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微生物群落被广泛研究使用高通量测序技术,如16S rRNA基因测序。这些技术吸引了生物学家,因为它们提供了探索微生物的强大工具。
生物液体的代谢组学时间过程分析与临床诊断高度相关。然而,许多抽样方法受到未知的样本量的影响,通常称为大小效应。这可以防止呈献的……
视网膜是一个复杂的组织,包含多种细胞类型,对视觉至关重要。了解各种视网膜细胞类型的基因表达模式在再生方面具有潜在的应用价值。
转录因子(tf)在维持胚胎干细胞(ES)的“干性”和分化成数百种成体细胞类型方面起着核心作用。基金的监管能力不足。
长交错元素1 (LINE-1或L1)逆转录转座子是构成人类基因组17-20%的可移动元素。L1表达异常与几种人类疾病之间的强烈相关性…
L1000技术是一种具有成本效益的高通量转录组学技术,已被应用于分析一系列人类细胞系的基因表达对>30000化学和基因的响应。
嵌合抗原受体t细胞(CAR-T)疗法是一种新型高效的细胞免疫疗法。这种疗法疗效显著,但也有严重的副作用,统称为细胞因子释放……
药物-疾病关系的预测是人工智能在药物开发中应用的一个很有前途的领域。尽管许多计算模型…
在哺乳动物配子中建立的表观遗传修饰在早期发育过程中大部分被重新编程,然而,部分由胚胎遗传以支持其发育。在本研究中,我们检验了Cp…
在分子和纳米尺度上分析蛋白质-蛋白质相互作用(PPIs)的新方法的发展,使人们对细胞内信号通路有了更深的了解,并将增进对蛋白质f的理解。
虽然提出蛋白质结构域分解的算法方法已经引起了很高的兴趣,但该问题固有的模糊性使其仍然是一个活跃的研究领域。此外,精确的自动化…
蛋白质配体对接是计算预测蛋白质功能和筛选候选药物不可或缺的工具。尽管在过去的二十年中取得了显著的进步,但在……方面仍然面临挑战。
准确预测有机硅中药物靶点结合亲和度(DTA)在药物开发中起着重要作用。大多数用于预测DTA的计算方法使用机器学习模型,特别是……
在各个领域中,搜索多个(即三个或三个以上)序列的最长公共子序列(MLCS)是一个经典但又难以解决的问题。这个问题的主要瓶颈是……
目前,在家畜和植物育种中,利用基因分型数据通过基因组预测模型来预测表型是很普遍的。与此同时,与各种性状相关的基因组注释也在增加……
控制染色质功能的基因的致病性突变与罕见的遗传综合征有关。这些染色质修饰物在表观遗传变化的尺度上表现出非凡的多样性。
多组学网络中跨不同组学层的不同类型生物分子之间复杂的相互作用,为深入理解基因调控机制提供了巨大的潜力。
逆合成预测是从反应产物中推断出反应物的任务,对目标产物合成路线的设计具有重要意义。产品分子一般是r。
目前,生物信息学中存在着各种各样的分类方法和深度神经网络方法。深度神经网络已经证明了它们在分类任务中的有效性,并有明显的优势。
尽管最近在细胞冷冻电子断层扫描(CET)方面取得了进展,但由于缺乏注释数据,开发亚分子分辨率大分子识别自动化工具仍然具有挑战性……
对基因中预先分配的一组单核苷酸多态性(SNPs)的多位点分析是对单标记分析的有价值的补充,它通过聚集生物基因中复杂性状的数据。
植被覆盖度(FVC)是决定植被结构的重要参数。利用移动智能设备捕获的数字图像自动测量植被覆盖度是一个潜在的方向。
阿尔茨海默病深刻影响着人类行为和认知的质量。阿尔茨海默病的严重程度在不同的人类受试者中分布非常广泛,这就要求对阿尔茨海默病进行定量诊断。
随着DNA测序成本的降低,我们对遗传变异的了解也大大增加。虽然群体规模的项目为基因型-表现型关系带来了重要的洞察,但合作伙伴……
破译肿瘤组织中构成细胞类型的比例是分析肿瘤异质性和预测免疫治疗反应的关键步骤。在测量细胞的过程中…
RNA二级结构对破译细胞活性和疾病发生非常重要。学术界预测这种结构的第一种方法是生物实验。
基因表达分析可以为分析复杂的生物机制提供有用的信息。然而,许多报告的发现是不可重复的,因为相对于大量的gen…
蛋白质序列结构的稳定性在疾病的预防和治疗中起着重要作用。
集成的多组学数据可以为生物系统提供一个更复杂的视角,这个生物系统由不同相互关联的分子组成,这是开发新型个性化治疗的关键方面。
铜中毒诱导是乳腺癌免疫治疗和靶向治疗的一种有前途的替代方法。本研究旨在探讨铜中毒的预后和生物学意义。
单细胞全基因组肿瘤测序可以对体细胞拷贝数改变的进化史产生新的见解。现有的单单元拷贝号调用方法没有显式地对…
氨基酸属性感知系统发育分析(APPA)是指基于氨基酸属性编码的系统发育分析方法,用于理解和推断进化关系。
G蛋白偶联受体(GPCRs)通过调节G蛋白感知胞外信号并将其传递到胞内机制。GPCR故障与多种信号相关疾病有关。
由于RNA二级结构在各种生物过程中的关键作用,它一直是深入分析的重点,数学家和生物学家付出了巨大的努力,寻找一个合适的抽象…
途径富集分析广泛应用于高通量实验研究中,以深入了解预先定义的基因、蛋白质和代谢物子集的功能作用。方法leverag……
图像分割中一个反复出现的问题是缺乏标记数据。这一问题在2019冠状病毒病(COVID-19)....患者的肺部计算机断层扫描(CT)分割中尤为突出
基因调控网络已经引起了人们对复杂分子网络相互作用引起的疾病机制的广泛关注。这些网络已被应用于预测特定的临床…
癌症是一种异质性疾病,肿瘤基因配合、适应和进化以适应个体患者不断变化的条件。发现个性化的癌症驱动机制是一项有意义的工作。
细胞从早期状态发展到成熟状态,在细胞分化过程中产生了细胞谱系。对这些血统的了解是发育生物学的核心。每个生物谱系对应于……
必需蛋白是细胞发育和生存所必需的。必需蛋白质的鉴定不仅有助于了解细胞生存的最低要求,而且有助于了解细胞生存的最低要求。
从生物医学文献和其他文本数据中提取药物-药物相互作用是药物安全监测的一个重要组成部分,已引起众多医疗保健研究人员的关注。存在……
在基于siRNA的抗病毒治疗中,强效siRNA的选择是必不可少的一步,但这些常用的特征无法构建强效和无效siRNA之间的边界。
单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术为探索异质细胞群提供了独特的机会。然而,复杂组织的单细胞转录组学特征的深入研究往往难以解决。
在这项工作中,我们研究了RNA的反向折叠问题,即发现折叠成给定目标二级结构的序列。
荧光显微镜中的图像分割通常基于荧光探针的光谱分离(基于颜色的分割)或基于单个图像区域的显著强度差异(intensi…
甲型流感病毒(IAV)表现出巨大的基因突变性,并具有感染禽类和哺乳动物宿主的巨大人畜共患潜力,已知是若干大流行病的罪魁祸首。一个关键的计算是…
MRI大脑图像的对比度总是很低,这使得很难识别大脑图像边界处的信息属于哪个区域。这可以使边界上的特征提取…
细胞中几种类型的RNA通常参与具有多种功能的生物过程。编码rna编码蛋白质,非编码rna调节基因表达。一些单链rna可以…
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