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基因组编辑的洞见

客座编辑:Jin-Soo Kim和Fyodor Urnov

InsightsfromGenomeEditingSIPageResized

我们很高兴地宣布,由首尔国立大学的Jin-Soo Kim和Altius生物医学科学研究所的Fyodor Urnov客串编辑的《基因组编辑的见解》特刊出版了。

基于基因组编辑的技术不仅为编辑细胞系、模式生物和农业重要物种的基因组提供了有效的工具,而且还在基因组区室成像、基因表达调控以及作为实验验证的额外手段方面得到了应用。基因组编辑的新发现正在以前所未有的速度推进基因组研究。

在本期特刊中,我们重点介绍了对这些使用基因组编辑方法的领域的见解,包括新的研究、方法、评论、研究重点等。

  1. 通过在发育过程中加入组蛋白变体来改变染色质的生化组成是调控基因表达的一个关键机制。组蛋白变体H2A。B, H2A.B。3在小鼠中,ap…

    作者: Nur Diana Anuar, Sebastian Kurscheid, Matt Field, Lei Zhang, Edward Rebar, Philip Gregory, Thierry Buchou, Josephine Bowles, Peter Koopman, David J. Tremethick和Tatiana A. Soboleva
    引用: 基因组生物学201920.: 23
  2. 随着可编程核酸酶的发展,基因组工程方法已经取得了很大的进步,但定量靶上和脱靶切割位点和相关缺失的方法仍然处于萌芽阶段。这里,我们…

    作者: Christopher L. Nobles, shanan Reddy, January Salas-McKee,刘晓军,Carl H. June, J. Joseph Melenhorst, Megan M. Davis,赵阳兵和Frederic D. Bushman
    引用: 基因组生物学201920.: 14
  3. 长基因间rna (lincRNAs)在真核细胞中起着至关重要的作用,但目前还缺乏对动物lincRNAs表型的系统分析。我们生成CRISPR敲除菌株秀丽隠避署……

    作者: 魏帅,陈贺,Emmanuel Enoch Dzakah,余斌,王晓林,付涛,李景鑫,刘磊,方树成,刘卫红,单戈
    引用: 基因组生物学201920.: 7
  4. CRISPR基因组编辑技术的发展改变了生物医学研究。迄今为止报道的大多数应用都依赖于Cas9蛋白酿脓链球菌SF370 (SpyCas9)。有很多RNA向导,野生…

    作者: Nadia Amrani, Xin D. Gao, Pengpeng Liu, Alireza Edraki, Aamir Mir, Raed Ibraheim, Ankit Gupta, Kanae E. Sasaki, Tong Wu, Paul D. Donohoue, Alexander H. Settle, Alexandra M. Lied, Kyle McGovern, Chris K. Fuller, Peter Cameron, Thomas G. Fazzio…
    引用: 基因组生物学201819: 214
  5. 人口在增长,因此我们需要生产更多的食物,同时减少农业对环境的影响。选择育种和基因组选择对人类进化产生了重大影响。

    作者: 克里斯汀·泰特-伯克德,安德里亚·多斯奇尔-威尔逊,迈克·j·麦克格鲁,艾伦·l·阿齐布尔德,海伦·m·桑,罗斯·d·休斯顿,c·布鲁斯·怀特洛和米克·沃森
    引用: 基因组生物学201819: 204
  6. CRISPR/dCas9是一种多功能工具,可用于招募各种效应物和荧光分子到定义的基因组区域,在那里它可以调节遗传和表观遗传标记,或跟踪染色质d…

    作者: 段金枝,卢广庆,洪宇,胡庆涛,麦雪英,郭晶,司晓芳,王凤超,张宇
    引用: 基因组生物学201819: 192
  7. 最近CRISPR-Cas9系统的实验工作表明,脱靶结合和裂解是该系统的一个问题,这高度依赖于所选的引导RNA (gRNA)设计。第一版……

    作者: Ferhat Alkan, Anne Wenzel, Christian Anthon, Jakob Hull Havgaard和Jan Gorodkin
    引用: 基因组生物学201819: 177
  8. 许多CRISPR/ cas9介导的基因组编辑应用需要cas9诱导的非同源端连接(NHEJ),这被认为是容易出错的。然而,通过直接连接末端,cas9诱导的DNA dou…

    作者: 郭涛,冯怡丽,肖晶晶,刘倩,孙秀娜,项吉峰,孔娜,刘思成,陈国乔,王玥,董梦梦,蔡真,林辉,蔡秀军和谢安勇
    引用: 基因组生物学201819: 170
  9. CRISPR/Cas9联合筛选允许并行评估综合指导RNA文库,系统地原位扰动蛋白质编码序列,并与功能读数相关。为了分析…

    作者: Vivien A. C. Schoonenberg, mitchell A. Cole,姚秋明,Claudio Macias-Treviño, Falak Sher, Patrick G. Schupp, Matthew C. Canver, Takahiro Maeda, Luca Pinello和Daniel E. Bauer
    引用: 基因组生物学201819: 169
  10. 最近有两篇文章描述了CRISPR技术的发展,这些技术有可能从根本上改变哺乳动物细胞的条形码和追踪。

    作者: Thomas Gaj和Pablo Perez-Pinera
    引用: 基因组生物学201819: 143
  11. 人类基因组中非编码元件的功能表征是一项重大的基因组挑战,基因组编辑技术的成熟正在彻底改变我们实现这一任务的能力。Oncoge……

    作者: 韩瑞琪,李莉,亚历杭德罗Piñeiro Ugalde, Arieh Tal, Zohar Manber, Eric Pinto Barbera, Veronica Della Chiara, Ran Elkon和Reuven Agami
    引用: 基因组生物学201819: 118
  12. CRISPR基因编辑通过提供一种简单的方法,通过活细胞基因组DNA中的靶向双链断裂来改造基因,从而彻底改变了生物医学和生物技术。然而,考虑到……

    作者: Michael Gapinske, Alan Luu, Jackson Winter, Wendy S. Woods, Kurt A. Kostan, Nikhil Shiva, Jun S. Song和Pablo Perez-Pinera
    引用: 基因组生物学201819: 107
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