第14卷补编第3号

自动函数预测会议2011年部分过程

议事过程

编辑者Iddo Friedberg

2011年ISMB自动化函数预测会议得到了美国国家卫生院R13HG006079-01A1授予PL和美国能源局DE-SC0006807TDD授予IF的支持会议组织者感谢国际计算生物学学会持续支持自动化函数预测特殊兴趣组

自动化函数预测SIG2011专题CAFA挑战:功能说明临界评估去会议网站

奥地利维也纳2011年7月15日至16日

蛋白函数预测大规模整合进化分析与多数据源

精确蛋白函数注解使用高通量广度和下一代排序数据时严重瓶颈保持数据库注解更新已成为一流科学

作者数 : Domenico Cozzetto、DanielWABuchan、Kevin Bryson和DavidTJones

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)S1

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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深入性能评价PFC和ESG函数预测法CAFA2011实验

多自动函数预测方法开发应对从高通量排序实验中获取的基因序列数增长支持.

作者数 : 美加那契台尔市市

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)s2

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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组合剖面序列搜索、剖面图剖面搜索和域共生网络

从序列预测蛋白函数对生化实验设计、变异分析、蛋白工程、蛋白设计、生物路径分析、药设计、疾病诊断、

作者数 : 王正日曹和郑建林

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)s3

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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如何继承BAR+蛋白质集群内经统计验证注解

基因组时代关键题是蛋白质注解, 即如何下传蛋白序列,例行操作

作者数 : Damiano Piovesan、Pier Luigi Martelli、Piero Fariselli、Giuseppe Profiti、Andrea Zauli、Ivan Rossi和Rita Casadi

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)S4

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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使用域式家属预测蛋白函数

评估域系使用预测全蛋白质函数FunFams使用协议推导出这些功能家庭

作者数 : Robert Rentzsch和ChristineAOREGA

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)s5

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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函数预测从网络进化相似性蛋白质结构

高精度和敏感度的注解蛋白函数仍然是结构基因组学的一大挑战一种经验证计算策略是分组几键功能性氨基酸

作者数 : 塞尔坎·埃尔丁、埃里克·文纳、安德烈亚斯·马丁·利苏斯基和奥立维耶

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)s6

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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同义推理为蛋白质函数预测设置高条

任何方法deno预测蛋白函数比随机效果更好更具挑战性,它也应该优于简单同系法推理

作者数 : Tomias Hamp、Rebecca Kassner、Stefan Seealdo、Christian Schefer、Dominik Achten、FlorianAuer、Ariane Boehm、TatjanaBraun、McrilianHecht、MarkHeron、PeterHönigschmid、ThomasAHPF、Stefanie Kaufmann、Michael Kiening、DenisKrom

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)s7

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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MS-kNN:通过整合多数据源预测蛋白函数

蛋白函数判定是后基因组时代的关键挑战实验判定蛋白函数准确性,但耗时耗用和资源密集性成本效益高的替代i

作者数 : 梁兰市、内曼贾州朱里奇市、余中国市和斯洛博丹武塞

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)s8

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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以域为中心解决dcGO函数基因组预测器

计算/人工注解蛋白函数是理解新排序基因组的第一批路径之一蛋白域预测构成注解过程的一个基本部分....

作者数 : 海方和朱力安高夫

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)S9

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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组合多数据源精确功能注释蛋白

组合多源数据对精确预测蛋白函数至关重要任务复杂,因为序列特征很容易跨树类比较

作者数 : ArtemSokolov, ChristopherFunk,KileyGraim,KarinVerspoor和Asaben-Hur

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)s10

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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函数推理protoNet家谱树:Daphniapule

Daphnia Pulex(水跳蚤)是第一个全序甲壳类基因组甲壳动物和昆虫从公共祖先分离模型生物研究分子化处理

作者数 : Nadav拉波波特和Michalli

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)s11

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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GO基础剖面图并发函数折叠

预测新排序蛋白质函数至关重要,因为获取生序速度快几乎所有预测蛋白函数资源都分配功能术语

作者数 : DanielLopez和Florencio Pazos

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)s12

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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Protein函数注释结构化局部活动网站

从三维结构预测生物化学函数证明比原预期难得多。可靠方法测试似然注解

作者数 : 周西王英、约林S 李、拉姆亚Pasuram、斯里尼瓦斯索马洛图和Mary Jo Ondrechen

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)S13

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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Protein函数预测使用从生物医学文献摘取的文本特征:CAFA挑战

近十年来测序技术的进步已产生大量序列蛋白质,功能尚不为人知计算系统自动预测

作者数 : Andrew Wong和HagitShatkay

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)S14

内容类型 :议事过程发布日期:2013年2月28日
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描述基因函数计算分配中的状态:函数批注第一次临界评估教程

基因函数分配仍然是计算生物学上困难但重要的任务首次功能注释临界评析

作者数 : Jesse Gillis和Paul Pavlidis

引用: BMC生物信息学2013年 14(Supplication3)S15

内容类型 :议事过程发布日期:2013年4月22日
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自动函数预测会议2011年部分过程

议事过程

蛋白函数预测大规模整合进化分析与多数据源

深入性能评价PFC和ESG函数预测法CAFA2011实验

组合剖面序列搜索、剖面图剖面搜索和域共生网络

如何继承BAR+蛋白质集群内经统计验证注解

使用域式家属预测蛋白函数

函数预测从网络进化相似性蛋白质结构

同义推理为蛋白质函数预测设置高条

MS-kNN:通过整合多数据源预测蛋白函数

以域为中心解决dcGO函数基因组预测器

组合多数据源精确功能注释蛋白

函数推理protoNet家谱树:Daphniapule

GO基础剖面图并发函数折叠

Protein函数注释结构化局部活动网站

Protein函数预测使用从生物医学文献摘取的文本特征:CAFA挑战

描述基因函数计算分配中的状态:函数批注第一次临界评估教程

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