跳到主要内容

职位空缺

如果您想在您的实验室发布招聘广告,请通过以下链接与我们联系链接(位于页面的左上角)。


法国居里研究所布尔赫斯实验室招收博士后
我们正在寻找一位充满热情和高度积极性的候选人加入居里研究所(巴黎,法国)的Bourc 'his实验室,研究逆转录转座子与宿主基因组之间的相互作用,在种系发育和早期胚胎发生的背景下。利用小鼠模型,我们广泛地对确定哺乳动物基因组发展的防御策略感兴趣,以防止反转录转座子干扰生殖适应性,并解决反转录转座子对基因组组织和功能的影响(有害或有益)。我们结合小鼠遗传学,分子和细胞生物学,全基因组筛选,基因组和转录组分析,通过短读(包括单细胞)和长读测序,然后采用适应的计算方法研究重复转座元件。我们的最新成果包括确定m6A RNA甲基化是逆转录转座子降解的信号(Chelmicki等人,Nature 2021),逆转录转座子在DNA甲基化酶进化中的作用(Molaro等人,Mol Biol evolution 2020;Barau等人。Science 2016)以及生殖系DNA甲基化对生育能力和下一代表型编程的短期和长期作用(Dura等人,bioRxiv 2021;Greenberg et al., Nature Genetics 2017)。

我们的团队位于居里研究所(位于巴黎市中心)的遗传和发育生物学部门,居里研究所是欧盟首屈一指的科学机构,在一个高度动态、多元文化和包容的环境中提供最先进的核心设施和平台。

需求

良好的博士学位记录在遗传学,分子生物学,细胞生物学方面有很强的背景自主性和推动项目的能力转座子生物学知识:可取但不是必需的以前有过小鼠模型(体内和培养细胞)的经验:资产但不是必需的生物信息学专业知识:资产但不是必需的良好的英语口语和书面水平(法语不需要)

提供
开始日期:任何时间

资金:18个月的合同,续签一次。薪酬将按照居里研究所博士后奖学金的指导方针执行。候选人还将申请独立资助;在整个申请过程中,将提供协助和指导。

候选人的职业发展将得到强有力的支持,并将受益于居里研究所培训部门提供的技术和软技能课程。将提供指导学生的机会。

应用程序的细节
我们正在审核收到的申请;我们鼓励考生尽快提交申请。

请发送至Deborah.Bourchis@curie.fr

-简历,包括出版物清单(包括预印本)和通讯
-求职信,概述过去的研究经历,加入我们团队的动机和职业目标
-两位推荐人的姓名/联系方式

英国埃克塞特大学生命与环境科学学院招收博士后研究员
学院希望招聘一名博士后研究员参加BBSRC资助的职位,该职位的招聘时间为21年4月28日至23年4月28日,如果找到合适的候选人,则在此之前。

对转座因子进行研究是一个令人兴奋的机会。成功的候选人将分析来自不同生物体基因组的转座元件,以解决关于转座元件进化,多样性和与宿主基因组相互作用的基本悬而未决的问题。

这项研究将涉及广泛的进化和计算分析,包括涉及脚本的生物信息学方法。申请人必须拥有相关的博士学位,并能够在更广泛的学科中展示足够的知识,以及他们在既定研究计划中应用研究方法和技术的经验。

该项目由BBSRC David Phillips奖学金资助Hayward博士。有关海沃德实验室的更多信息,请访问:www.jumpinggenes.org

申请人将有进行生物信息学分析的经验,包括使用脚本语言,如Perl, Ruby或Python。申请人必须拥有相关的博士学位,并能够在更广泛的学科中展示足够的知识,以及他们在既定研究计划中应用研究方法和技术的经验。

了解更多在这里,或更多信息,请联系亚历克斯·海沃德博士,电子邮件alex.hayward@ex.ac.uk或致电(01326)259147。
(2021年4月15日发布)

美国冷泉港实验室招收Schorn实验室博士后
纽约冷泉港实验室Schorn实验室招收博士后。我们感兴趣的是小rna如何识别和沉默转座因子,当它们在哺乳动物发育和疾病中变得活跃。

我们发现,来自成熟tRNA 3'端的tRNA片段(tRF)在经历表观遗传重编程的细胞中高度表达,并在其保守的tRNA引物结合位点(PBS)靶向ltr -逆转录因子或内源性逆转录病毒(erv)。由于3'-tRFs与PBS具有完美的序列互补性,它们在哺乳动物基因组中有成千上万的靶标。3'-tRFs是在未知条件下加工的,可能保护许多真核生物。这是一个令人兴奋的新领域,有很多机会!我们认为trf是RNAi、转座子和基因组稳定性之间的古老联系。

我们正在确定trf与其他小RNA沉默途径的交集及其对多能性和分化的影响。我们的主要工具是细胞培养转位试验,长RNA和小RNA测序,染色质IPs,重复序列的NGS分析,CRISPR等。CSHL提供了一个梦幻般的研究环境和一个伟大的社区。校园距离纽约45-90分钟车程/火车。请将您的兴趣、简历以及三位推荐人的联系方式发邮件给我:aschorn@cshl.edu
(发布于2020年3月15日)

丹娜-法伯癌症研究所烧伤实验室招收博士后
一个博士后职位欢迎加入丹娜-法伯癌症研究所肿瘤病理学系伯恩斯实验室。我们的小组研究人类基因组中的高拷贝数重复序列,以及产生这些序列的反转录转座子和内源性逆转录病毒的生物学。我们和其他人已经证明,这些通常沉默的元件的亚群被表达为人类癌症的标志,这导致癌症基因组中体获得性反转录转座子插入。我们的目标是更全面地描述这一现象;利用肿瘤生长和肿瘤免疫学模型探讨其对肿瘤生物学的影响;并利用我们的理解来指导癌症的检测和治疗。

工作要求
最近获得博士或医学博士学位的有成就和上进心的候选人。在生物医学领域有丰富的分子生物学和细胞生物学经验者优先考虑。分子生物学、细胞培养技术和蛋白质表达方面的技术技能是必不可少的。具有生成和使用复杂数据集(例如,来自ChIPseq, RNAseq,单细胞分析或CRISPR-Cas9正向遗传筛选)或具有化合物筛选经验者优先考虑。有小鼠癌症模型的经验可能是有利的,但不是必需的,并且与动物模型工作不是该职位的要求。

转座元件和重复序列的背景不是必需的,可以“在工作中学习”。相反,项目将位于该领域与成功候选人带来的另一个领域的专业知识的界面。这些专业领域可能包括但不限于:癌细胞生物学;一种特定类型的恶性肿瘤(如卵巢癌、肺癌、结肠癌);DNA修复;表观遗传学;肿瘤免疫学;蛋白质的翻译或翻转。离开实验室担任独立教师职位的博士后将获得重要的许可,可以随身携带项目。

按上面的链接申请,或发电子邮件kburns@jhmi.edu。包括你的研究和职业目标的简短陈述,一份简历,以及三个推荐人的联系方式。作为初始申请的一部分,欢迎博士顾问的推荐信,但不是必需的。
(发布于2020年1月17日)

项目招收博士后:逆转录转座子L1和限制其整合的宿主因子

职位描述:研究逆转录转座子L1如何受到保护基因组的因素的限制,寻求博士后职位。对…有长期兴趣的
TEs如何影响宿主的生物学,我们还研究了裂变酵母中反转录转座子的激活以及整合如何导致对应激的适应。欲知详情及刊物名单,请浏览以下网址:
https://science.nichd.nih.gov/confluence/display/sete/Home

有兴趣的候选人必须拥有博士学位和/或医学博士学位,并在分子遗传学方面有很强的背景。具备生物信息学方面的技能。要申请,请提交一份求职信
信,简历,参考书目,以及三个推荐人的名字:

亨利·莱文博士
尤尼斯·肯尼迪·施莱弗国家儿童健康与人类发展研究所
美国国立卫生研究院
49号楼1A35A室
马里兰州贝塞斯达,20892
电子邮件henry_levin@nih.gov

雇主名称:尤尼斯·肯尼迪·施莱弗国家儿童健康与人类发展研究所

美国国立卫生研究院致力于在其培训和就业项目中建立一个多元化的社区。

博士后研究员,计算生物学和移动元件基因组学

在费城儿童医院(CHOP)和宾夕法尼亚大学(Penn),邢毅博士的实验室正在招募一名博士后来研究移动元素的作用
调节人体细胞中RNA和蛋白质的表达我们的实验室对RNA加工和调控的计算生物学和基因组学及其在人类遗传学、精准医学和癌症免疫治疗方面的应用有广泛的兴趣。我们开发了计算方法和基因组技术,用于研究大块组织和单细胞的转录组学和蛋白质组学复杂性
我们还整合了计算和基因组工具来阐明健康和疾病中的RNA调控网络。我们对了解移动元件如何影响物种特异性RNA调控网络有着长期的兴趣
因此,最近人类转录组和蛋白质组的进化。
我们正在寻找具有杰出研究经验和发表记录的热情候选人。
成功的候选人将从事综合计算和实验研究
环境,并将有机会产生和/或分析大量的第二代和第三代
测序数据阐明如何移动元件塑造转录组和蛋白质组的复杂性在健康或患病状态。我们欢迎来自计算或实验背景的申请人,或两者的结合。
有兴趣的应聘者请将简历和三位推荐人的姓名发送至易星博士邮箱
Yi.Xing@pennmedicine.upenn.edu。欲知更多实验室详情,请浏览https://xinglab.org/
(发布于2019年3月18日)

里昂大学招收博士后

里昂大学生物计量与进化生物学实验室招收博士后,招聘时间为3年,招聘日期为2019年9月。
该项目将研究昆虫的水平基因转移,更具体地说,研究宿主-拟寄生虫相互作用可能是这种现象的主要途径。它建立在长期和广泛的生态描述之间的联系寄生物和鳞翅目寄主在哥斯达黎加的一个自然区域。通过与宾夕法尼亚大学和圭尔夫大学的合作,我们将对该系统中大约200个物种的全基因组进行测序,以评估水平转移是否优先发生在通过宿主-寄生性相互作用紧密联系的昆虫之间,或者在鳞翅目的情况下,通过它们所依赖的宿主植物。
该项目将需要大量参与生物信息学和进化生物学的概念和方法。理想的候选人将对水平基因转移和分子和表型水平的进化生物学有浓厚的兴趣。他或她应该对生物信息学、建模、系统发育和共系统发育分析感到轻松,并受到这些领域方法论挑战的启发。
里昂是一座美丽而充满活力的城市,离阿尔卑斯山不远。的LBBE实验室提供了一个非常活跃的科学环境,处理进化生物学中的许多当前问题,从分子到生态系统,采用不同的方法,从实验台和现场到大数据和纯理论。

申请须提交至Sylvain Charlat (sylvain.charlat@univ-lyon1.fr),截止日期为2019年6月1日。请附上你的简历和三个准备提供推荐信的人的名字。欲了解更多详情,请联系Sylvain或其他团队成员:Julien Varaldi, Vincent Daubin, Vincent Miele, Damien de Vienne(法国国家科学研究院-里昂大学),Clement Gilbert(法国国家科学研究院- gifsur Yvette), Daniel Janzen(宾夕法尼亚大学),Paul Hebert(圭尔夫大学)。

CNRS博士职位
我们正在寻找一名博士生,专注于这些实验数据的分析。博士项目沿着两个轴进行定义,第一个轴对应于动态模型的形式化,第二个轴对应于生物信息学分析。这个职位将基于“基因组,行为和生态的进化”单元——法国Gif sur Yvette的一个混合研究单元。

轴1动态的群体遗传学模型将描述群体中转座因子拷贝数和频率的演变。它们将基于转座因子群体遗传学的传统模型[9,10],并将适应最近描述的机制(例如通过小RNA对转座的表观遗传驱动调控,[11])。模型将以随机现象(遗传漂变、重组、突变、抽样效应)为特征,并将用于从实验数据中对感兴趣的参数(如转位率或调节强度)进行统计推断。
轴2生物信息学分析将处理由实验种群测序产生的数据。博士候选人必须推断新的转座因子插入位点,以及它们在种群中的频率。标准和/或特别统计方法(如位点频谱分析)将被应用于重建基因组入侵过程中转座因子的进化和分布。

所需技能和培训
我们正在寻找受过生物信息学、统计方法和动力系统分析训练的学生。博士候选人应该有计算机科学的基础训练,包括编程(我们研究小组使用的编程语言是R, Python和c++)。在群体遗传学或进化生物学方面有扎实的经验。良好的英语听说读写能力。
要了解更多并申请该职位,请访问网站在这里
(2019年2月27日发布)

华盛顿西雅图系统生物学研究所Smit实验室招收博士后
该实验室专注于转座因子(TE)生物学的研究,并利用序列建模、系统发育重建和同源性检测的最新发展进行进化。我们开发了一些用于te研究的最广泛使用的工具和数据库,包括RepeatMasker, RepeatModeler, Repeat Protein Database和Dfam。
该职位提供了一个机会,可以与蒙大拿大学的惠勒实验室合作,帮助塑造新的Dfam社区资源的未来
与美国国立卫生研究院的合作该项目将包括调查和推进新的技术图书馆生成方法,开发新的技术家庭分类方法,设计技术建模的质量指标和标准,为研究社区和建设/研究提供技术家庭管理援助
TE家族在一组独特的新测序物种。

工作要求
申请人应持有(或即将获得)博士学位,并具有TE生物学和基因组学方面的经验。有TE库工作经验
代/策展,基因组生物学和基因组进化被认为是一个主要的优势。应聘者应具备较强的沟通和数据分析能力
在同行评议的出版物中有主要作者的记录。成功的候选人对科学充满热情,积极主动,能够工作
一个团队。
如果您有兴趣加入实验室,请上传您的简历,其中包括您当前研究的简要描述以及2-3个联系人,以供参考
https://systemsbiology.org/about/careers/。(请注意,该职位列在Hood-Price实验室广告的下方。)
(发布于2019年2月25日)

沃兹沃斯中心招收博士后

Joan Curcio和Alexey Khodjakov的实验室

研究Ty1逆转录病毒样转座子对非对称细胞分裂的影响酿酒酵母。Curcio实验室长期以来一直对逆转录病毒样转座子与其真核宿主之间的关系感兴趣。我们最近的工作探讨了Ty1病毒样颗粒(VLP)组装的宿主控制。Ty1 RNA在称为逆转录体的细胞质焦点中被翻译并包装成VLPs。在与Khodjakov实验室的合作中,我们发现逆转录体的形成不对称地局限于母细胞;此外,促进逆转录体形成的条件破坏了纺锤体极体(SPBs,酵母中心体)的年龄依赖性分离,这是纺锤体排列和忠实染色体分离的先决条件。定量荧光成像将用于了解逆转录体形成如何影响SPB遗传、纺锤体排列、染色体分离和寿命。将结合遗传学、生化和定量成像方法,探索Ty1 Gag蛋白与SPB组分之间的串扰,以及协调调节逆转录体形成和SPB遗传的信号网络。

有兴趣的候选人必须具有博士或医学博士学位,较强的写作,口头沟通和定量分析能力,以及细胞生物学和/或遗传学背景。有逆转录病毒或转座子生物学经验者优先。申请人应提交求职信,简历,一页纸的研究经历和目标的描述,以及三个或更多的参考人的名字joan.curcio@health.NY.gov或:

琼·库尔乔博士
沃兹沃思中心
纽约州卫生部
医学科学中心
邮政信箱22002
奥尔巴尼NY 12201-2002
美国

(发布于2018年10月25日)

丹佛斯中心博士后助理
斯洛特金实验室目前正在寻找两名有组织和积极的研究人员加入我们的小组。新的博士后将研究转座因子和转基因如何使用尖端技术进行表观遗传沉默,包括:单分子长读测序,全基因组甲基组分析和小RNA深度测序。将考虑湿工作台和计算信息学家,以及这些技能集的任何组合。具有表观遗传学、表观基因组学和/或转座因子研究经验者优先考虑。有关我们研究计划的更多信息,请访问实验室的页面。了解更多关于这个职位的信息在这里。

阿伯丁大学博士奖学金

这项研究的目的是更好地了解基因组进化的基本过程,这些过程仍然知之甚少。该项目将研究转座因子(TEs)在全基因组复制(WGD)后的进化多样化中的作用,并将鲑科鱼类作为理想的研究系统,因为存在对基因组进化产生重大影响的祖先WGD事件,并与谱系多样化有关(例如Lien等人,2016;Robertson et al. 2017)。我们将验证te在WGD后重塑遗传和表观遗传进化,促进适应方面发挥重要作用的假设。

该博士学位是挪威研究项目“转座:最近全基因组复制后基因组进化和适应的转座因子”的一部分。transse是一个为期5年的项目,主管麦昆是合作者。该职位仅对英国/欧洲申请人开放。有关申请资料,请参阅投寄上的说明在这里

德克萨斯大学奥斯汀分校招收博士后

研究方向为噬菌体Mu转位修复机制和大肠杆菌/酵母复制机制修复Flp重组机制。这个过程将在体外和体内使用生化,生物物理和细胞生物学工具进行探索。Mu整合的机制与逆转录病毒相似,我们期望将研究扩展到哺乳动物细胞中逆转录病毒整合事件的修复。Flp研究在癌症治疗中具有应用潜力。

申请人必须在同行评议的期刊上以第一作者的身份发表文章,并具有高度的积极性。在细菌或酵母生物学、DNA生物化学和分子遗传学方面有很强的背景。蛋白质纯化技能是一个必须。对编程和网络分析有基本了解者优先。

德克萨斯州的奥斯汀一直被评为美国最适合居住的地方之一。德克萨斯大学提供有竞争力的福利。申请人应将简历和三个推荐信发送至Rasika Harshey:rasika@austin.utexas.edu

https://sites.cns.utexas.edu/harsheylab

美国国立卫生研究院博士后职位

职位名称:转座因子与HIV-1的基因组和机制研究

招聘博士后,主要研究长端重复反转录转座子和逆转录病毒的作用机制和影响。裂变酵母中的ltr -反转录转座子Tf1粟酒裂殖酵母在结构上与逆转录病毒相似,并使用逆转录和整合机制,这是逆转录病毒复制的优秀模型。整合位点的饱和图谱显示Tf1插入到应激反应基因的启动子中。目前的工作主要集中在染色质因子如何促进整合位点选择。为了确定整合的共同机制,我们生成了人类细胞中HIV-1整合的大规模数据集,并分析了全基因组整合模式。研究人员还对其他转座元件进行了研究,以开发能够生成基因功能全基因组图谱的技术。欲知详情及刊物名单,请浏览以下网址:

https://science.nichd.nih.gov/confluence/display/sete/Home

有兴趣的候选人必须拥有博士学位和/或医学博士学位,并在分子生物学,遗传学或病毒学方面有很强的背景。生物信息学和编程技能将大有裨益。申请时,请提交求职信、简历、参考书目和三个推荐人的名字:
亨利·莱文博士
尤尼斯·肯尼迪·施莱弗国家儿童健康与人类发展研究所
美国国立卫生研究院
49号楼1C32室
马里兰州贝塞斯达,20892
电子邮件henry_levin@nih.gov

雇主名称:尤尼斯·肯尼迪·施莱弗国家儿童健康与人类发展研究所

工作地点:马里兰州贝塞斯达

美国国立卫生研究院致力于在其培训和就业项目中建立一个多元化的社区。

发布:2017年3月16日。


冈萨雷斯实验室
生物信息学博士后招聘进化和功能基因组学实验室,进化生物学研究所(CSIC-UPF),西班牙巴塞罗那Recerca biom公园。
联系他们的实验室了解更多信息。

Kentsis实验室
寻找有才能的人加入斯隆·凯特琳研究所的实验室,纽约,美国。
更多信息请访问他们的网站职业页面

Baidu
map