染物进入食物链。具体地说,大肠杆菌是粪便污染的标志，较高的流行率表明卫生习惯水平下降[6，153］．Paudyal等人[6]，并解释了食物类型的差异以及不统一的采样和识别方案可能导致异质性，尽管由于生食和即时食用食物种类繁多，一些高流行率数据可能是事实。FBP在不同食品和其他环境样本中的显著流行可能与食品的交叉污染有关。

安全饮用水，又称饮用水，是指不含有害或潜在有害物质，对人体健康不构成任何风险的水[154，155］．然而，一项研究明确报告了3.3%沙门氏菌食水的流行程度[117］．我们的研究还显示38.8%和11.5%的联合患病率估计沙门氏菌和致病性大肠杆菌分别在河水和废水中。目前的审查结果部分与Desta [156， Tsega等人。[157]和麦拉库[154他们报告说，饮用水中总大肠菌群和粪便大肠菌群数量的比例高于建议的国家和国际标准。迪诺等人。[138]报告称，饮用未经处理的私人水井水和在地表水中娱乐是FBD的危险因素。此外,这两个沙门氏菌而且大肠杆菌通常生活在健康和疾病状况下的肠道，这可能会增加不同食物和饮用水的污染和交叉污染。这些病原体自然也存在于环境中以及家养和野生动物中[6，146］．部分动物为无症状携带者;因此，它们在FBD的流行病学分布中起着突出的作用[79］．

一般来说，FBP的发生可能因不同的危险因素而异，但很难确定可能导致FBP患病率高度异质性的具体因素。由于在不同卫生条件下加工或处理的食品种类繁多，流行率数据可能是真实的。如现有研究所述，大多数FBP不是内源性污染物，而是在处理、加工和制备过程中作为外源性污染物引入的[5，6］．对环境样本中与FBP发生相关的不同风险因素进行的单独分析也表明，埃塞俄比亚各行政区域或市议会之间FBD的发生存在显著差异。值得注意的是，最高的患病率(p< 0.01)的沙门氏菌和致病性大肠杆菌报告来自阿姆哈拉地区(表7)．这种差异可能是由于不同的诊断方法、样本量和研究地点等原因造成的[26］．然而，埃塞俄比亚中部报告的最低流行率估计为6.5%(4.3-9.7)，这可能意味着该国首都亚的斯亚贝巴及其周围地区对FBP的认识相对较高。由于人类和环境卫生专业人员以及动物卫生或兽医之间的合作不充分，在不同级别上缺乏定期报告和不平等地获得FBD数据，这也是区域和地区之间存在差异的一个原因。事实上，埃塞俄比亚主要相关部门之间的信息共享和沟通很差，几乎没有应对疾病暴发和其他与健康相关危害的多部门工作机制[158］．

研究的局限性

这项研究有一些局限性，这显然是预期从这样的研究。可能的偏差来源包括纳入/排除标准、选择的数据库、日期、语言、纳入的文章数量以及本研究选择的文章类型。此外，用于分析的病原体数量较少也是一个局限性。，只有致病性大肠杆菌，沙门氏菌，志贺氏杆菌而且弯曲杆菌，被纳入研究，以确定埃塞俄比亚FBP的总体汇总患病率。这可能会对FBP合并患病率的统计估计产生影响。我们认为，每个亚组变量的研究数量是不恒定的(图。2)也可能影响亚组分析的结果，因为在少数亚组中也纳入了不到10项研究。此外，大多数纳入的研究采用常规培养和生化试验检测FBP。因此，我们的研究只给出了埃塞俄比亚FBP的总体情况，无法估计每种血清型或病理型的相对重要性。

总之，细菌FBP的总流行率估计为8%，环境样本中的流行率估计相对高于人类粪便中的流行率估计。具体来说，FBP的发生有很大的变化沙门氏菌而且大肠杆菌,在不同的流行病学背景下，比如在不同的食物中，食物接触表面以及在年龄组类别中。另一方面，目前的综述强调FBP在埃塞俄比亚所有年龄组类别中都很重要，尽管流行率估计显著最高，6.4%， UFC报告。

此外，在本次综述中大多数符合条件的研究中，FBP是通过常规培养和基于生化测试的诊断技术确定的，这意味着非常需要先进的实验室协议来加强埃塞俄比亚FBD的诊断和检测。此外，几乎所有检索到的研究都是在人类、动物或环境样本中以碎片化的方式进行的，这表明该国在疾病来源归属方面存在研究差距。因此，需要利用先进的诊断技术在人、动物和环境界面进行进一步的FBD研究，以便以一体化的健康方法调查人或动物感染的来源归因。

本系统综述和荟萃分析中使用的数据已在研究中提供，其余数据也可通过通信作者的请求获得。另外，作为补充文件附件1与本文一起提交。

ASF:

动物性食品

客服人员:

中央统计局

肠出血性大肠杆菌:

肠出血性大肠杆菌

EIEC:

Enteroinvasive大肠杆菌

EPEC:

致肠病的大肠杆菌

定期监测:

食源性疾病

出口押汇:

食源性病原体

参考小组:

食源性流行病学参考小组

nt:

非typhoidal沙门氏菌

聚合酶链反应:

聚合酶链反应

RTE食物:

准备好吃的食物

SNNP:

南方国家、民族和民族

生:

五岁以下儿童

作者要感谢哈拉马亚大学在研究期间提供的免费互联网接入。

该研究是FOCAL(非洲中低收入国家食源性疾病流行病学、监测和控制)的一部分。FOCAL是一个由比尔和梅林达·盖茨基金会和英国政府外交、联邦与发展办公室(FCDO)共同资助的多伙伴多国研究项目(赠款协议投资ID OPP1195617)。

作者及隶属关系

1. 哈拉马亚大学兽医学院，埃塞俄比亚迪勒达瓦138号信箱

   Dinaol Belina

2. 哈拉马亚大学农业和环境科学学院，埃塞俄比亚，迪勒达瓦

   尤纳海驴

3. 国家食品研究所，丹麦技术大学，林比，丹麦

   Yonas Hailu, Tine Hald和Patrick Murigu Kamau Njage

4. 哈拉马亚大学卫生和医学学院，埃塞俄比亚，迪勒达瓦

   Tesfaye Gobena

贡献

总体而言，所有作者都参与了方法设计、数据提取、结果展示和讨论。具体来说:DB:参与研究变量或结果的识别(图。2)及发展搜寻字词。DB还进行了文章收集和重复删除，数据提取以及数据分析和结果解释。YH:执行研究变量或结果识别的细节，他还参与了文章收集和第一和第二筛选过程。TG:在搜索词开发方面有贡献，在整体筛选方法方面有很高的贡献，并协调了第二阶段的筛选流程和参考文献管理。TH和PMK:进行总体框架综合，并对meta分析结果进行解释和讨论。所有作者都阅读并批准了最终的手稿。

相应的作者

对应到Dinaol Belina．

伦理批准并同意参与

这篇论文是根据回顾的数据准备的，不涉及任何样本收集。因此，按照埃塞俄比亚政府的规定，不需要伦理批准和参与者同意。

发表同意书

所有作者都同意发表这项研究。

相互竞争的利益

所有作者都阅读并批准了最终的手稿。其内容完全是作者的责任。所有作者都宣称他们没有竞争利益。

出版商的注意

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