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数据报告

标准

数据说明简明扼要地描述了可靠的研究数据,目的是提高可见性和透明度,支持有价值的研究数据的重用,并帮助作者遵守资助者关于数据共享的规定。数据集必须存放在合适的存储库之前提交。在编辑评估期间将检查数据集的完整性和可访问性(将考虑与人类隐私或公共安全相关的限制,作者应在他们的求职信中说明这一点)。

数据共享
BMC基因组数据强烈支持公开研究,包括报告的透明度和公开性。我们的数据可用性政策可以在杂志的“关于”页上找到。

专业生产的视觉文摘

BMC基因组数据将考虑视觉文摘。作为向杂志投稿的作者,您可能希望利用施普林格Nature提供的服务,以获得高质量和负担得起的视觉摘要,您有权享受20%的折扣。伟德体育在线点击在这里了解更多有关服务的信息,使用此链接时,您的折扣将自动应用。

准备你的手稿

下面的信息帮助你准备你的数据笔记,详细的章节标题,你应该包括在你的手稿和什么信息应该在每个部分。

请注意,您的稿件必须包括“声明”部分,包括所有的小标题(请参阅下面的更多信息)。

必不可少的步骤

第一步:存入数据

将数据存放在数据存储库中是一个提交要求。合适的存储库列表可从我们的出版商施普林格Nature获得。伟德体育在线

伟德体育在线施普林格自然数据存储库指导

步骤2:完成数据注释模板

所有作者都必须使用提供的数据注释模板。

数据报告模板

请确保按照模板中的说明完成表1,包括数据文件格式、数据标识符(如DOI、登录号)和许可证信息。

第三步:提交!

向在线提交系统提交完整的数据说明。

在这里提交你的数据说明

请确保您遵循了模板说明,并确保您的数据已存入适当的数据存储库.我们不允许这种文章类型的补充文件。相反,这些文件应该被视为额外的数据文件。

如果你在准备你的稿件时有任何疑问,请联系我们的编辑部。

额外的注意事项

请确保字数不超过1000字(不包括缩略语清单、声明、表1和参考清单)。此外,以下每个部分都有特定的字数限制:

  • 文摘:200字
  • 摘要目的:300字
  • 资料描述:500字
  • 限制:300字

除表1外,数据注释不得包含任何表格或数字。相反,应该将表和图上传到存储库,并在表1中列出。

请以一种能被广大科学家(非专业人士)理解的方式清楚地书写数据说明。缩略语和专业术语应尽量减少。如果多个相关数据集链接到一个共同的研究项目、共享样本或研究主题,则可以在一个数据注释中描述多个相关数据集。

载于BMC基因组数据您有责任确保您的稿件以适当的方式和正确的英语书写(这包括在必要时寻求语言编辑服务的帮助)。稿件是经过语言检查的,如果作者未能充分改进语言,我们可能会拒收稿件。

标题页

标题页应:

  • 提出一个标题,包括对稿件报告内容的清晰描述
  • 列出所有作者的全名、机构地址和电子邮件地址
    (如果要将一个协作组列为作者,请将组名列为作者。如果您希望通过他们的个人PubMed记录可以搜索到小组成员的姓名,请按照下面的说明将此信息包含在“致谢”部分)
  • 注明通讯作者

摘要

摘要不得超过200字。请尽量减少使用缩写,不要引用参考文献。摘要必须包括以下单独的部分:

  • 目的:数据的目的和目的。作者应简明扼要地回答收集数据的原因。
  • 数据描述:作者应该提供一个简短的数据描述,并思考为什么这些数据可能对其他研究人员有价值。

关键字

三到十个关键词代表文章的主要内容。

客观的

在这一节中,作者应该提供关于目的的信息,即为什么收集数据。其目的是为读者提供一些背景知识,以便将数据置于上下文中。作者必须清楚地承认他们正在构建的任何工作,包括已发表的(例如,基于同一数据集已发表的研究论文)和未发表的。

下面是一些可能会进一步帮助你写这部分内容的提示:

  • 为研究和收集数据提供一个基本原理。保持简短,而不是冗长的描述,我们鼓励作者引用支持他们的观点的来源。
  • 请不要提供文献综述。作者可以用一两句话介绍主题,然后为感兴趣的读者引用相关的评论文章。
  • 简要地(不超过一两句话)介绍学习/研究项目。
  • 您或您的合作者发表过基于同一研究项目的相同数据或不同数据的论文吗?如果是,那么你必须引用这些。在求职信中应该提到正在考虑的论文。
  • 如果数据没有被分析和/或写在研究论文中,请告诉我们原因。如果有任何限制,那么你可能需要在“限制”部分提供更多的细节。
  • 如果你对这些数据可以用来做什么或者如何帮助别人有什么想法,请在本节的最后告诉我们的读者。

总之,我们正在寻找一个对数据的简短而诚实的介绍,它的核心是告诉读者数据来自哪里以及为什么收集它。

这部分不能超过300字。

数据描述

这部分应该是纯描述性的,而不是对数据的解释。作者可以将这部分分成小部分,用简短而翔实的标题,并在写这部分时考虑以下因素:

  • 数据描述——提供数据的简要描述。描述的是什么类型的数据?提供不同文件/文件集的概述。作者应在数据描述部分引用表1(请参阅下面)中的所有数据文件和数据集。
  • 方法——作者应该描述方法的关键要素,并说明数据是否被处理过。这应该是简短的,长度与在抽象中描述方法时相似。此外,要求作者提供完整而详细的方法描述,作为一个单独的文本文档,该文档应与数据一起上传到数据存储库。完整的方法描述必须足够详细,以允许其他人重新生成数据。
  • 必填项表1 -该表提供了所有数据文件/数据集的概述。个别文件,例如表格、图表、代码以及完整的方法学文本文档,应标记为“数据文件”,并按顺序编号。相同数据类型的较大集合(例如几百张显微图像的集合)应在表1中列为“数据集”,并按顺序编号。详情请参阅数据报告模板为更多的信息。

作者应避免讨论数据或提供解释。

这一节不应超过500字。

限制

作者必须清楚地说明他们所看到的与他们的数据有关的任何限制。例如在数据收集过程中出现的缺陷、样本量小或过时的数据等。

我们相信所有健全的数据都是有价值的,值得发表。诚实和透明地描述任何限制都不会阻止发布,而且对于数据复制和可用性至关重要。限制可以用项目符号的形式表述。

限制部分不能超过300字。

数据引用

数据记录需要包含在参考列表中作为参考。有关如何格式化和引用数据参考资料的详细信息,请参阅我们的作者信息。在这里,一些例子:

  • 张,Q-L。,Chen, J-Y., Lin, L-B., Wang, F., Guo, J., Deng, X-Y. Characterization of ladybird Henosepilachna vigintioctopunctata transcriptomes across various life stages. figshare https://doi.org/10.6084/m9.figshare.c.4064768.v3 (2018).
  • NCBI序列读取档案https://identifiers.org/ncbi/insdc.sra:SRP121625(2017)。
  • Barbosa, P., use, A.和Ramos, A. M.栎子分离株HL8,全基因组鸟枪测序项目。基因库https://identifiers.org/ncbi/insdc PKMF00000000(2018)。
  • 日本DNA数据库https://trace.ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/submission?acc=DRA004814(2016)。

对数据记录的引用应添加到表1的最后一列,以及数据和材料的可用性说明。

的缩写列表

如果在文本中使用了缩略语,应在第一次使用时在文本中进行定义,并提供缩略语列表。

声明

所有稿件必须在“声明”标题下载有下列各节:

  • 伦理批准和同意参与
  • 同意出版
  • 数据和材料的可用性
  • 相互竞争的利益
  • 资金
  • 作者的贡献
  • 确认
  • 作者的信息(可选)

请参阅下面将包括在这些部分的信息的详细信息。

如果任何部分与你的稿件无关,请在标题中注明“不适用”。

伦理批准和同意参与

报告涉及人类参与者、人类数据或人体组织的研究的稿件必须:

  • 包括一份关于伦理批准和同意的声明(即使在不需要批准的情况下)
  • 包括批准该研究的伦理委员会的名称和委员会的参考编号(如果合适)

涉及动物的研究必须包括一份关于伦理批准的声明,对于涉及客户拥有的动物的实验研究,作者还必须包括一份关于客户或所有者知情同意的声明。

看到我们的编辑政策为更多的信息。

如果您的稿件没有报道或涉及任何动物或人类数据或组织的使用,请在此部分注明“不适用”。

同意出版

如果您的稿件以任何形式包含任何个人的数据(包括任何个人细节、图像或视频),必须获得该个人的同意,如果是儿童、其父母或合法监护人的同意,则必须获得该个人的同意。所有个案报告的发表必须得到同意。

你可以使用你的机构同意书或我们的同意书如果你喜欢。您不应在提交表格时将表格寄给我们,但我们可以在任何阶段(包括出版后)要求查看副本。

看到我们的编辑政策有关同意发表的更多资料。

如果您的稿件不包含任何个人资料,请在此部分注明“不适用”。

数据和材料的可用性

所有稿件必须包括“数据和材料的可用性”声明。数据可用性声明应包括在哪里可以找到支持文章中报告的结果的数据的信息,包括在适用的情况下,到研究期间分析或生成的公开存档数据集的超链接。所谓数据,我们指的是解释、复制和构建文章中报告的发现所必需的最小数据集。我们认识到,公开分享研究数据并不总是可能的,例如当个人隐私可能受到损害时,在这种情况下,数据的可用性仍然应该在手稿中说明,以及访问的任何条件。

作者也被鼓励在searchRxiv上保留搜索字符串https://searchrxiv.org/,一个档案,以支持研究人员报告、存储和分享他们的搜索一致,并使他们能够审查和重用现有的搜索。searchRxiv使研究人员能够获得用于搜索的数字对象标识符(DOI),允许引用它。

数据可用性语句可以采用以下形式之一(如果多个数据集需要,也可以采用多种形式的组合):

  • 在当前研究期间生成和/或分析的数据集可在[NAME]存储库[数据集的持久WEB链接]中获得
  • 在当前研究中使用和/或分析的数据集可根据合理要求从通讯作者处获得。
  • 在这项研究中产生或分析的所有数据都包含在这篇发表的文章[及其补充信息文件]中。
  • 由于[数据不公开的原因],在当前研究中生成和/或分析的数据集没有公开,但可以在通信作者的合理要求下获得。
  • 数据共享不适用于本文,因为在当前研究期间没有生成或分析数据集。
  • 支持本研究结果的数据可从[第三方名称]获得,但这些数据的可用性受到限制,这些数据是在当前研究的许可下使用的,因此不能公开获得。然而,根据作者的合理要求并经[第三方名称]许可,数据可从作者处获得。
  • 不适用。如果你的稿件不包含任何数据,请在此部分注明“不适用”。

还有更多模板数据可用性语句的示例,其中包括公开可用和限制访问数据集的示例在这里

BioMed Central还要求作者引用论文结论所依赖的任何公开数据。数据引用应该包含一个持久标识符(如DOI),并且最好包含在引用列表中。数据集的引用,当它们出现在参考列表中时,应该包含DataCite推荐的最小信息,并遵循期刊风格。包括doi在内的数据集标识符应该表示为完整的url。例如:


Hao Z, AghaKouchak A, Nakhjiri N, Farahmand A.全球干旱综合监测与预测系统(GIDMaPS)数据集。figshare。2014.http://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.853801

在数据和材料的可用性声明中附有相应的文本:

在当前研究期间生成和/或分析的数据集可在[NAME]存储库[数据集的持久WEB链接]中获得。(参考号)

如果您希望共同提交一份数据说明,说明您将在其中发布的数据BMC研究笔记,你可浏览我们的提交门户.数据指出支持开放数据并帮助作者遵守资助者关于数据共享的政策。联合发表的数据注释将链接到数据支持的研究文章(例子).

相互竞争的利益

所有财务和非财务竞争利益必须在本节中申报。

看到我们的编辑政策对竞争利益的充分解释。如果您不确定您或您的任何合著者是否有竞争利益,请联系编辑部。

请用作者姓名的首字母缩写来表示每个作者在此部分的利害关系。

如果您没有任何竞争利益,请在此部分注明“作者声明他们没有竞争利益”。

资金

应申报所报告研究的所有资金来源。应声明资助机构在研究设计、数据收集、分析和解释以及撰写稿件方面的作用。

作者的贡献

作者对稿件的个人贡献应在这一节中注明。作者的指导和标准可以在我们的编辑政策

请在此部分用首字母表示每位作者的贡献,例如:“FC分析和解释了有关血液病和移植的患者数据。RH对肾脏进行了组织学检查,是撰写手稿的主要贡献者。所有作者都阅读并认可了最终手稿。”

确认

请承认任何对文章作出贡献的人,谁不符合作者的标准,包括任何人谁提供专业的写作服务或材料。

作者应该获得所有在致谢部分提到的人的许可。

看到我们的编辑政策对于致谢和作者标准的充分解释。

如果您没有需要确认的人,请在此部分写上“不适用”。

团体作者(对于涉及合作小组的稿件):如果您希望通过单个PubMed记录搜索合作小组成员的姓名,请确保在标题页和提交系统中包括合作小组的标题,并在“致谢”部分的最后一段包括合作作者姓名。请按姓名、中间首字母(可选)、姓氏的格式添加作者。如果您愿意,可以为每个作者添加机构或国家信息,但这应该在所有作者之间保持一致。

请注意,当一篇发表的文章最初被纳入PubMed时,个人姓名可能不会出现在PubMed记录中,因为PubMed需要额外的时间来编码这些信息。

作者的信息

此部分是可选的。

你可以选择使用这一部分来包含任何有关作者的信息,这些信息可能有助于读者对文章的解释,并理解作者的立场。这可能包括作者资格的细节,他们在机构或社团的现任职位,或任何其他相关背景信息。请以作者姓名的首字母称呼。注意,这一节不应该用来描述任何竞争利益。

脚注

脚注可以用来提供额外的信息,其中可能包括参考文献列表中引用的参考文献。它们不应该仅仅由参考文献引文组成,也不应该包含参考文献的书目细节。它们也不应包含任何数字或表格。

文本的脚注按顺序编号;表中的数据应用上标小写字母表示(或用星号表示显著性值和其他统计数据)。标题的脚注或文章的作者没有给出参考符号。

总是使用脚注而不是尾注。


参考文献

温哥华参考样式的示例如下所示。

看到我们的编辑政策为作者指导良好的引用实践

网页链接和网址:所有的网络链接和url,包括到作者自己网站的链接,都应该给出一个参考编号,并包括在参考列表中,而不是在手稿的文本中。它们应该完整地提供,包括网站的标题和URL,以及访问该网站的日期,格式如下:小鼠肿瘤生物学数据库。http://tumor.informatics.jax.org/mtbwi/index.do.已于2013年5月20日访问。如果一个作者或一组作者可以清楚地与一个web链接相关联,例如对于weblogs,那么他们应该包含在引用中。

例子参考风格:

期刊上的文章

史密斯JJ。科学的世界。中华科学杂志1999;36:234-5。

期刊内的文章(无页码)

Rohrmann S, Overvad K, Bueno-de-Mesquita HB, Jakobsen MU, Egeberg R, Tjønneland A,等。肉类消费和死亡率——来自欧洲癌症和营养前瞻性调查的结果。BMC医学。2013;11:63。

文章在期刊由DOI

Slifka MK, Whitton JL。细胞因子产生失调的临床意义。中华医学杂志2000;doi: 10.1007 / s801090000086。

杂志增刊中的文章

王晓燕,王晓燕。功能性脾缺乏症:骨髓扫描显示脾活性。血1979;59增刊1:26-32。

书中的章节,或书中的文章

细胞死亡:凋亡的意义。入选:Bourne GH, Danielli JF, Jeon KW,编辑。细胞学国际评论。伦敦:学术;1980.p . 251 - 306。

丛书的第一章(没有卷名,但有DOI)

Saito Y, Hyuga H.对映体过量扩增和手性对称破缺的速率方程方法。顶级Curr化学,2007。_2006_108 doi: 10.1007/128。

完整的书,撰写

药房的症状:常见疾病的管理指南。牛津大学:布莱克威尔科学学院;1998.

在线文档

下属文件的标题。收录于:关于物质及其作用的词典。皇家化学学会,1999。下属文件http://www.rsc.org/dose/title。于1999年1月15日访问。

在线数据库

健康观点知识库。美国药典,洛克维尔,1998。http://www.healthwise.org。已于1998年9月21日访问。

补充材料/私人主页

补充材料的标题。2000.http://www.privatehomepage.com。2000年2月22日访问。

大学网站

Doe, J:预印本的标题。http://www.uni-heidelberg.de/mydata.html(1999)。于1999年12月25日访问。

FTP站点

普通HTTP, RFC2169。ftp://ftp.isi.edu/in-notes/rfc2169.txt(1999)。已于1999年11月12日访问。

组织网站

ISSN国际中心:ISSN登记册。http://www.issn.org (2006)。访问2007年2月20日。

具有持久标识符的数据集

郑丽颖,郭兴生,何斌,孙丽娟,彭宇,董淑生,等。甜高粱和谷物高粱(高粱双色)的基因组数据。GigaScience数据库》2011。http://dx.doi.org/10.5524/100012

图、表和其他文件

看到一般格式指南有关如何格式化图形、表格和其他文件的信息。

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杂志年度指标

  • BMC遗传学(原标题)

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