在所有分类级处用斜体标注学名，便于在科学论文中快速识别

在科学期刊中，用斜体打印属和种名称是常见的做法。这不仅是历史上的，因为物种的名字传统上源自希腊语或拉丁语。重要的是，它还有助于在浏览手稿时快速识别属和种名称。然而，属级别以上的名称并不总是斜体，除非在一些期刊中对所有的科学名称都采用了这种做法。由于根据各种命名法规范处理的学名毫无例外地被当作拉丁文来处理，因此没有理由对属级以上的名称进行不同的处理，特别是当高级分类单元名称在系统和进化研究中越来越重要时，它们的斜体将有助于明确地识别正式的科学名称，将其与俗语名称区分开来。近几十年来，一些主要的真菌学和植物学杂志已经采用斜体作为所有分类群的名称，而不管其排名如何藻类的国际命名规则，真菌和植物，我们在此建议在科学期刊和教科书中广泛采用这种做法。

国际真菌分类学委员会(ICTF)是一个国际机构，致力于通过促进高科学标准的发展来促进真菌分类学的使命(Sigler和Hawksworth1987；Seifert和Rossman2010；Hawksworth2015)。ICTF偶尔会提供与真菌分类学相关的出版和科学标准的建议，以在科学界推广它们。在此，我们鼓励期刊在所有级别的正式科学名称中采用斜体字，以便于在出版物中快速和明确地识别受命名规范管理的正式科学名称，而不是有时用于区分分支的非正式名称。

一个多世纪以来，大多数科学期刊的常见做法是将科学属和物种名称斜体化，因为无论其词源如何，这些名称都是拉丁化的(ICNafp Art. 23;Turland等人。2018)。为了突出与主要手稿语言不同的语言的文本，通常使用斜体，而且经常从其他语言中提取整个句子或表达，以保留其原始内容和含义。随着时间的推移，这种做法逐渐减少，在大多数学科中，只有少数外国(主要是拉丁化的)语言表达继续使用，如de novo等，以及in vitro。由于这些表达式经常被使用，许多期刊不再使用斜体字。类似地，被视为自然化词的拉丁派生名称，如aquilegia、ascomycetes和stramenopiles，当它们不用作正式的科学名称时，也不使用斜体。因此，在处理子囊菌的文本中，所研究的群体可以使用非正式的名称子囊菌或正式的名称，门子囊菌类．这个区分和以前一样重要，门子囊菌类在类级别上被识别，为子囊菌，因此使用斜体字，加上大写字母，可以清楚地将正式名称(及其含义)与非正式名称区分开。

尽管生物科学领域的大多数出版物不再用斜体字表示外文表达，但几乎所有出版物仍然要求作者用斜体字提供属名和种名。除了是过去出版实践的残留，主要原因是更容易发现用斜体设置的物种名称。此外，将物种的名字用斜体表示，在自动拼写纠正过程中出现的错误(通常应用于文字处理程序)可以更容易地发现和纠正。例如，一个物种的绰号，如“clandestina”将自动更正为“秘密”，如果没有使用斜体，这种更正很容易在打样过程中被遗漏。由于科学分类单元名称是严格的命名规则下的正式名称，它们是分类单元的“唯一标识符”，应该以某种方式突出显示。

藻类、真菌和植物

在当前的文本中，所有级别的科学名称都是斜体的藻类、真菌和植物的国际命名规则。(ICNafp;Turland等人。2018)。本规范(及其以前的规范和规则)采用斜体字表示早期版本的规范所涵盖的所有科学名称(例如Briquet1935)，除了一九八三年和一九八八年只把家族职级及以下职级的姓名斜体字加上以外。该政策在下一版中被认为“相当不合逻辑”(Greuter et al。1994)，在《守则》及其后的四个版本中，守则所涵盖的所有级别的学名均以斜体显示，而技术术语则没有“以区别于”学名。在过去的25年里，这种做法越来越多地被各种植物学和真菌学杂志所采用。虽然准则没有设定具有约束力的标准，但考虑到这是“编辑风格和传统的问题”，它建议编辑和作者考虑遵循这一做法“为了国际一致性”(Turland et al。2018)。

栽培植物

一个单独的代码，国际栽培植物命名规则(ICNCP)主要规范种以下级别的植物名称，包括栽培品种、嵌合体和其他一些特殊类别。该法典在1952年从ICN中分离出来，ICN当时涵盖了这类植物，而当前的版本(Brickell et al。2016)只提到了一次斜体字;Rec. 8A建议在ICNCP下处理的特殊类别的名称不应以斜体显示，以避免与ICNafp管辖的分类单元混淆。

原核生物

细菌生物的命名遵循了ICNafp的规定，但在活培养物作为类型的可接受性方面存在一个重大问题，这导致了1948年首次出版的单独规则的发展(Sneath1986)。在本规范的各个版本中都遵循了在所有级别上用斜体字标注学名的做法，而在1983年和1988年的植物规范中应用的这种做法的偏差被忽略了。建议编辑和作者“最好用不同的字体，例如斜体，或其他一些方法来区分它们与文本的其余部分”国际细菌命名规则(ICNB;Lapage和Sneath1992)。《守则》已改名为《守则》原核生物国际命名规则(ICNP;帕克等人。2019)，它重复了早期版本的建议，建议在科学名称中使用斜体字，并在正文中使用了所有高级的科学名称，直到和包括类;ICNP对级别高于级别的名字不作规定。

病毒

病毒的命名法首次与细菌一起出现在联合法典中国际细菌和病毒命名规则国际细菌学命名委员会1958)，但随后分开，并自1971年起分别发表报告。国际病毒分类和命名规则(ICVCN;国际病毒分类学委员会2018)规定《正字法规则》第3.30条规定所有级别均须使用斜体。

动物学

的国际动物命名规则(ICZN)传统上规范科、属和种组中的名称，并排除科组以上的名称，并且在Rec. E.2中建议属和种组的名称放在不同的类型中，并指出“斜体是常见的”(Ride et al.。1985)。对于更高级别的名字应该如何呈现，没有任何建议，但大多数动物学家都没有用斜体。然而，有人反对在生物法典中使用斜体作为科学名称(见下文)，ICZN的后续版本在附录B.6中建议斜体“不应用于高级分类单元的名称”(国际动物命名法委员会)1999)，是目前唯一不建议或使用斜体字作为科学名称的准则，不论其排名如何。

PhyloCode

PhyloCode国际系统发育命名规则坎蒂诺和德奎罗斯2019(Hibbett et al.)是系统发育支引入的正式科学名称的规范系统，被一些系统学家使用，包括一些真菌学家(Hibbett et al。2018)。《物种分类码》Rec. 6.1A规定:“为了将科学名称与其他(例如本地)名称区分开来，所有科学名称在印刷时均应以斜体显示。”这适用于所有可能的级别。通过使用前缀“clade”或在名称后的方括号内或作为上标添加“P”，可以避免与基于生物的准则规定的学名混淆。

植物社会学

在20世纪的头几十年里，主要基于植物学命名法的原则，形成了一个给植物群落(包括地衣)正式科学名称的系统。这些名字，“句法”给出了作者的引用，现在传统上以斜体字打印，而不管排名在国际植物社会学命名规则(Theurillat et al。2020)。

BioCode

国际生物科学联合会(IUBS)和国际微生物学会联合会(IUMS)于1994年开始联合倡议制定生物法典，以规范所有生物的学名。成立了一个由所有五种以生物为基础的法典的官方代表组成的国际生物命名委员会。生物密码旨在处理未来的命名法，但同时实施受保护名称列表，以保护希望与过去保持一致的名称。在各种国际会议上产生了一系列草案并进行了讨论，最新版本于2011年出版(Greuter et al。2012)。这包括建议(Rec. 3A.1):“为了在生物的学名和共同语言的名称之间表示明确的区别，所有级别的学名应以相同的独特字体出现，最好是斜体”。

在属和种水平上，趋同进化导致形态型看起来相似，但在系统发育上是不同的，并且可以是同一科或其他科中几个不同属的成员。在这种情况下，属名作为名词使用，小写，非斜体。例如，名字镰刀菌素最初在形态上应用于具有孢子状或联丝状分生形态的种，具有phialides和多隔，镰刀形分生孢子具有明显的足状基底细胞，生于黏液中。大多数物种在形态上被分类为镰刀菌素被发现代表一个单系群体(Gräfenhan等。2011；O 'Donnell等。2013)。然而，根据系统发育分析，有许多镰刀状变种(小写，非斜体)落在外面镰刀菌素s.str。并被归入其他属(Gräfenhan等。2011)。同样，这个名字Phoma归因于与模式种一起聚在单系进化支中的物种，Phoma herbarum，而具有光瘤样形态的种是指具有philalidic的分生细胞和透明的，光滑的，无菌的分生孢子的腔菌真菌。这些生物可能属于30多个属，其中大多数聚集在Didymellaceae，或在其他家庭Dothideomycetes侯等。2020)。

高级分类单元的名称没有广泛使用斜体字可能是对过去科学出版的回忆，但也可能是由于文案编辑遵循一般的风格指南(例如Ritter2003；科学编辑委员会2006)。在分子系统发育学出现之前，由于人们对各种特征的重要性有不同的看法，更高层次的命名通常充满了不确定性。这反映在正式名称中，例如腹菌，伏革菌科,接合菌纲，它们最初分别被定义为封闭的孢子粒、壳状外观和轭状受精结构等形态特征。由于多phyly，一些以前广泛使用的较高分类单元的名称已被丢弃，这是ICNafp允许的，因为优先权不适用于科级以上。例如，以前归入门的分类群接合菌门(在此之前是课堂接合菌纲)现在分布在几个门(不形成一个单系群)和名称接合菌门不再适用于他们中的任何一个(Spatafora等。2017)。而较高级分类单元名称的正式用法，如接合菌门已停止使用，这些名称继续用于具有某些形态特征的真菌的描述性术语，如类皮质菌或胃菌，或作为常见名称，如胃菌、接合菌、卵菌、子囊菌和菌丝菌。因此，较高级的名称不常见斜体，无论它们是在非正式的上下文中使用，还是在分类学上下文中使用，尽管这样的区分是可取的，以避免混淆。

随着系统发育假说的日益完善，有可能为更高级别的类群定义突触形态，并在科级及以上级别重新定义许多名称，例如卵菌(Beakes and Thines)2017；Buaya等人。2020)。因此，对更高级别指定的一致意见开始变得可行(例如Hibbett等人)。2007；Wijayawardene等人。2020)，以稳定这些分类等级的分类范围，并促进有界定地使用它们。因此，如将卵菌命名为门卵菌门现在是一个定义明确的概念，在家族级别和以上的名字越来越好解决，并充满了进化知识的意义。同样出于这个原因，现在对待这些分类群类似于物种名称，并鼓励作者用斜体，这是有意义的，正如ICNafp (Turland et al。2018)。有了这种做法，在科学文章的文本中也更容易找到更高层次的类群，如这里的例子-术语卵菌在本文中出现了四次，而分类学术语卵菌门只出现了三次，但它的出现一眼就能认出来。这同样适用于的使用真菌(斜体和大写字母)，指的是真正真菌的单系进化支，而不是真菌(不是斜体和小写字母)，后者包括所有类真菌生物，即使没有直接关系，如真菌真菌,粘菌虫类(真正的黏菌)和前面提到的卵菌门．

国际公约F章的最新修订，涉及对真菌真菌样生物(May et al.;2019)支持将唯一标识符(即正式注册号)包括在名称之后并取代作者引用(第2条)。F.10.1)。进一步建议(Rec. F.10A)将该数字放在方括号中，并加上前缀“#”，以便它可以提供到存储库中记录的直接而稳定的超链接，例如指数Fungorum或MycoBank．在所有科学名称中使用斜体字将向编辑人员、编辑人员和排字人员提示可以插入这样的超链接，最好是通过相应存储库提供的自动化web服务。这将是提供关于分类单元的关键基本信息的一个主要好处。我们也注意到一些期刊已经接受了这种可能性(例如。MycoKeys)。

鉴于斜体字在区分高级分类单元、演化支或变种的正式学名和非正式学名方面的发展和优势(表1)：

·ICTF建议真菌学期刊和书籍的编辑指导作者在所有级别上使用斜体字;而且

·ICTF进一步建议，科学期刊和书籍的编辑至少允许在其出版的真菌学材料中使用斜体字，提交真菌论文的作者也应遵循这一做法。

我们注意到并欢迎越来越多的真菌学和分类学期刊已经采用了在所有级别上使用斜体学名的做法。这些包括IMA的真菌，真菌生物学，真菌多样性，真菌分类单元，真菌圈，真菌学研究，人，真菌分类学和进化，Lichenologist,而且Willdenowia等等。我们还高兴地注意到，最近的真菌学书籍(例如Crous等)也采用了这种做法。2019；摩尔等人。2020；参孙等人。2020)。

最后，我们希望在适当的时候，这一做法将在与所有生物有关的科学期刊和书籍中遵循，包括那些由ICZN管理的生物，与ICNafp、PhyloCode、原核生物代码、病毒代码、植物生物学代码的做法一致，并在上文讨论的生物代码中得到推荐。

不适用。

这一建议是国际真菌分类学委员会讨论的结果。感谢所有未被列为共同作者的委员会成员对本次讨论的贡献。

这篇手稿没有获得资助。

作者及隶属关系

1. 德国歌德大学生物科学系，生态进化与多样性研究所，Max-von-Laue-Str。13,60439，美因河畔法兰克福，德国

   马可你

2. 森肯堡生物多样性和气候研究中心(BiK-F)，德国美因河畔法兰克福市森肯堡村25,60325

   马可你

3. 日本农业和食品研究组织遗传资源中心，日本筑波，茨城县，305-8602

   孝青木

4. 韦斯特迪克真菌生物多样性研究所，乌普萨拉兰8,3584ct，乌得勒支，荷兰

   佩德罗·w·克罗斯

5. 泰国湄法銮大学真菌卓越研究中心，清莱，57100

   凯文·海德

6. 植物学家花园和植物博物馆，免费Universität柏林，Königin-Luise-Straße 6- 8,14195，柏林，德国

   罗伯特高年级队

7. 微生物部。累西腓，联邦伯南布哥大学，Centro de Biociências，累西腓，50.740-600，巴西

   伊莱恩Malosso

8. 维多利亚皇家植物园，墨尔本，维多利亚，3004，澳大利亚

   汤姆·w·梅

9. 伊利诺伊州自然历史调查，伊利诺伊大学，香槟，IL, 61820，美国

   安德鲁·n·米勒

10. 渥太华研究和发展中心，加拿大农业和农业食品部，加拿大安大略省渥太华卡林大道960号，邮编K1A 0C6

    斯科特·a·雷德海德

11. 莱布尼茨研究所德国微生物和细胞培养集合，Inhoffenstrasse 7B, 38124，布伦瑞克，德国

    安德烈·m·尤尔科夫

12. 自然历史博物馆生命科学部，伦敦克伦威尔路，SW7 5BD，英国

    大卫·l·霍克斯沃斯

13. 比较植物和真菌生物学，皇家植物园，邱园，萨里，TW9 3DS，英国

    大卫·l·霍克斯沃斯

14. 吉林农业大学，吉林长春130118

    大卫·l·霍克斯沃斯

贡献

MT和所有其他作者一起起草了手稿。作者们阅读并批准了最终的手稿。

相应的作者

对应到马可你．

伦理批准并同意参与

不适用。

发表同意书

不适用。

相互竞争的利益

我们宣布不存在竞争利益。

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