数据库的文章

数据库类文章应该描述一种可能具有广泛用途的新型生物医学数据库。数据库必须易于访问，并且数据库中的数据应归因于一个源。

一篇描述数据库的文章，但也包括值得发表的研究，应该作为一篇研究文章提交，或者应该分成一篇研究文章和一篇单独的数据库文章。

在手稿中描述的数据库必须以一种保留其匿名性的方式供审稿人测试。如果已发表，所描述的数据库必须可供任何希望将其用于非商业目的的研究人员访问，不受诸如需要材料转让协议等限制。我们可能会要求生物医学中心保存一份数据库的存档副本作为保障措施。

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下面的信息详细说明了你应该在你的手稿中包括的部分标题，以及每个部分应该包含什么信息。

请注意，你的手稿必须包括一个“声明”部分，包括所有的小标题(请参阅下面的更多信息)。

标题页

标题页应该:

• 提交一个标题，如果合适的话，包括研究设计，例如:
  • “A与B治疗C:一项随机对照试验”，“X是Y的危险因素:一项病例对照研究”，“X因素对Y的影响是什么:一项系统综述”
  • 或者对于非临床或非研究研究:对文章报道内容的描述
• 列出所有作者的全名和单位地址
  • 如果要将合作小组列为作者，请将小组名称列为作者。如果您希望通过他们的个人PubMed记录搜索到小组成员的名字，请按照下面的说明将这些信息包括在“致谢”部分
  • 大型语言模型(llm)，例如ChatGPT，目前不满足我们的要求作者的标准。值得注意的是，作者的归属带有对工作的责任，这不能有效地应用于法学硕士。法学硕士的使用应在论文的方法部分(如果方法部分不可用，则在合适的替代部分)中适当地记录
• 注明通讯作者

摘要

摘要不应超过350字，应以背景、摘要主体和简短结论为结构。请尽量减少使用缩写，不要在摘要中引用参考文献。

关键字

三到十个关键词代表文章的主要内容。

背景

背景部分应该解释数据库的背景和感知需求，提及先行者和竞争对手，并说明其潜在价值。

结构与内容

本节应描述数据库模式和实现，以及有关数据源、数据生成信息学和质量控制的信息。

效用与讨论

这些内容可以分成带有简短信息标题的小节。应该描述用户界面，并讨论数据库的预期用途和预期的好处，同时提供有关其性能和功能如何与现有类似数据库进行比较和改进的数据。可以提出一个使用数据库的案例研究。如果有新功能，应该提到计划中的未来开发。

结论

这应该清楚地说明主要结论，并包括对其与该领域的相关性或重要性的解释。

缩略语一览表

如果在文本中使用缩略语，则应在首次使用时在文本中对其进行定义，并提供缩略语列表。

所有手稿必须在“声明”标题下包括以下部分:

• 伦理批准并同意参与
• 发表同意书
• 数据和材料的可用性
• 相互竞争的利益
• 资金
• 作者的贡献
• 致谢
• 作者信息(可选)

请参阅下面的详细信息，包括在这些部分。

如果任何部分与你的手稿不相关，请包括标题并在该部分写上“不适用”。

伦理批准并同意参与

涉及人类受试者、人类数据或人体组织的研究报告必须:

• 包括伦理批准和同意的声明(即使不需要批准)
• 包括批准该研究的伦理委员会的名称和委员会的参考编号(如果合适的话)

涉及动物的研究必须包括伦理批准声明，涉及客户拥有的动物的实验研究，作者还必须包括客户或所有者的知情同意声明。

看到我们的编辑政策了解更多信息。

如果您的稿件没有报告或涉及使用任何动物或人体数据或组织，请在本节中注明“不适用”。

发表同意书

如果您的稿件以任何形式包含任何个人数据(包括任何个人细节，图像或视频)，必须获得该个人的同意，或者在儿童，其父母或法定监护人的情况下。所有病例报告的展示都必须获得出版许可。

您可以使用您的机构同意书或我们的同意书如果你愿意的话。您不应在提交时将表格发送给我们，但我们可能会在任何阶段(包括发布后)要求查看副本。

看到我们的编辑政策有关同意发表的更多资料。

如果您的手稿不包含任何个人的数据，请在此部分注明“不适用”。

数据和材料的可用性

所有手稿必须包括“数据和材料的可用性”声明。数据可用性声明应该包括在哪里可以找到支持文章中报告的结果的数据的信息，在适用的情况下，包括在研究过程中分析或生成的公开存档数据集的超链接。通过数据，我们指的是解释、复制和构建文章中报告的发现所必需的最小数据集。我们认识到，公开分享研究数据并不总是可能的，例如当个人隐私可能受到损害时，在这种情况下，数据的可用性仍应在手稿中注明，以及任何访问条件。

还鼓励作者在searchRxiv上保留搜索字符串https://searchrxiv.org/，一个档案馆，支持研究人员报告，存储和共享他们的搜索一致，并使他们能够审查和重用现有的搜索。searchRxiv使研究人员能够为他们的搜索获得一个数字对象标识符(DOI)，允许它被引用。

数据可用性语句可以采用以下一种形式(如果需要多个数据集，也可以采用多种形式的组合):

• 在当前研究中生成和/或分析的数据集可在[NAME]存储库中获得，[持久的WEB链接到数据集]
• 本研究中使用和/或分析的数据集可根据通讯作者的合理要求提供。
• 本研究过程中产生或分析的所有数据都包含在这篇发表的文章[及其补充信息文件]中。
• 由于[数据不公开的原因]，在当前研究期间生成和/或分析的数据集不公开，但应通信作者的合理要求，可以从通信作者处获得。
• 数据共享不适用于本文，因为在当前研究期间没有生成或分析数据集。
• 支持本研究结果的数据可以从[第三方名称]获得，但这些数据的可用性受到限制，这些数据是在当前研究的许可下使用的，因此不能公开获取。但是，在作者提出合理要求并获得[第三方名称]许可的情况下，可以获得数据。
• 不适用。如果您的手稿不包含任何数据，请在此部分注明“不适用”。

还有更多模板数据可用性语句的示例，其中包括公开可用和限制访问数据集的示例在这里。

生物医学中心强烈鼓励引用论文结论所依赖的任何公开数据。数据引用应该包含一个持久的标识符(比如DOI)，理想情况下应该包含在参考列表中。当数据集的引文出现在参考文献列表中时，应包含DataCite推荐的最少信息，并遵循期刊风格。包括doi在内的数据集标识符应该表示为完整的url。例如:

赵浩，AghaKouchak A, Nakhjiri N, Farahmand A.全球干旱综合监测与预测系统(GIDMaPS)数据集。figshare。2014.http://dx.doi.org/10.6084/m9.figshare.853801

在数据和材料的可获得性声明中附有相应的文字:

在当前研究期间生成和/或分析的数据集可在[NAME]存储库中获得，[持久的WEB链接到数据集]。^(参考号)

如果您希望共同提交一份数据说明，说明您的数据将在BMC研究笔记，你可浏览我们的提交门户。数据说明支持开放数据并帮助作者遵守资助者关于数据共享的政策。共同发表的数据注释将链接到数据支持的研究文章(例子）.

相互竞争的利益

所有财务和非财务利益必须在本节中申报。

看到我们的编辑政策为了充分解释利益冲突。如果您不确定您或您的任何合作作者是否有竞争利益，请联系编辑部。

请使用作者名字的首字母来表示每个作者在本节中相互竞争的利益。

如果您没有任何竞争利益，请在本节中注明“作者声明他们没有竞争利益”。

资金

报告的研究的所有资金来源都应声明。应声明资助机构在研究设计、数据收集、分析和解释以及撰写论文中的作用。

作者的贡献

作者对稿件的个人贡献应在本节中注明。指导和标准的作者可以找到我们的编辑政策。

请使用首字母缩写来表示每位作者在本节中的贡献，例如:“FC分析并解释了有关血液病和移植的患者数据。RH进行了肾脏的组织学检查，并且是撰写手稿的主要贡献者。所有作者都阅读并认可了最终的手稿。”

致谢

请感谢任何不符合作者标准的人为本文做出贡献的人，包括提供专业写作服务或材料的人。

作者应该获得致谢部分中提到的所有人的许可。

看到我们的编辑政策有关致谢和作者标准的完整说明。

如果您没有任何需要确认的人，请在本节中注明“不适用”。

小组作者身份(对于涉及合作小组的手稿):如果您希望通过个人PubMed记录搜索合作小组成员的姓名，请确保在标题页和提交系统中包含合作小组的名称，并在“致谢”部分的最后一段包括合作作者的姓名。请按“姓名，中间首字母缩写(可选)，姓氏”的格式添加作者。如果愿意，您可以为每个作者添加机构或国家信息，但这应该在所有作者之间保持一致。

请注意，当一篇已发表的文章最初包含在PubMed中时，个人的名字可能不会出现在PubMed记录中，因为PubMed需要额外的时间来编码这些信息。

作者的信息

本节是可选的。

你可以选择使用这一部分来包含任何关于作者的相关信息，这些信息可以帮助读者理解文章，并理解作者的观点。这可能包括作者资格的详细信息，他们在机构或协会担任的现任职位，或任何其他相关背景信息。请使用作者姓名的首字母。注意，本节不应用于描述任何相互竞争的利益。

脚注

脚注可以用来提供额外的信息，其中可能包括参考文献列表中引用的参考文献。它们不应该仅仅由参考引文组成，也不应该包括参考文献的书目细节。它们也不应该包含任何数字或表格。

正文的脚注按顺序编号;表中的数据应用上标小写字母表示(或用星号表示显著性值和其他统计数据)。文章标题的脚注或作者没有给出参考符号。

总是使用脚注而不是尾注。

温哥华参考风格的示例如下所示。

看到我们的编辑政策为作者提供良好的引用实践指导

网页连结及网址:所有的网络链接和url，包括到作者自己网站的链接，都应该有一个参考文献编号，并包括在参考文献列表中，而不是在手稿文本中。它们应以以下格式提供，包括网站的标题和URL，以及访问网站的日期:小鼠肿瘤生物学数据库。http://tumor.informatics.jax.org/mtbwi/index.do。2013年5月20日查阅。如果一个作者或一组作者可以明显地与一个web链接相关联，比如weblogs，那么他们应该被包含在引用中。

示例引用样式:

期刊文章

史密斯JJ。科学的世界。中国科学d辑。1999;32(1):1 - 4。

期刊内的文章(无页码)

Rohrmann S, Overvad K, Bueno-de-Mesquita HB, Jakobsen MU, Egeberg R, Tjønneland A，等。肉类消费和死亡率——来自欧洲癌症和营养前瞻性调查的结果。中华医学杂志，2013;11:63。

按DOI分类的期刊中的文章

Slifka MK, Whitton JL。细胞因子产生失调的临床意义。中华医学杂志。2000;doi: 10.1007 / s801090000086。

期刊增刊内的文章

M.功能性脾功能不全:骨髓扫描显示脾活动。《血》1979;59:26-32。

书中的一章或一本书中的一篇文章

王晓明，王晓明，王晓明。细胞凋亡与细胞凋亡的关系。编辑:Bourne GH, Danielli JF, Jeon KW。细胞学国际综述。伦敦:学术;1980.p . 251 - 306。

在线系列的第一章(没有卷号但有DOI)

齐东，杨晓华，杨晓华。对映体过量放大和手性对称性破缺的速率方程方法。顶级化学，2007。_2006_108 doi: 10.1007/128。

完整的书，作者

药房的症状:常见病的管理指南。第3版。牛津:布莱克威尔科学;1998.

在线文档

Doe J.下属文件的标题。参考:《物质及其作用词典》。英国皇家化学学会。1999。http://www.rsc.org/dose/title的下级文件。1999年1月15日查阅。

在线数据库

健康观点知识库。美国药典，洛克维尔，1998。http://www.healthwise.org。1998年9月21日

补充资料/私人网页

补充材料的标题。2000.http://www.privatehomepage.com。2000年2月22日访问。

大学网站

预印本的标题。http://www.uni-heidelberg.de/mydata.html(1999)。1999年12月25日查阅。

FTP站点

J: Trivial HTTP, RFC2169。ftp://ftp.isi.edu/in-notes/rfc2169.txt(1999)。1999年11月12日查阅。

组织网站

ISSN国际中心:ISSN注册中心。http://www.issn.org(2006)。2007年2月20日访问。

具有持久标识符的数据集

郑丽艳，郭小生，何斌，孙丽娟，彭勇，董绍生，等。甜高粱和谷物高粱(高粱双色)的基因组数据。GigaScience数据库。2011。http://dx.doi.org/10.5524/100012。

看到通用格式指南有关如何格式化图形、表格和其他文件的信息。