(从左到右:蘑菇泉现场，黄石国家公园(来源:Jim Moran)，美国能源部联合基因组研究所的测序，美国能源部环境分子科学实验室的有机物分析，异养微生物群的样本(来源:Jim Moran)。
微生物组研究在本质上是交叉的，跨越了环境科学、健康、农业、能源、自然和建筑环境等不同的跨学科领域。新的实验和计算方法的进步和应用已经推动微生物组研究从一个新兴领域发展成为一个强大的科学领域。这些进展包括散弹枪宏基因组学、单细胞基因组学、元转录组学、元蛋白质组学，以及将靶向和非靶向代谢组学应用于环境和宿主相关样本。元基因组数据的组装和存储方面的进展使重建种群水平的草图基因组成为可能，这些草图基因组为未培养的细菌和古细菌提供了基因组蓝图。这一蓝图可以进一步用于整合转录、翻译和化学交换的各种措施，以推断自然生态系统中的动态过程。最终，多组学方法将推动系统生物学的创新，并为宿主相关模型和地球系统模型提供信息。
在这个系列中微生物组正在寻找关于实验性多组学技术和领先技术的手稿，这些技术正在改变不同领域的微生物生态学和微生物组研究。这些贡献应该强调解码微生物组过程的分子基础所必需的综合方法，范围从单细胞到复杂的生态系统网络。在研究的设计、开发、实施和分析中，每个贡献都应该解决数据管理的重要性，以及社区驱动标准和最佳实践的效用。
客人编辑:
Emiley Eloe-FadroshJGI/劳伦斯伯克利国家实验室，美国
布莱恩·荷得拉得内华达大学，美国
何塞·巴勃罗·邓多-阿里亚斯，加州州立大学蒙特利湾，美国
Maryam Goudarzi,克利夫兰诊所勒纳研究所，美国