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国际小麦基因组测序联盟

IWGSC

Pixabay©CC0

拥有高质量的作物物种基因组组合有可能改善育种,从而产生产量更高的品种,并更好地抵抗环境压力和传染病。尽管小麦是地球上种植最多的作物,占人类总卡路里消耗的五分之一,但其庞大的基因组(约为人类基因组的5倍)及其高度重复的性质(由三个高度相似的亚基因组杂交而成,每个亚基因组的重复序列含量都很高)阻碍了之前的测序和组装工作。

国际小麦基因组测序联盟(IWGSC)现在发表了一份高质量的基因组组装图,其中的序列组装成21个类染色体分子。两篇主要文章已发表在科学的描述基因组序列,以及广泛的转录组的探索

BMC很乐意发布几篇配套文章,包括在基因组生物学

  1. 许多小麦的支架级序列现在正在发布,在这种情况下,我们报告了一种将整体组装提高到与人类基因组相当的水平的策略。

    作者: Gabriel Keeble-Gagnère, Philippe Rigault, Josquin Tibbits, Raj Pasam, Matthew Hayden, Kerrie Forrest, Zeev Frenkel, Abraham Korol, B. Emma Huang, Colin Cavanagh, Jen Taylor, Michael Abrouk, Andrew Sharpe, David Konkin, Pierre Sourdille, Benoît Darrier…
    引用: 基因组生物学201819: 112
  2. Wheat@URGI门户网站的开发是为了向国际研究人员和育种人员提供由国际小麦基因组S生成的面包小麦参考基因组序列。

    作者: Michael Alaux, Jane Rogers, Thomas Letellier, Raphaël Flores, Françoise Alfama, Cyril Pommier, Nacer Mohellibi, Sophie Durand, Erik Kimmel, Célia Michotey, Claire Guerche, Mikaël loec, Mathilde Lainé, Delphine Steinbach, Frédéric Choulet, Hélène Rimbert…
    引用: 基因组生物学201819: 111
  3. 最近在DNA测序和基因组搭建方面的改进为产生高质量的代表小麦及其野生亲缘物种完整染色体的假分子从头组装铺平了道路....

    作者: Anupriya Kaur Thind, Thomas Wicker, Thomas Müller, Patrick M. Ackermann, Burkhard Steuernagel, Brande B. H. Wulff, Manuel Spannagl, Sven O. Twardziok, Marius Felder, Thomas Lux, Klaus F. x Mayer, Beat Keller和Simon G. Krattinger
    引用: 基因组生物学201819: 104
  4. 转座子是大型植物基因组的重要组成部分,也是基因组进化的主要驱动因素。最近的六倍体面包小麦组装在一个整体上恢复了高度重复的TE空间。

    作者: Thomas Wicker, Heidrun Gundlach, Manuel Spannagl, Cristobal Uauy, Philippa Borrill, Ricardo H. Ramírez-González, Romain De Oliveira, Klaus F. X. Mayer, Etienne Paux和Frédéric Choulet
    引用: 基因组生物学201819: 103
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