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专题文章- OmicsOne:一键式关联组学数据与表型
高通量“组学”技术的快速发展带来了大量的数据，在实验期间和之后进行处理。多组学分析有助于对数据集进行更深入的查询，并发现有趣的基因、蛋白质、脂类、聚糖、代谢物或与研究中相应表型相关的途径。
然而，利用综合的多组学数据进行表型研究还缺乏一种高效、简便的方法。在这里，我们将OmicsOne作为一个基于web的交互式框架，通过简单的“一键式”集成质量控制、统计分析和交互式数据可视化，用于多组学数据的快速表型关联分析。
将OmicsOne应用于先前发表的高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)的蛋白质组和糖蛋白组数据集以及已发表的肺鳞状细胞癌(LSCC)的蛋白质组数据集，以确认其性能。通过6个主要功能模块对数据进行分析:(1)表型分析、(2)数据预处理和质量控制、(3)知识标注、(4)表型相关特征发现、(5)个体特征表型关联分析的相关和回归模型分析、(6)感兴趣特征集表型关联分析的富集分析。
OmicsOne在公共数据集上的应用表明，OmicsOne可以有效地简化数据分析，并在几分钟内揭示表型和潜在生物标志物(包括基因、蛋白质和糖肽)之间的显著关联，帮助用户理解异常的生物过程。
目标和范围
临床蛋白质组学包含翻译蛋白质组学的所有方面。特别强调蛋白质组学技术在临床研究和分子医学各个方面的应用。本刊致力于快速科学评审和及时出版投稿稿件。
编辑配置文件
陈伟强博士现任约翰霍普金斯大学医学院病理学、肿瘤学、泌尿学和放射学教授，临床化学部门主任，病理学核心实验室联合主任，约翰霍普金斯大学医学院生物标志物发现和转化中心主任。他在蛋白质组学和免疫学技术的发展和应用方面进行了广泛的工作，以了解癌症。作为五本书和300多篇文章的作者，陈博士已成为临床蛋白质组学和癌症研究的领先专家。陈博士是美国人类蛋白质组组织(USHUPO)、美国癌症研究协会(AACR)和美国临床化学协会(AACC)的积极成员。
特色馆藏
PediOme
嘉宾编辑:维拉·伊格纳贾托维奇，艾伦·埃弗雷特和汉诺·斯蒂恩
儿科蛋白质组学(PediOme)是HUPO的一项倡议，旨在促进蛋白质组学技术的使用，以解决儿科医学中的主要问题。
蛋白质组学在印度
嘉宾编辑:Harsha Gowda和Akhilesh Pandey
这个集合的特点是来自印度的蛋白质组学研究的最新进展。
Glycoproteomics和作者
嘉宾编辑:Punit Shah和Hui Zhang
这个主题系列出版了被邀请的和未被邀请的关于蛋白质糖基化主题的内容;在正常生物过程和疾病中最常见的蛋白质修饰之一。本系列的重点是糖蛋白组学或糖化学方法及其临床应用。
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临床蛋白质组学隶属于人类蛋白质组组织(HUPO)．HUPO是一个国际科学组织，通过促进新技术、技术和培训的发展，通过国际合作和协作来代表和促进蛋白质组学的发展。
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