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丘巴卡从北美迁徙而来

猎豹(Acinonyx jubatus)现在生活在非洲平原上,但它在10万年前就开始了从北美向现在栖息地的迁徙。这项研究发表在开放获取期刊上基因组生物学他们发现,从北美迁徙对该物种来说代价高昂,引发了它们基因库的首次大规模减少。

现代非洲猎豹分布在非洲东部和南部,但由于它们自由放养的数量很少,而且近亲繁殖,因此高度濒危。俄罗斯圣彼得堡国立大学的研究人员与中国华大基因和纳米比亚CCF合作,对一只名为“Chewbaaka”的雄性纳米比亚猎豹以及来自坦桑尼亚和纳米比亚的其他6只野生猎豹的基因组进行了测序。这进一步深入了解了物种的进化史和基因组贫瘠的广度,基因组贫瘠会提高幼鱼死亡率,导致精子发育极度异常,并增加对传染病爆发的脆弱性。

共有18个猎豹基因显示出破坏性突变,特别是一个基因AKAP4显示出大量突变,这可能会损害精子发育,并可能解释为什么猎豹有很大比例的缺陷精子,因此它们的繁殖成功率很低。

猎豹是美洲美洲狮的近亲,它们的化石记录遍布美洲、欧洲和亚洲。该物种经历了两次种群瓶颈——由于环境因素,种群数量迅速减少。

第一次发生在10万年前,大约在更新世晚期——一个由反复的冰川形成的地质时期,猎豹开始穿过白令陆桥向亚洲移动,然后向南前往非洲。这种迁徙伴随着人口的减少和基因流动的限制,这是由于个体自己广阔的领土边界,面积为300-800平方英里,从而增加了乱伦交配。

第二个瓶颈大约在1万至1.2万年前,数量进一步减少,导致在现代猎豹中观察到的地方性变异进一步消失。这是因为猎豹从北美消失了,当时最后一次冰川退缩造成了突然灭绝,导致许多大型哺乳动物,包括猎豹和美洲狮,从北美消失了。

猎豹接受来自不相关猎豹的皮肤移植,就好像它们是克隆的一样。基因组分析表明,这在一定程度上是由于一些免疫相关基因的丧失和猎豹鞭毛基因多样性的急剧丧失。这种变异非常有限,远低于在近亲繁殖的狗和猫身上观察到的变异。研究人员进行的测试表明,猎豹已经失去了90-99%的近亲繁殖哺乳动物典型的遗传变异。

研究人员得出结论,对濒临灭绝的猎豹的历史和适应的最新了解,应该有助于维持和增加猎豹现在和以前栖息地的数量。

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媒体接触
阿兰娜Orpen
公关助理
生物医学中心
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艾凡:alanna.orpen@biomedcentral.com

编辑须知

1.非洲猎豹的基因组遗产
Dobrynin等人。
基因组生物学2015
DOI 10.1186 / s13059 - 015 - 0837 - 4

文章载于杂志网站

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