上千基因组
2014年4月29日
千基因组项目编目人类基因变异, 但它似乎无意中编目别的东西- Mycoplasma基因组-据公开存取杂志发布的一项研究生物数据挖掘.
1000基因组项目原始数据由单作者William Langdon分析,他是伦敦大学学院计算机科学家并发现部分数据与人类基因组不匹配进一步分析时,包括BLAST搜索确认这些基因组为Mycoplasma并至少7%样本中出现
Mycoplasma污染是实验室常见问题,通常由细胞生长中介质感染引起数据检测到污染时,很容易清理后续扫描,同时考虑到这一点。
Stephan Beck 伦敦大学医学基因组学教授表示:「当科学家从千组网站或类似项目下载原始数据时,发现污染并不奇怪, 但它应警告社区,
千基因组项目于2008年启动,以编目产生人类遗传多样性的不同变异期望通过测序1000多人基因组实现它的目标这些数据上传到互联网上,供其他研究人员自由使用。数据以两种方式使用之一,第一,科学家检验多常见变异在整个人群中处于一定状态,而不是比较人类参考基因组第二,可以检验不同民族内部的差异以研究人类历史,以及民族差异对疾病可能产生的影响
Mycoplasma基因组的意外外观也可被视为一个契机清除这些基因组后,可由Mycoplasma研究领域专家分析就能更好地了解Mycoplasma在生长介质上如何作用
William Langdon表示:「科学家使用公开数据集,mycoplasma污染问题常见, 但它只是一个案例 捕捉它并注注解数据
ends-
媒体联系人
Shane康宁
媒体官
BioMed中心
T:+44 (0)2031922243
M:+44(0)7825984543
E: Shane.Canning@biomedcentral.com
向编辑器注解
开工mycoplasma污染 1000基因组项目
威廉B兰登
生物数据挖掘
文章发布于杂志网站来.
请在您写的任何故事中命名日志写网页时,请链接文章所有文章免费提供,根据BioMed中心开放访问策略
二叉生物数据挖掘开放存取、同行评审在线杂志,内容包括数据挖掘所有方面研究应用到高维生物和生物医学数据,重点是从大规模遗传学、转录组学、基因组学、原型学和代谢学数据中知识发现计算方面
3级BioMed中心是STM出版商,率先开发开放访问发布模型由BioMed中心发布的所有同行评审研究文章都立即免费在线发布并获得许可允许再分配和回用BioMed中心是SpringerScience+Business媒体的一部分,STM部门领先全球出版商