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云计算工具和分析

下一代测序“问题”，即生成庞大的数据集，难以进行分析，存储成本高且有问题，云计算的出现已经弥补了这一问题，在云计算中，人们可以租用硬件或存储空间。这种现象彻底改变了基因组分析，使小型实验室也能接触到大规模基因组学。以下基因组生物学文章展示了使用这些技术的工具和研究示例。

  1. 最近的研究从亚洲、非洲和欧洲亚群中产生了完整的人类序列，揭示了人群特异性变异和疾病易感性位点。在这里，从一个流行的…

    作者: Pin Tong, James GD Prendergast, Amanda J Lohan, Susan M Farrington, Simon Cronin, Nial Friel, Dan G Bradley, Orla Hardiman, Alex Evans, James F Wilson和Brendan Loftus
    引用: 基因组生物学201011: R91
    内容类型:研究 发表于:

  3. 随着测序通量接近每天几十千兆酶，对高效的转录组测序(RNA-Seq)数据分析软件的需求日益增长。Myrna是一个云计算管道…

    作者: Ben Langmead, Kasper D Hansen和Jeffrey T Leek
    引用: 基因组生物学201011: R83
    内容类型:软件 发表于:

  5. 随着可用基因组序列的数量不断增加，大型比较基因组学研究和工具的计算成本正变得越来越高。本地计算基础设施的容量和成本……

    作者: Dennis P Wall, Parul Kudtarkar, Vincent A Fusaro, Rimma Pivovarov, Prasad Patil和Peter J Tonellato
    引用: BMC生物信息学201011: 259
    内容类型:方法论的文章 发表于:

  7. 由于DNA测序的速度超过了计算机速度的提高，因此迫切需要加快测序和SNP呼叫等任务的速度。Crossbow是一个云计算软件工具，结合了校准器弓…

    作者: Ben Langmead, Michael C Schatz, Jimmy Lin, Mihai Pop和Steven L Salzberg
    引用: 基因组生物学200910: R134
    内容类型:软件 发表于:
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