指数P动态的三个案例研究
在我们呈现整个国家的指数P和蚊媒疾病趋势之前,我们停下来更详细地分析三个城市:阿卡普尔科,Cancún和墨西哥城。我们将重点放在这三个城市,因为它们在气候条件、地理位置、虫媒病毒发病率方面存在重大差异,并受到独特和高度的人类迁移模式的影响。这些差异使这些城市成为评估2000-2020年期间每日传播风险评估指数P的稳健性的理想城市。脚注 2
阿卡普尔科位于太平洋东海岸,属热带干湿气候,其特点是气温高,降水量变化不大。35 ].Cancún位于Yucatán半岛,属热带稀树草原气候[36 ].这两个城市都是该国最重要的国内和国际旅游中心,登革热发病率很高,尽管高峰出现在不同的季节。墨西哥城是墨西哥的首都,也是该国人口最多的城市,拥有半湿润的温和气候。这个城市是一个特别有趣的案例,因为它的海拔高度,海拔2240米,高于通常允许的海拔上限伊蚊 蚊子繁殖[37 ].尽管如此,随着时间的推移,气候变暖可能会使高海拔城市的登革热传播风险增加;在美洲伊蚊 在其他类似海拔2200米的高海拔地区也有发现[38 ].
对于我们的三个案例研究,图。7 显示日气候模式(温度、湿度和降水)、昆虫学先验分布和估计指数P。脚注 3. 根据文献,我们假设在所有三种情况下,蚊子寿命和潜伏期的昆虫学先验是相同的[18 ].正如预期的那样,阿卡普尔科和Cancún的P指数始终高于墨西哥城(分别为1.35、1.32和0.54)。这些指数P预测,如果每个人有一只雌性蚊子,阿卡普尔科和Cancún将比墨西哥城更容易爆发蚊媒疾病,墨西哥城的指数在一年中的大部分时间都小于1。阿卡普尔科和Cancún的湿度和温度都比墨西哥城高,在各种气候条件下都比墨西哥城更不规律。这些模式表明阿卡普尔科和Cancún的日指数P在季节性模式中有更多的不规则性。相比之下,墨西哥城在2000-2020年期间表现出更稳定的季节模式。这些传播风险完全符合每个城市的流行病学概况。阿卡普尔科、Cancún和墨西哥城每10万居民的登革热发病率明显不同,2000-2020年期间分别为12.06、8.98和0.015。事实上,阿卡普尔科是该国登革热发病率最严重和最持久的地区之一,而Cancún近年来登革热发病率从中等水平上升到高水平[39 ].墨西哥城的低P指数也与登革热、基孔肯雅热和寨卡病毒的低发病率相对应,这是高海拔地区典型的当地气候条件,不利于寨卡病毒的流行伊蚊 蚊子。
指数P达到最大值的时间可用于确定蚊媒疾病传播潜力最高的时间。为了简化视觉效果,请参见图。8 显示了2000年、2005年、2010年、2015年和2019年所有模拟中指数P达到峰值的月份。在这个分析的子期间,墨西哥城的指数P往往在6月达到峰值,反映了非常明显的季节性行为。Acapulco和Cancún的指数P分别在6月和10月达到最大值。尽管如此,指数P达到峰值的时间显示出高度的方差。
MVSE r包的另一个关键特征是,它提供了估算指数P对气候条件变化敏感性的可视化表示。数字9 对于气候数据中的所有组合,分别在x轴和y轴上描述湿度和温度。图中的不同颜色。9 图中环形的圆点表示每个月气候数据的平均值。从1到12的浮动圆圈表示平均值指的是哪个月。数字9 显示墨西哥城的适宜性在一年中的几个月里遵循一个清晰而渐进的趋势,而Cancún呈现突变,反映了较低的平稳性。较低的平稳度阻碍了确定传播风险最高的月份。阿卡普尔科的表现介于其他两个案例之间。
如前所述,指数P的估计依赖于为八个参数定义先验。为了评估指标P对这些先验的鲁棒性,我们进行了敏感性分析。我们改变了一些初始先验值,这些初始先验值来自Obolski等人。[18 ]对人类潜伏期的先验(从均值= 5.8,sd = 1,到均值= 5.0,sd = 1)或蚊子的预期寿命(从均值= 12,sd = 2,到均值= 14,sd = 3),或同时对这两个先验进行影响。我们改变了这些先验的值,因为这些参数在文献中也得到了支持,这些参数最近被用于估计多米尼加共和国的指数P [15 ].在我们的敏感性分析中,我们发现与我们最初使用的先验集相比,没有统计学上的显著差异,如图所示。13 附录。该图显示了使用原始先验的指数P值和改变人类潜伏期(左侧图)或蚊子预期寿命(中间图)时指数P值,或同时改变这两个参数(右侧图)时指数P值。图13还显示了估计指数p的95%置信区间。在大多数情况下,唯一明显的变化是上置信区间略有增加,特别是当我们改变蚊子的预期寿命参数时。
指数P在墨西哥的时空特征
在本节中,我们提供了整个墨西哥领土上指数P分布的更广泛的图片。如前所述,自动气象站的主要优势是每天在地面测量当地的气候状况。我们选择使用这些自动测量是有代价的。不幸的是,在2000-2010年期间,并不是全国所有地区都在附近设有自动气象站。脚注 4 尽管如此,2010年之后,自动站的数量急剧增加,在2010 - 2020年期间实现了良好的全国覆盖。因此,在本节和下一节中,我们将分析限制在2010-2020年。附加文件1 :表S1,我们提供了2000-2020年期间在州一级汇总的所有可用自动气象站的指数P。
数字10 a,显示2010-2020年墨西哥所有领土的平均指数P。该图用五分位数表示指数P的值。如前所述,当指数P值大于1时,传播风险增大,当指数P值小于1时,传播风险减小。P指数最高的地区(指数> 1.16,用红色表示)位于东南部(塔巴斯科和Yucatán半岛)、太平洋海岸和一些北部州(索诺拉、奇瓦瓦和科阿韦拉)。指数P的中间值(指数在0.98和1.16之间,用黄色和橙色表示)位于特万特佩克地峡和北部一些州。指数P值最低(指数< 0.98,蓝色和绿色),因此传播潜力最低,位于该国中部和下加利福尼亚半岛。
指数P达到最大值的月份如图所示。10 b.值得注意的是,每个月的最大峰值并不总是出现在同一地区,因为它主要受温度变化的影响。在中部和中东部,指数P在7月份达到峰值。对于全国其他大部分地区,指数P在8月或9月达到最大值,这是夏季向秋季过渡的开始。
数字11 为2010-2020年选定月份指数P的月平均值。在1月份,东南部、特万特佩克地峡、Michoacán海岸和格雷罗州的传播潜力最大。5月,东北地区传播潜力最高。7月,传播风险最高的地区转移到该国西北部,其中索诺拉州和奇瓦瓦州最为突出。9月,传播风险最高的是东北部各州,特别是科阿韦拉州、新埃沃州León和塔毛利帕斯州,以及东南部的Yucatán州。
墨西哥P指数与蚊媒疾病的相关性
除了实用性之外,良好的适用性指数还必须与它们打算测量的现象相关联。因此,接下来我们评估了2010-2020年期间墨西哥所有2469个城市和9个选定城市的登革热、基孔肯雅热和寨卡发病率之间的相关性程度以及指数P。考虑到这九个城市虫媒病毒感染程度的不同和社会经济特征的差异,我们选择了这九个城市来提供整个地区的详细情况。这些城市位于国家北部(芒特城,墨西卡利和蒙特雷),中心(墨西哥城),东南部(坎佩切和塔克斯特拉Gutiérrez),以及各个海岸(阿卡普尔科,Cancún和Coatzacoalcos)。这九个城市的地理位置如图所示。10 .对于这九个城市中的每一个,我们估计了2010-2020年期间指数P与登革热、寨卡病毒和基孔肯雅热之间的Pearson相关性。就像Obolski等人。18 ],对于每个城市,我们估计2010-2020年期间每个月的平均指数P与2010-2020年期间每种虫媒病毒疾病的月平均发病率(以自然对数测量)之间的Pearson相关系数。
数字12 描述了9个城市中每个城市的月平均指数P, 2010-2020年期间登革热的月发病率(以对数计算),以及这些变量之间的皮尔森相关性。这个相关指数是正的,范围在0.25 (Cancún)和0.86 (Campeche)之间。在登革热发病率较高的南部和沿海城市,这种相关性要高得多,Cancún除外,这可能是由于其国际和国内旅游流量非常高。在登革热发病率通常较低的北部城市(墨西卡利和蒙特雷),这种相关性较低。这些结果表明,可能存在其他相关因素,如人口流动性、密度和社会经济特征,可以解释某些城市登革热发病率低,而P指数没有考虑这些因素。尽管如此,总体上指数P与登革热之间的相关性与Obolski等人得到的结果相似。[18 ]在巴西的几个城市。
进一步分析指数P预测的传播风险潜力。14 而且15 ,在附录中显示了自2014年和2015年全国出现基孔肯雅病和寨卡病毒以来,所选9个城市的指数P与基孔肯雅病和寨卡病毒的相关性。这两种疾病的发病率已迅速下降,并且更多地集中在特定区域。然而,在基孔肯雅热或寨卡病毒或两者都存在的城市,并且可以估计与指数P的相关性,相关性相对较强。对于基翁肯亚,相关性范围为-0.44 (Ciudad Mante)至0.86 (Tuxtla Gutiérrez)。对于寨卡病毒,与指数P的相关性范围为0.01(蒙特雷)至0.92(墨西哥城)。
寨卡病毒和基孔肯雅热在九个城市的存在存在很大的差异,因为这些疾病并不普遍,而是只集中在该国的某些地区。这在一定程度上解释了为什么指数P与寨卡和基孔肯雅发病率的相关系数比指数P与登革热的相关系数范围更大。此外,寨卡病毒和基孔肯雅热的零星和很少的发病率使我们没有足够的力量来检测指数P与这些虫媒病毒之间的统计显著相关性。
为了提供更全面的视图,Table1 给出了两种不同情况下P指数、登革热、寨卡病毒和基孔肯雅热之间的Pearson相关性:一种情况考虑了所有九个城市,另一种情况考虑了2010-2020年期间墨西哥境内所有2469个城市。我们发现,综合考虑9个病例研究的数据,P指数与登革热之间的相关性为0.46。这种相关性具有统计学意义,并且高于对该国所有2469个城市(0.29)的相关性估计,因为所选的9个案例研究往往具有较高的登革热发病率(墨西哥城除外)。
表1 2010-2020年全国所有城市病例研究中P指数、登革热、寨卡病毒和基孔肯雅病发病率之间的相关性
表格1 还表明,该国所有2469个城市的指数P与登革热之间的相关性(0.29)与寨卡病毒(0.23)和基孔肯雅病毒(0.25)之间的相关性相似。在考虑全国所有城市的数据时,P指数、登革热、寨卡病毒和基孔肯雅热之间的所有这些相关性在统计上具有显著性,并得到了大量观察的充分支持。
墨西哥的九个选定城市是:阿卡普尔科,坎佩切,Cancún,芒特城,科茨扎科奥尔克斯,墨西卡利,墨西哥城,蒙特雷和塔克斯特拉Gutiérrez。观测数量是所考虑的地区数量乘以12(因为相关性考虑的是2010-2020年期间12个月每个月的蚊媒疾病平均发病率)。一些地区几个月都没有报告蚊子传播的疾病。对于这些缺失病例,观测数量减少,对于寨卡病毒和基孔肯雅热尤其如此。
曼努埃尔飓风和指数P
我们的分析表明,指数P为给定年份或长期系列的蚊传风险传播的潜在动态提供了有价值的信息。指数P的另一个可能应用是评估飓风等突发天气冲击造成的传播潜力变化。在与飓风相关的高风速中,成年蚊子通常无法存活。然而,登革热、寨卡病毒和基孔肯雅热等疾病的爆发可能会随之而来,因为飓风可能会造成重大的财产损失,并增加降水,使蚊子更容易繁殖。40 ,41 ,42 ].为了评估飓风对指数P的影响程度,表2 显示与2013年9月影响墨西哥的飓风曼努埃尔有关的月平均指数P、温度(摄氏度)、月平均湿度(百分比范围在0至100之间)和月平均降水(毫米)的变化。曼努埃尔是第一个在墨西哥大陆登陆的北太平洋东部热带气旋,在水面上重新发展,然后成为飓风。曼努埃尔给太平洋沿岸大部分地区带来暴雨和洪水,造成123人死亡和42亿美元的损失,其中格雷罗州受灾最严重[43 ].仅在该州就有3万多所房屋受损,46条河流泛滥。表格2 显示了2013年9月格雷罗州阿卡普尔科的降雨量急剧增加。脚注 5 因此,指数P在2013年9月有所上升。P指数的增加也与该月阿卡普尔科登革热发病率的上升相吻合。这一证据表明,指数P合理地预测了气候变化如何导致潜在传播的变化。值得注意的是,指数P似乎对温度和湿度的变化更为敏感。例如,2012年9月,阿卡普尔科在前一年没有经历飓风。尽管如此,与2013年9月曼努埃尔飓风影响格雷罗州时相比,从统计上看,这次的湿度和温度显著升高,反映出更高的指数P和更高的登革热发病率。
2012年和2013年7月至11月阿卡普尔科的气候条件、P指数和登革热发病率
我们的证据表明,P指数是评估传播风险增加的一个很好的工具,它可以提醒政策制定者,由于气候因素的变化,哪些月份、季节和地区可能会增加蚊媒疾病的风险。然而,某些城市和月份在指数P与虫媒病毒疾病发病率之间可能具有较高的相关性,这在其他时期或空间不一定是预期的。也就是说,尽管指数P的增加表明蚊媒传播风险的增加,但这种传播风险的增加并不一定是线性的。在表2 例如,2012年9月至10月,指数P从2.23增加到2.24,即0.82%。在此期间,登革热发病率增加了79.4%。一年后,当飓风曼努埃尔袭击格雷罗州时,指数P在2013年9月至10月期间从1.84上升至1.95。P指数增加5.74%,反映在登革热发病率大幅增加186.8%。如果指数P和风险传播遵循线性关系,登革热的上升并不像我们预期的那么高。这一发现有很多原因。如前所述,蚊媒疾病的发病率取决于指数P中没有考虑到的更多因素,如人口流动、蚊子种群繁殖的机会、森林砍伐等。尽管如此,指数P还是提供了一个很好的工具来评估蚊媒疾病传播风险的增加。